Varianti geniche del cromosoma 5Q e tratti correlati all'asma

SFONDO:

È stato dimostrato che marcatori e geni nella regione cromosomica 5q31-33 sono collegati o associati all'asma o a componenti del fenotipo dell'asma, suggerendo che questa regione cromosomica è importante nella suscettibilità genetica all'asma, tuttavia è stato difficile dimostrare che una specifica gene in questa regione svolge un ruolo importante nello sviluppo o nella progressione dell'asma. Alcune di queste difficoltà derivano dal fatto che è probabile che molti geni siano coinvolti nella patogenesi dell'asma, senza che nessun singolo gene abbia un effetto che emergerà come un contributo importante, così come dal fatto che la forte influenza dei fattori ambientali complicare le analisi. Dopo aver riconosciuto questi problemi, i ricercatori utilizzeranno i componenti del fenotipo associato all'asma, tra cui l'eosinofilia e un fenotipo "atopico" composto, per identificare i geni correlati all'asma rilevanti in questa regione. L'identificazione dei geni e delle loro varianti genetiche che possono essere associate all'asma e ai relativi fenotipi può fornire nuove importanti informazioni sulla patogenesi dell'asma.

Lo studio è in risposta a una richiesta di candidatura su "Approcci di candidati posizionali nella scoperta del gene dell'asma" pubblicata nell'ottobre 1999.

PROGETTAZIONE NARRATIVA:

Il dottor Martinez e il suo gruppo hanno trovato un collegamento tra i marcatori nel cromosoma 5q31 e sia l'eosinofilia che un fenotipo composito di "atopia". L'obiettivo dello studio è identificare le varianti geniche in 5q31-33 responsabili di questi due segnali di collegamento. Ciò verrà fatto utilizzando la stessa popolazione di famiglie arruolate nel Tucson Children's Respiratory Study che sono state ora seguite dal momento della nascita del bambino indice circa 18 anni fa. Nel primo obiettivo specifico saranno identificate varianti geniche con una frequenza del 2% o più in un gruppo di 25 geni noti nel cromosoma 5q. I 25 geni sono stati selezionati tra quelli che sono stati mappati sull'intervallo di 28 cM testato per il collegamento in studi precedenti. Il secondo obiettivo specifico è eseguire la mappatura del linkage disequilibrium utilizzando 100 polimorfismi noti nella regione di circa 6,4 cM che mostra la più alta probabilità di contenere le varianti geniche responsabili di uno o entrambi i segnali di linkage di eosinofilia e atopia. Verrà inoltre eseguita una mappatura locale dettagliata utilizzando polimorfismi pubblicati e recentemente scoperti all'interno e intorno alle aree di segnali positivi. Sulla base della precedente esperienza di questi ricercatori per la stessa regione cromosomica, si prevede di trovare diversi segnali di associazione/collegamento nel cromosoma 5q.

La data di completamento dello studio elencata in questo record è stata ottenuta dalla "Data di fine" inserita nel record Protocol Registration and Results System (PRS).