Deux cancers, un gène. Pourquoi certaines personnes dans les familles développent un mélanome ou un cancer du pancréas, tandis que d'autres encore ne développent jamais de cancer. (TCOG)

Différences génomiques et de facteurs de risque entre les membres de la famille qui partagent des mutations du gène CDKN2A prédisposant identiques, avec des phénotypes différents ; découvriront des modèles de tumorigenèse, de spécificité tissulaire, d'interactions gène-gène et gène-environnement.

Des génotypes de gènes modificateurs potentiels seront identifiés dans plusieurs familles qui présentent le cancer du pancréas et le mélanome et qui sont connues pour porter des mutations germinales CDKN2A. Les chercheurs détermineront ensuite les variants germinaux communs chez les porteurs potentiels de mutants CDKN2A à l'aide d'un séquençage ciblé et rechercheront des modificateurs génétiques en effectuant Illumina HumanOmni5Exome-4 Beadchip avec Infinium LCG sur l'ADN germinal. Le microréseau Illumina contient plus de 4,5 millions de marqueurs, dont 528 675 sont exoniques, et comprend plus de 2,6 millions de SNP qui seraient considérés comme communs. Les enquêteurs analyseront les données génétiques et sur les facteurs de risque recueillies dans le cadre des sondages remplis par les participants en utilisant à la fois des méthodes de génétique statistique et d'apprentissage automatique. Comme moyen d'extension et de validation potentielle, les chercheurs étudieront ensuite de la même manière jusqu'à 200 membres porteurs de mutations dans 39 autres parents porteurs de la mutation CDKN2A.