microRNA-Profil bei Gebärmutterhalskrebs im Frühstadium

Das Zervixkarzinom (CC) ist eine der häufigsten Krebsarten bei Frauen aus Schwellenländern; In Mexiko hat CC die zweithöchste Inzidenz- und Sterblichkeitsrate. Mehrere Studien haben gezeigt, dass der wichtigste prognostische Faktor Lymphknotenmetastasen bei CC-Patienten im Frühstadium vor radikaler Hysterektomie (RH) mit bilateraler Becken-Lymphadenektomie (BPL) sind, bei denen positive Lymphknotenmetastasen das Gesamtüberleben (OS) von 80 % verringern. auf 53 % nach 5 Jahren.

MicroRNAs (miRNAs) sind einzelsträngige RNAs, die etwa 21-23 Nukleotide umfassen. miRNAs regulieren die Genexpression durch die Hemmung posttranskriptioneller Ereignisse und induzieren in einigen Fällen den Abbau ihrer Ziel-Messenger-RNA. Bei Krebs können miRNAs je nach Funktion ihrer Zielgene sowohl als Onkogene als auch als Tumorsuppressorgene fungieren.

Formalinfixierte, in Paraffin eingebettete (FFPE) Gewebeblöcke von CC-Patienten, die zwischen Januar 2006 und Dezember 2013 in der Abteilung für Onkologische Gynäkologie des National Cancer Institute (Mexiko-Stadt) diagnostiziert wurden, wurden mit der Absicht analysiert, diejenigen mit einer bestätigten histopathologischen Diagnose von auszuwählen Stadien IB1 oder IIA1 CC, behandelt mit RH und BPL. Gesamt-RNA wurde aus 5 Schnitten (10 µm) für ausgewählte Gewebe extrahiert. Für die klinische Korrelationsanalyse wurden die Proben in 2 Gruppen eingeteilt: 1 mit positiver okkulter Lymphknotenmetastasen-Pathologie und 1 ohne Lymphknotenmetastasen-Pathologie. Für beide Gruppen wurden die Patienten hinsichtlich Alter, Tumorgröße und Vorliegen einer lymphovaskulären Permeation abgeglichen.

Die Identifizierung globaler miRNA-Profile wurde unter Verwendung des GeneChip miRNA 3.0 Array (Affymetrix, Cat. 902018) nach Herstellerangaben. Das Mikroarray wurde mit der Affymetrix Fluidics Station 450 hybridisiert und gewaschen und mit dem Affymetrix GeneChip Scanner 3000 gescannt. Nach der Verarbeitung der Bilder wurden die Rohdaten verarbeitet. Um das miRNA-Profil zu erhalten, wurden die verarbeiteten Proben in 2 Gruppen eingeteilt, Proben mit Lymphknotenmetastasen und Proben ohne Lymphknotenmetastasen. Differentiell exprimierte miRNAs wurden mit einem Cutoff-Wert von p < 0,01 und einem Fold Change (FC) von 1,5 identifiziert. miRNAs, die diese Kriterien erfüllten, wurden als überexprimiert oder unterexprimiert klassifiziert.