Virulenzdeterminanten bei S-Aureus-Bakteriämie

Der Zweck dieser Studie besteht darin, den Einfluss bakterieller genetischer Eigenschaften auf das Ergebnis von Patienten mit S. aureus-Bakteriämie (SAB) genauer zu untersuchen. Die Forscher werden sich mit wichtigen Aspekten der bakteriellen Virulenz befassen und dabei enge Kooperationsbeziehungen mit Experten für Bakteriengenetik und Genomik aufbauen. Die Gesamthypothese dieser Untersuchung ist, dass unterschiedliche bakterielle Virulenzdeterminanten die Schwere einer S. aureus-Infektion beeinflussen. Die spezifische Hypothese besteht darin, dass Virulenzdeterminanten, die mit dem klinischen Ergebnis einer S. aureus-Infektion verbunden sind, in klonale Gruppen aufgeteilt werden, die durch Multilocus Sequence Typing (MLST) identifiziert werden, und durch vergleichende genetische Hybridisierung (CGH) im Genom lokalisiert werden können. Die Forscher haben die folgenden Ziele festgelegt, um diese Hypothese zu verfolgen. Spezifisches Ziel 1: Definieren Sie die Alleldiversität von S. aureus-Blutstromisolaten mithilfe von MSLT. Allelprofile unter den 1000 Isolaten werden mit dem Programm BURST (Based Upon Related Sequence Type) verglichen und die Verwandtschaft der Abstammungslinien in der Gesamtsammlung wird definiert. Spezifisches Ziel 2: Definieren Sie die genomische Vielfalt von S. aureus-Blutstromisolaten mithilfe von CGH. Anhand der MLST-Ergebnisse wird eine Untergruppe von 200 Isolaten für weitere Untersuchungen ausgewählt. Diese etwa 200 Isolate bilden eine einzigartige Sammlung, die im Folgenden als SAGA-Sammlung (S. aureus Genomic Analysis) bezeichnet wird. Die genomische Diversität der SAGA-Untergruppe wird mithilfe von CGH definiert. Spezifisches Ziel 3: Korrelation von MLST- und CGH-Ergebnissen, MLST und klinischem Ergebnis sowie CGH und klinischem Ergebnis und Bereitstellung von SAGA-Isolaten für die wissenschaftliche Gemeinschaft. In diesem spezifischen Ziel wird die Unterscheidungsfähigkeit von MLST und CGH unter den SAGA-Untergruppenisolaten verglichen, die beiden Tests unterzogen werden. Der Zusammenhang zwischen bakterieller Klonalität und klinischem Ergebnis wird anhand von 1000 S. aureus-Isolaten untersucht, die am Duke University Medical Center von Erwachsenen gesammelt wurden, die S. aureus-Infektionen hatten und sich einer MLST unterzogen. Der Zusammenhang zwischen dem klinischen Ergebnis und dem Vorhandensein oder Fehlen von Virulenzfaktoren und Pathogenitätsinseln im S. aureus-Genom wird auch bei den 200 SAGA-Untergruppenisolaten berücksichtigt, die einer CGH unterzogen werden. Zu den Ergebnissen dieser Studie gehört ein besseres Verständnis der genetischen Vielfalt bei S. aureus und der Rolle dieser genetischen Vielfalt bei der Bestimmung der Schwere von durch S. aureus verursachten Infektionen. Der volle Wert des aktuellen Vorschlags beinhaltet auch den potenziellen zukünftigen Nutzen für die gesamte Forschungsgemeinschaft, wenn Zusammenhänge zwischen dem Genotyp des Krankheitserregers und dem klinischen Ergebnis definiert werden können, die nur mithilfe einer so großen und klinisch gut charakterisierten Sammlung von Isolaten identifiziert werden können. Um diese potenziellen nachgelagerten Dividenden zu verstärken, besteht das Endziel des spezifischen Ziels 3 darin, der wissenschaftlichen Gemeinschaft SAGA-Untergruppenisolate, entsprechende MLST-Typen und CGH-Profile über das vom Network for Antimicrobial Resistance in S. aureus (NARSA) verwaltete Repository zur Verfügung zu stellen ). Die langfristigen Ziele dieses Projekts bestehen darin, (1) bakterielle Gene zu identifizieren, die zur Schwere der Infektion in Isolaten einer großen Kohorte von Patienten mit SAB beitragen; und (2) letztendlich diese Gene nutzen, um neue Interventionen zur Kontrolle der Pathogenese von S. aureus zu identifizieren, indem Gene untersucht werden, die die Virulenz dieses neu auftretenden Pathogens steuern. In dieser Studie werden kulturbestätigte SAB-Nasenträgerisolate und/oder Blutbahn-Bakterienisolate verwendet, die zuvor von 1000 stationären Erwachsenen am Duke University Medical Center gesammelt wurden.