Disección genómica de un QTL que afecta el perfil lipídico

FONDO:

El síndrome metabólico es un trastorno común que presenta un riesgo significativo importante de enfermedad cardíaca coronaria y mortalidad temprana en el hemisferio occidental. Un elemento central de sus complicaciones cardiovasculares es la asociación del síndrome con anomalías específicas en los perfiles de lípidos y lipoproteínas plasmáticos, incluido el aumento de los triglicéridos plasmáticos, la disminución del colesterol HDL y el predominio de partículas de lipoproteínas densas. En la búsqueda de la etiología genética de este trastorno de los lípidos, los investigadores identificaron un locus de rasgos cuantitativos (QTL) en el cromosoma humano 7q36 fuertemente relacionado con la variación en los niveles de lípidos en plasma. Plantean la hipótesis de que este QTL contiene variantes genéticas que contribuyen a las alteraciones en las vías biológicas que subyacen a la génesis del trastorno de los lípidos.

NARRATIVA DE DISEÑO:

El estudio buscará la causa genética del síndrome metabólico, un trastorno de los lípidos que presenta un riesgo importante de enfermedad coronaria. Los investigadores han identificado un locus de rasgos cuantitativos (QTL) en el cromosoma humano 7q36 fuertemente relacionado con la variación en los niveles de lípidos en plasma. Los investigadores plantean la hipótesis de que este QTL contiene variantes genéticas que contribuyen a las alteraciones en las vías biológicas que subyacen a la génesis del trastorno de los lípidos. Para probar esta hipótesis, proponen un enfoque integral que utiliza recursos y experiencia establecidos para identificar las variantes de secuencia funcional dentro de este QTL. Específicamente, 1.) identificarán polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) y su haplotipo y estructura de desequilibrio de ligamiento en toda la región QTL; 2.) Analizar la asociación de los SNP informativos con los niveles de triglicéridos en plasma, los niveles de LDL y las fracciones de densidad de lipoproteínas utilizando análisis de enlace/desequilibrio de componentes de varianza; y 3.) Identificar variantes de secuencias potencialmente funcionales en genes asociados o regiones genómicas utilizando análisis de nucleótidos de rasgos cuantitativos bayesianos. Esta aplicación integral de tecnologías genómicas recientemente disponibles, enfoques estadísticos novedosos, la información fenotípica y de ADN disponible, y el consorcio de expertos reunidos detrás de este proyecto garantizarán la elucidación exitosa de la etiología genética de este trastorno lipídico y, en consecuencia, el desarrollo de medios efectivos para prevención y/o tratamiento de las complicaciones cardiovasculares del síndrome metabólico.