Secuenciación de exoma completo y secuenciación de genoma completo para hidropesía fetal/neonatal no inmune
21 de noviembre de 2023 actualizado por: Huda Al-Kouatly, Thomas Jefferson University
Breve resumen: La hidropesía fetal no inmune (NIHF, por sus siglas en inglés) es una afección potencialmente fatal caracterizada por la acumulación anormal de líquido en dos o más compartimentos fetales.
Numerosas etiologías pueden conducir a NIHF, y la causa subyacente a menudo no está clara (1).
El estándar actual de pruebas de diagnóstico genético incluye un cariotipo fetal y un microarreglo cromosómico (CMA), con la opción de realizar pruebas de un solo gen en amniocitos recolectados por amniocentesis (2).
Un gran subgrupo de causas de NIHF incluye trastornos de un solo gen que no se diagnostican con el estudio genético estándar para la hidropesía.
Actualmente, casi 1 de cada 5 casos de NIHF se define como idiopático, lo que significa que no hay una etiología identificada (2).
Los investigadores creen que esto se debe a que las causas de NIHF no se investigan por completo, específicamente los trastornos de un solo gen.
Nuestro estudio de investigación tiene como objetivo aumentar el rendimiento diagnóstico mediante la secuenciación del exoma completo (WES) y la secuenciación del genoma completo (WGS) en casos de NIHF prenatales y neonatales cuando las pruebas genéticas estándar son negativas, identificando genes nuevos y conocidos, proporcionando así información vital a las familias con respecto a el diagnóstico específico y el riesgo para futuros embarazos.
Los investigadores planean realizar WES como prueba de diagnóstico inicial.
Si WES es negativo, entonces los investigadores procederán a realizar WGS.
Descripción general del estudio
Estado
Reclutamiento
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
Este es un diseño de estudio de cohorte prospectivo para fetos o recién nacidos afectados con NIHF.
Se identificarán los tríos madre-padre-feto de embarazos complicados por hidropesía fetal idiopática no inmune.
Estas pacientes serán asesoradas por un especialista en Medicina Materno Fetal como sería la rutina.
Como parte del estudio de rutina, se recomendará la amniocentesis para cariotipo, CMA y un estudio infeccioso.
La amniocentesis será realizada por el especialista en Medicina Materno Fetal de la institución referente.
Al paciente también se le ofrecerá asesoramiento genético (de rutina).
Se ofrecerá inscripción a los sujetos cuando se cumplan los criterios de inclusión.
Después de la inscripción, se recolectarán las siguientes muestras: (1) sangre materna (2) sangre paterna, (3) ADN fetal aislado de amniocitos (4) sangre neonatal cuando la remisión se realiza después del nacimiento.
Los resultados de la WES se informarán al asesor genético dedicado al estudio.
El asesor genético se comunicará con los padres y les informará sobre los resultados, ya sean positivos o negativos.
El resultado también se comunicará al proveedor principal de MFM o al pediatra del paciente y el proveedor principal realizará las derivaciones correspondientes a los especialistas en genética pediátrica.
En los casos en los que no se identifique ningún trastorno genético, la muestra se almacenará y posteriormente se realizará la secuenciación del genoma completo.
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Estimado)
55
Contactos y Ubicaciones
Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.
Estudio Contacto
- Nombre: Huda B Al-Kouatly, MD
- Número de teléfono: 215-955-9200
- Correo electrónico: Huda.Al-kouatly@jefferson.edu
Copia de seguridad de contactos de estudio
- Nombre: Stephanie M Rice, MS
- Correo electrónico: stephanie.rice@jefferson.edu
Ubicaciones de estudio
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Estados Unidos, 19107
- Reclutamiento
- Thomas Jefferson University
-
-
Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
14 años a 53 años (Niño, Adulto)
Acepta Voluntarios Saludables
No
Método de muestreo
Muestra no probabilística
Población de estudio
Los pacientes serán reclutados de médicos MFM, pediatras y neonatólogos.
Descripción
Se aplicarán los siguientes criterios de inclusión:
- Hidropesía fetal identificada en cualquier momento del embarazo después del primer trimestre
- Los padres planean proceder con la amniocentesis como un examen de rutina para la hidropesía.
- Ambos padres están disponibles para la recolección de muestras de sangre.
- CMA normal y cariotipo normal si se realiza
- Estudio negativo para parvovirus B19, citomegalovirus, toxoplasmosis y sífilis
- Estudio de hemorragia fetomaterna negativo como causa de hidropesía Para casos de hidropesía neonatal, no se requerirán los criterios para pruebas prenatales invasivas ya que una muestra de sangre posnatal del bebé hidrópico será la fuente del ADN probando.
Se aplicarán los siguientes criterios de exclusión:
- El microarray fue anormal o el cariotipo fue anormal
- Hidropesía causada por infección congénita
- La hemorragia fetomaterna fue una etiología documentada de hidropesía
- El ADN de los padres no se puede obtener para ninguno de los padres.
- Se utilizaron óvulos de donantes o esperma de donantes para la concepción
- Feto/bebé diagnosticado con enfermedad de almacenamiento lisosomal
- Mujer embarazada o padre del bebé menor de 16 años
- Se diagnosticó hidropesía concomitantemente con muerte fetal intrauterina
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Grupo
- Perspectivas temporales: Futuro
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
|---|---|
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Fetos
ADN obtenido de muestras de líquido amniótico
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La secuenciación del exoma completo (WES) proporciona información más detallada a través de una mayor resolución, identificando cambios de un solo par de bases y pequeñas inserciones y eliminaciones.
