Kvantitativní analýza genu SMN1 a SMN2 založená na systému DHPLC
Kvantitativní analýza genu SMN1 a SMN2 založená na systému DHPLC: Zavedení nového vysoce účinného a spolehlivého screeningového testu nosiče SMA
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Proximální spinální svalová atrofie je autozomálně recesivní onemocnění s celkovou incidencí 1 z 10 000 živě narozených dětí a frekvencí přenašečů 1 z 50. Toto těžké neuromuskulární onemocnění je charakterizováno degenerací a ztrátou alfa motorických neuronů buněk předního rohu míchy, což má za následek progresivní symetrickou slabost, atrofii proximálních volních svalů a smrt dítěte.
Byly identifikovány dvě nejvíce identické kopie genu SMN, telomerická SMN (SMN1) a centromerická SMN (SMN2). Tyto dva SMN geny jsou vysoce homologní a liší se pouze pěti nukleotidovými výměnami ve svých 3' oblastech. Tyto variace nemění kódované aminokyseliny. Tyto nukleotidové rozdíly umístěné v exonech 7 a 8 umožňují odlišit gen SMN1 od genu SMN2.
Bylo hlášeno, že více než 95 % pacientů se SMA mělo homozygotní deleci genu SMN1. Detekce nepřítomnosti SMN1 proto může být užitečným nástrojem pro diagnostiku SMA. Kromě toho, kvůli vysoké incidenci SMA, vysoké frekvenci přenašečů alespoň 1 z 50, závažnosti onemocnění u pacientů a nedostatečné účinnosti léčby je testování přenašeče na deleci SMN1 důležitou otázkou v genetickém poradenství. . Vysoce homologní gen SMN2 však také opouští a brání detekci ztráty SMN1, což ztěžuje detekci testu nosiče SMA.
Zde představujeme novou, rychlou, jednoduchou a vysoce spolehlivou metodu pro detekci delece SMN1 a stanovení počtu kopií SMN1 a SMN2 pomocí denaturační vysokoúčinné kapalinové chromatografie (DHPLC). DHPLC je nová, jednoduchá, rychlá a negelová metoda, která je velmi citlivá a specifická pro detekci variací DNA. Dále popisujeme strategii multiplexní PCR pro stanovení počtu kopií genů SMN1 a SMN2, abychom se vyhnuli zkreslení způsobenému kolísáním počtu kopií genů SMN. Test používá gen CYBB vázaný na X a gen KRIT1 jako standardy pro stanovení relativní dávky genů genů SMN1 a SMN2. Ukazujeme, že tento test je schopen přesně rozlišit 2 kopie genu od 4 kopií genu a dokáže identifikovat přenašeče SMA a normální populace přesným stanovením počtu kopií SMN.
Tento projekt přispěje k aplikaci tohoto nového, rychlého a spolehlivého nástroje pro diagnostiku SMA a detekci přenašečů genů SMN1 a SMN2 pomocí systému DHPLC.
Typ studie
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
Taipei, Tchaj-wan, 100
- Nábor
- Dept of Medical Genetics;National Taiwan University Hospital
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Klinická diagnostika Spinální svalové atrofie
Kritéria vyloučení:
- nula
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Studijní židle: Yi-Ning Su, MD,PhD, National Taiwan University Hospital
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhad)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Odhad)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 9361700452
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .