Mikrobiom und genetische Analyse von familiärer CED
Mikrobiom und genetische Analyse von Familienmitgliedern mit entzündlichen Darmerkrankungen
Chronisch entzündliche Darmerkrankung (IBD) ist eine chronisch entzündliche Erkrankung des Magen-Darm-Trakts.
In Bezug auf ihre Pathogenese wurden zahlreiche Studien durchgeführt, um die komplexe Assoziation zwischen genetischen und umweltbedingten Faktoren aufzudecken.
In Korea nimmt die Inzidenz von IBD rapide zu, aber genetische Studien, die ausschließlich Patienten mit koreanischer Abstammung umfassten, waren nicht ausreichend.
Daher planten die Forscher, genetische und fäkale mikrobielle Analysen für die 60 Personen aus 30 koreanischen IBD-Familien durchzuführen, um die Pathogenese von IBD herauszufinden.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Detaillierte Beschreibung
Unter der Hypothese, dass bei Patienten mit familiärer CED mehr Risikovarianten beobachtet werden als bei CED-Patienten ohne andere betroffene Familienmitglieder, entwarfen die Forscher genetische und fäkale Mikrobiomanalysen für 60 Patienten aus 30 Familien.
Nach der Extraktion der DNA aus Blutproben wird eine Gesamtgenomsequenzierung durchgeführt und die Daten werden mit den zuvor gemeldeten Abweichungen verglichen. Neuartige Varianzen oder das Auftreten spezifischer Varianzen werden gemessen.
Ein genomweites Einzelnukleotid-Polymorphismus-Array unter Verwendung von Immunochip wird durchgeführt, um gemeinsame genetische Varianten zu suchen und den genetischen Risiko-Score von IBD zu berechnen.
In dieser Studie ist das fäkale Mikrobiom ein Ersatzmarker für den Umweltaspekt der Pathogenese von CED. Die Ermittler gingen davon aus, dass Familienmitglieder einen ähnlichen Lebensstil haben, daher nehmen wir an, dass ihre fäkale mikrobielle Zusammensetzung gleich ist.
Beim Vergleich genetischer und mikrobieller Daten insgesamt mit den Daten von nicht betroffenen Familienmitgliedern (gesunde interne Kontrolle) erwarten die Forscher, den genetischen und umweltbedingten Aspekt der IBD-Pathogenese zu erklären.
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Kontakte und Standorte
Studienorte
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Seoul, Korea, Republik von, 180-702
- Kyung Hee University Medical Center
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Kind
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Die Forscher planen, Familienmitglieder mit IBD (Morbus Crohn oder Colitis ulcerosa) zu untersuchen.
Sie sind alle koreanischer Abstammung und Studienkandidaten sind zwei Patienten aus jeweils 30 Familien. Als gesunde interne Kontrolle wird auch ein anderes Familienmitglied ohne IBD-Vorgeschichte aufgenommen.
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- 60 Personen aus 30 Familien mit Morbus Crohn oder Colitis ulcerosa.
- Nicht betroffen 30 Individuen aus jeder Familie als gesunde interne Kontrolle.
Ausschlusskriterien:
- Person, die in den letzten 4 Wochen Antibiotika oder Probiotika verwendet hat.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Seltene genetische Varianten entzündlicher Darmerkrankungen
Zeitfenster: Drei Monate nach der Probenentnahme
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Ergebnisse der Gesamtgenomsequenzierung von Blutproben von Studienteilnehmern.
Geplant, mit den zuvor gemeldeten Abweichungen zu vergleichen.
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Drei Monate nach der Probenentnahme
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Häufige genetische Varianten entzündlicher Darmerkrankungen
Zeitfenster: Drei Monate nach der Probenentnahme
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Ergebnisse aus einem genomweiten Einzelnukleotid-Polymorphismus-Array von Blutproben von Studienteilnehmern. Geplant, mit den zuvor gemeldeten Abweichungen zu vergleichen. |
Drei Monate nach der Probenentnahme
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Genetischer Risiko-Score für entzündliche Darmerkrankungen
Zeitfenster: Drei Monate nach der Probenentnahme
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Ergebnisse aus einem genomweiten Einzelnukleotid-Polymorphismus-Array von Blutproben von Studienteilnehmern. Geplant, mit den zuvor gemeldeten Abweichungen zu vergleichen. |
Drei Monate nach der Probenentnahme
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Zusammensetzung des fäkalen Mikrobioms der einzelnen Studienteilnehmer
Zeitfenster: Drei Monate nach der Probenentnahme
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Mikrobielle Diversität, gemessen anhand von 16S-RNA-Sequenzierungsdaten von fäkalen Mikrobiomen.