WES realiza la secuenciación de los exones que codifican proteínas, que se encuentran en el 1-2 % del genoma, pero constituyen más del 85 % de todas las mutaciones patogénicas conocidas.
La secuenciación del genoma completo (WGS) ha surgido en los últimos años como una herramienta de diagnóstico que secuencia el genoma completo y puede detectar inserciones o eliminaciones de bases, variantes estructurales y variaciones intrónicas de un solo nucleótido.
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Neonatos
ADN obtenido de muestras de sangre neonatal
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La secuenciación del exoma completo (WES) proporciona información más detallada a través de una mayor resolución, identificando cambios de un solo par de bases y pequeñas inserciones y eliminaciones.
WES realiza la secuenciación de los exones que codifican proteínas, que se encuentran en el 1-2 % del genoma, pero constituyen más del 85 % de todas las mutaciones patogénicas conocidas.
La secuenciación del genoma completo (WGS) ha surgido en los últimos años como una herramienta de diagnóstico que secuencia el genoma completo y puede detectar inserciones o eliminaciones de bases, variantes estructurales y variaciones intrónicas de un solo nucleótido.
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Periodo de tiempo |
|---|---|
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Identificar trastornos conocidos de un solo gen que no serían detectados por microarrays como causa de hidropesía fetal no inmune mediante la secuenciación del exoma completo (WES)
Periodo de tiempo: 5 años
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5 años
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Identificar nuevos trastornos genéticos asociados con hidropesía no inmune
Periodo de tiempo: 5 años
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5 años
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Periodo de tiempo |
|---|---|
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Evaluar el valor incremental de la secuenciación del genoma completo (WGS) en la evaluación de hidrops fetal cuando WES es negativo
Periodo de tiempo: 5 años
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5 años
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Asesorar mejor a los padres sobre la etiología de la hidropesía, especialmente si desean un embarazo posterior.
Periodo de tiempo: 5 años
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5 años
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Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Huda B Al-Kouatly, MD, Thomas Jefferson University
Publicaciones y enlaces útiles
La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.
Publicaciones Generales
- Whybra C, Mengel E, Russo A, Bahlmann F, Kampmann C, Beck M, Eich E, Mildenberger E. Lysosomal storage disorder in non-immunological hydrops fetalis (NIHF): more common than assumed? Report of four cases with transient NIHF and a review of the literature. Orphanet J Rare Dis. 2012 Nov 8;7:86. doi: 10.1186/1750-1172-7-86.
- Lionel AC, Costain G, Monfared N, Walker S, Reuter MS, Hosseini SM, Thiruvahindrapuram B, Merico D, Jobling R, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Sung WWL, Wang Z, Bikangaga P, Boelman C, Carter MT, Cordeiro D, Cytrynbaum C, Dell SD, Dhir P, Dowling JJ, Heon E, Hewson S, Hiraki L, Inbar-Feigenberg M, Klatt R, Kronick J, Laxer RM, Licht C, MacDonald H, Mercimek-Andrews S, Mendoza-Londono R, Piscione T, Schneider R, Schulze A, Silverman E, Siriwardena K, Snead OC, Sondheimer N, Sutherland J, Vincent A, Wasserman JD, Weksberg R, Shuman C, Carew C, Szego MJ, Hayeems RZ, Basran R, Stavropoulos DJ, Ray PN, Bowdin S, Meyn MS, Cohn RD, Scherer SW, Marshall CR. Improved diagnostic yield compared with targeted gene sequencing panels suggests a role for whole-genome sequencing as a first-tier genetic test. Genet Med. 2018 Apr;20(4):435-443. doi: 10.1038/gim.2017.119. Epub 2017 Aug 3.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Raymond M, Critchlow E, Rice SM, Wodoslawsky S, Berger SI, Hegde M, Empey PE, Al-Kouatly HB. Fetal pharmacogenomics: A promising addition to complex neonatal care. Mol Genet Metab. 2022 Sep-Oct;137(1-2):140-145. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.08.002. Epub 2022 Aug 12.
- Society for Maternal-Fetal Medicine (SMFM); Norton ME, Chauhan SP, Dashe JS. Society for maternal-fetal medicine (SMFM) clinical guideline #7: nonimmune hydrops fetalis. Am J Obstet Gynecol. 2015 Feb;212(2):127-39. doi: 10.1016/j.ajog.2014.12.018. Epub 2014 Dec 31.
Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
15 de enero de 2019
Finalización primaria (Estimado)
30 de junio de 2024
Finalización del estudio (Estimado)
31 de diciembre de 2024
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
9 de abril de 2019
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
9 de abril de 2019
Publicado por primera vez (Actual)
11 de abril de 2019
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Estimado)
22 de noviembre de 2023
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
21 de noviembre de 2023
Última verificación
1 de noviembre de 2023
Más información
Términos relacionados con este estudio
Términos MeSH relevantes adicionales
- Enfermedades del sistema inmunológico
- Enfermedades hematológicas
- Enfermedades Fetales
- Complicaciones del embarazo
- Hemoglobinopatías
- Eritroblastosis Fetal
- alfa-talasemia
- Talasemia
- Enfermedades urogenitales femeninas y complicaciones del embarazo
- Enfermedades urogenitales
- Edema
- Enfermedades Genéticas Congénitas
- Hidropesía fetal
Otros números de identificación del estudio
- IRB18D.728
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
SÍ
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
No
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
No
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .
Ensayos clínicos sobre Secuenciación del exoma completo
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Tianjin Medical University Second HospitalDesconocido
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Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine InstituteReclutamiento