Genomische Dissektion eines QTL, das das Lipidprofil beeinflusst

HINTERGRUND:

Das metabolische Syndrom ist eine häufige Erkrankung, die in der westlichen Hemisphäre ein erhebliches Risiko für koronare Herzerkrankungen und frühe Mortalität darstellt. Im Mittelpunkt der kardiovaskulären Komplikationen steht der Zusammenhang des Syndroms mit den spezifischen Anomalien der Plasma-Lipid- und Lipoproteinprofile, einschließlich erhöhter Plasmatriglyceride, verringertem HDL-Cholesterin und dem Vorherrschen dichter Lipoproteinpartikel. Auf der Suche nach der genetischen Ätiologie dieser Lipidstörung identifizierten die Forscher einen Quantitative Trait Locus (QTL) auf dem menschlichen Chromosom 7q36, der stark mit Schwankungen der Plasmalipidspiegel verbunden ist. Sie nehmen an, dass dieser QTL genetische Varianten enthält, die zu Veränderungen in den biologischen Signalwegen beitragen, die der Entstehung der Lipidstörung zugrunde liegen.

DESIGN-NARRATIVE:

Die Studie wird nach der genetischen Ursache des metabolischen Syndroms suchen, einer Lipidstörung, die ein großes Risiko für koronare Herzkrankheiten darstellt. Die Forscher haben einen quantitativen Trait Locus (QTL) auf dem menschlichen Chromosom 7q36 identifiziert, der stark mit der Variation der Plasmalipidspiegel verbunden ist. Die Forscher gehen davon aus, dass dieser QTL genetische Varianten enthält, die zu Veränderungen in den biologischen Signalwegen beitragen, die der Entstehung der Lipidstörung zugrunde liegen. Um diese Hypothese zu testen, schlagen sie einen umfassenden Ansatz vor, der etablierte Ressourcen und Fachwissen nutzt, um die Funktionssequenzvarianten innerhalb dieser QTL zu identifizieren. Insbesondere werden sie 1.) Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs) und ihren Haplotyp und ihre Bindungsungleichgewichtsstruktur in der gesamten QTL-Region identifizieren; 2.) Analysieren Sie die Assoziation informativer SNPs mit Plasmatriglyceridspiegeln, LDL-Spiegeln und Lipoproteindichtefraktionen mithilfe von Varianzkomponentenkopplungs-/Ungleichgewichtsanalysen. und 3.) Identifizieren Sie potenziell funktionelle Sequenzvarianten in assoziierten Genen oder Genomregionen mithilfe der Bayes'schen quantitativen Merkmalsnukleotidanalyse. Diese umfassende Anwendung neu verfügbarer Genomtechnologien, neuartiger statistischer Ansätze, der verfügbaren DNA- und phänotypischen Informationen sowie des hinter diesem Projekt zusammengestellten Expertenkonsortiums wird die erfolgreiche Aufklärung der genetischen Ätiologie dieser Lipidstörung und folglich die Entwicklung wirksamer Mittel dafür gewährleisten Prävention und/oder Behandlung von kardiovaskulären Komplikationen des metabolischen Syndroms.