Identification des cancers de la prostate cliniquement insignifiants ou significatifs avec la plateforme miR Scientific Sentinel™

La plateforme miR Scientific Sentinel® Prostate Cancer Classifier Platform (Test Sentinel® PCC4) est un nouveau test moléculaire qui interroge 442 petits ARN non codants extraits des exosomes urinaires. Le test Sentinel® PCC4 fournit aux urologues une indication précoce, non invasive et précise de l'état de la maladie chez les hommes présentant une suspicion clinique de cancer de la prostate. Le test fournit une classification initiale de l'état de la maladie comme étant soit aucune preuve moléculaire de cancer de la prostate (NMEPC), soit une preuve moléculaire (MEPC) de risque faible, intermédiaire ou élevé de cancer de la prostate agressif. La norme actuelle de soins (SOC) évalue le risque de cancer de la prostate sur la base d'informations qui incluent un toucher rectal suspect et un taux de PSA sérique « élevé » (généralement supérieur à 3 ng/mL selon les directives actuelles du NCCN, mais dans la pratique clinique, il peut souvent être inférieure ou supérieure à 3 ng/mL, selon la pratique). La sensibilité (44 %) et la spécificité (68 %) estimées de la SOC actuelle signifient qu'une partie importante des cas de cancer de la prostate ne sont pas identifiés et que de nombreuses biopsies avec les comorbidités qui en résultent sont inutiles.

Les patients qui s'inscrivent à cette étude recevront le SOC actuel et subiront une biopsie à l'aiguille de fusion guidée par TRUS ou IRM. Les biopsies seront lues par des pathologistes associés à chaque établissement clinique participant dans lequel la biopsie a été effectuée. Le score de Gleason, la stadification de la tumeur et l'emplacement anatomique de chaque noyau positif seront collectés sur chaque site, et des échantillons d'urine à code-barres seront envoyés par messagerie pendant la nuit aux laboratoires miR Scientific pour analyse du test Sentinel® PCC4. Afin de minimiser le potentiel de variabilité inter-observateurs, la pathologie des biopsies à l'aiguille centrale pour chaque patient sera également examinée par un pathologiste central indépendant, non associé à miR Scientific.

Après avoir évalué la pathologie, la contribution anatomique et les données cliniques supplémentaires (en particulier les niveaux d'ERD et de PSA sérique) qui informent l'évaluation du groupe de grades et l'évaluation des risques du NCCN, l'évaluation finale du groupe de risque pour l'objectif principal de l'étude #1 et l'objectif principal de l'étude #2 sera déterminée par le pathologiste. La détermination finale du groupe de risque pour chaque patient sera utilisée individuellement pour représenter le statut de risque fourni par la SOC actuelle à des fins de comparaison avec les classifications moléculaires fournies par le test Sentinel® PCC4.

La performance du test Sentinel® PCC4 pour classer l'état pathologique d'un futur patient (avec un véritable état pathologique inconnu) soit comme aucune preuve moléculaire de cancer de la prostate, soit, pour les patients présentant des preuves moléculaires de cancer de la prostate, comme ayant un risque faible, intermédiaire -le risque ou le risque élevé de cancer de la prostate agressif sera établi pour les deux objectifs principaux de l'étude.

Objectif principal de l'étude n° 1 : Établir les caractéristiques de performance de la plate-forme de classification du cancer de la prostate Sentinel® (test Sentinel® PCC4) en utilisant le classement pathologique (groupement de grades basé sur le score de Gleason tel que proposé par Epstein et ses collègues en 2013) comme base comparative pour l'évaluation la santé de la prostate des hommes âgés de 45 à 75 ans présentant une suspicion de cancer de la prostate.

Les caractéristiques de performance du test Sentinel® PCC4 telles que décrites dans les objectifs principaux de l'étude seront évaluées par rapport au rapport de biopsie au trocart à l'aide des classificateurs de risque de pathologie Gleason score (Grade Group) où GG1 est indicatif ou à faible risque, GG2 comme risque intermédiaire et GG3-5 comme risque élevé de cancer agressif de la prostate. La sensibilité, la spécificité, les valeurs prédictives positives et négatives du test Sentinel® PCC4 pour la classification des risques en concordance avec l'évaluation du risque GG seront établies.