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Drei Monate nach der Probenentnahme
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Mitarbeiter und Ermittler
Ermittler
- Hauptermittler: Hyo Jong Kim, M.D. PhD, Kyung Hee University Hospital
- Hauptermittler: Chang Kyun Lee, M.D. PhD, Kyung Hee University Hospital
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
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- Jostins L, Ripke S, Weersma RK, Duerr RH, McGovern DP, Hui KY, Lee JC, Schumm LP, Sharma Y, Anderson CA, Essers J, Mitrovic M, Ning K, Cleynen I, Theatre E, Spain SL, Raychaudhuri S, Goyette P, Wei Z, Abraham C, Achkar JP, Ahmad T, Amininejad L, Ananthakrishnan AN, Andersen V, Andrews JM, Baidoo L, Balschun T, Bampton PA, Bitton A, Boucher G, Brand S, Buning C, Cohain A, Cichon S, D'Amato M, De Jong D, Devaney KL, Dubinsky M, Edwards C, Ellinghaus D, Ferguson LR, Franchimont D, Fransen K, Gearry R, Georges M, Gieger C, Glas J, Haritunians T, Hart A, Hawkey C, Hedl M, Hu X, Karlsen TH, Kupcinskas L, Kugathasan S, Latiano A, Laukens D, Lawrance IC, Lees CW, Louis E, Mahy G, Mansfield J, Morgan AR, Mowat C, Newman W, Palmieri O, Ponsioen CY, Potocnik U, Prescott NJ, Regueiro M, Rotter JI, Russell RK, Sanderson JD, Sans M, Satsangi J, Schreiber S, Simms LA, Sventoraityte J, Targan SR, Taylor KD, Tremelling M, Verspaget HW, De Vos M, Wijmenga C, Wilson DC, Winkelmann J, Xavier RJ, Zeissig S, Zhang B, Zhang CK, Zhao H; International IBD Genetics Consortium (IIBDGC); Silverberg MS, Annese V, Hakonarson H, Brant SR, Radford-Smith G, Mathew CG, Rioux JD, Schadt EE, Daly MJ, Franke A, Parkes M, Vermeire S, Barrett JC, Cho JH. Host-microbe interactions have shaped the genetic architecture of inflammatory bowel disease. Nature. 2012 Nov 1;491(7422):119-24. doi: 10.1038/nature11582.
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- Stittrich AB, Ashworth J, Shi M, Robinson M, Mauldin D, Brunkow ME, Biswas S, Kim JM, Kwon KS, Jung JU, Galas D, Serikawa K, Duerr RH, Guthery SL, Peschon J, Hood L, Roach JC, Glusman G. Genomic architecture of inflammatory bowel disease in five families with multiple affected individuals. Hum Genome Var. 2016 Jan 7;3:15060. doi: 10.1038/hgv.2015.60. eCollection 2016.
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
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Andere Studien-ID-Nummern
- Familial_IBD_Microbiome
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Beschreibung des IPD-Plans
Nach der Veröffentlichung der Ergebnisse wird jede Anfrage zur gemeinsamen Nutzung von Daten durch andere Forscher positiv geprüft.
Aber das Ausmaß des Teilens ist noch nicht entschieden.
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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Klinische Studien zur Entzündliche Darmerkrankungen
-
Arkansas Children's Hospital Research InstituteEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development...BeendetSIRS (Systemic Inflammatory Response Syndrome)Vereinigte Staaten
-
University of ArkansasBeendetPädiatrische Patienten mit SIRS (Systemic Inflammatory Response Syndrome)Vereinigte Staaten