Objectif principal de l'étude n° 2 : Établir les caractéristiques de performance du test Sentinel® PCC4 lors de l'utilisation des critères d'évaluation des risques modifiés récemment recommandés par le National Comprehensive Cancer Network (NCCN) comme base pour évaluer la santé de la prostate des hommes âgés de 45 à 75 ans présentant une suspicion de cancer de la prostate.

En plus du grade pathologique de la tumeur, l'évaluation des risques du NCCN intègre des mesures cliniques supplémentaires associées à la progression tumorale, y compris le nombre de noyaux positifs, le pourcentage d'atteinte tumorale par noyau, le stade de la tumeur (emplacement anatomique des noyaux positifs), le PSA sérique et la densité de PSA . Les mêmes données d'expression moléculaire du test Sentine® PCC4 seront utilisées pour évaluer les deux objectifs principaux pour chaque patient.

Méthodologie statistique : Cette étude recrutera des patients visitant des cliniques d'urologie pour un bilan clinique initial basé sur toute suspicion clinique de cancer de la prostate. L'étude évaluera les propriétés du test Sentinel® PCC4 qui est basé sur l'utilisation d'un système de classification exclusif pour identifier les patients sans preuve moléculaire de cancer de la prostate et pour classer initialement le risque des patients atteints d'un cancer de la prostate.

Pour une comparaison à deux groupes donnée, l'algorithme de classification exclusif contrôle la sensibilité pour un patient dont le véritable état pathologique est inconnu ou au-dessus d'un niveau prédéfini, noté 1-α ; par exemple, la valeur supposée dans ce plan est α=0,05. Notez que la valeur de α représente le taux de faux négatifs du test pour la comparaison à deux groupes donnée.

L'étiquetage nominal initial des groupes cliniques sera effectué séparément lors de l'utilisation du groupe de grade Gleason (objectif principal de l'étude n° 1) et des définitions récentes du NCCN (objectif principal de l'étude n° 2), comme décrit en détail ci-dessus. La validation croisée sera utilisée dans l'ensemble de données de formation pour déterminer les seuils de classification pour une comparaison à deux groupes donnée dans le test Sentinel® PCC4. Une description générale de cette procédure est la suivante. Pour chaque participant à l'ensemble de données de formation (participant actuel), une classification en deux groupes pour ce participant actuel sera déterminée en fonction des membres restants de l'ensemble de données de formation en utilisant uniquement la séquence sncRNA du participant actuel ; l'exactitude de cette détermination sera évaluée en comparant la classification de groupe déterminée à l'étiquette réelle donnée au participant actuel (soit le groupe de niveau ou le groupe NCCN). Autrement dit, l'étiquette d'état de la maladie du participant actuel dans l'ensemble de données de formation sera masquée, imitant ainsi le cadre de classification d'un futur patient. Cette procédure est ensuite répétée séparément pour chaque sujet dans l'ensemble de données d'apprentissage. Les paramètres de réglage et la limite de coupure utilisés pour chacune des classifications en deux groupes comprenant le test Sentinel® PCC4 sont ensuite calculés de sorte que la sensibilité empirique sur les participants dans l'ensemble de données de formation soit d'au moins 1-α.

Avec ces seuils et règles de classification déterminés à l'aide de l'ensemble de données de formation pour le test Sentinel® PCC4, les classifications Sentinel® PCC4 pour chaque membre de l'ensemble de données de validation seront déterminées en utilisant uniquement les informations générées à partir de leurs niveaux d'expression des séquences d'ARNsnc ; les résultats correspondants seront stockés dans un fichier horodaté et verrouillé comme décrit ci-dessus. Le groupe de risque clinique pour chaque membre de l'ensemble de données de validation tel que déterminé par le pathologiste central sera également stocké dans un fichier verrouillé et horodaté. Lorsque les deux fichiers seront terminés, ils seront communiqués à l'équipe scientifique de miR et les caractéristiques de performance du test Sentinel® PCC4 seront établies dans l'ensemble de données de validation ; notez que ces taux d'erreur se réfèrent à la classification d'un futur patient dont le statut de la maladie est inconnu.