UW未診断遺伝病プログラム

推定 10,000 のまれなメンデル遺伝性疾患が、全体で 12 人に 1 人に影響を与えます。 重要なことに、これらの疾患の半数強が既知の遺伝的原因を持っています。 これにより、何千もの疾患遺伝子が発見されるのを待っており、何百万人もの患者が診断を受けていません。 研究者は、ゲノム配列決定やその他のオミクス技術を使用して、包括的な臨床検査で診断に失敗した患者を評価することにより、ゲノム医療におけるこれらの重要な問題に対処します。 仮説は、慎重に選択された場合、これらの未診断の疾患患者は、新しい疾患遺伝子発見のための豊富なリソースになるというものです.

この研究は、UW 未診断疾患プログラム (UW-UDP) の研究部門です。 この研究の主な目的は、新しい疾患遺伝子を発見し、まれなメンデル障害の既知の表現型を拡大することです。 二次的な目的は次のとおりです。 a) 従来の臨床的手段を使用して診断されていない遺伝性疾患を持つ個人を診断し、その疾患を管理するための実用的な知識を提供する。 b) 遺伝性疾患の病態生物学およびゲノム変異と疾患との関係についての理解を深める。 c) 新しい診断技術と分析を開発し、試行する。

これらの目的は、次の 3 つの目的を通じて達成されます。

目的 1: トリオ ショート リード ゲノム シーケンスと希少疾患データベース GeneMatcher および MatchMaker Exchange とのデータ共有を使用して、未診断の遺伝性疾患が疑われる個人の候補疾患バリアントを特定します。

目的 2: 新しいオミクス技術とバイオインフォマティクス アルゴリズムを使用して、目的 1 で診断されなかった個人をさらに評価します。 これらのアプローチには、a) 超ロングリード de novo アセンブリベースのゲノム配列決定が含まれます。 b) RNA-Seq; c) エピゲノム プロファイリング、および d) クロマチン構成のコンフォメーション分析。

目的 3: UW および外部のモデル生物研究者との協力を通じて、目的 1 および 2 で発見された選択された候補疾患遺伝子およびゲノムバリアントの機能評価を提供します。 これらの取り組みは、カナダの希少疾患モデルおよびメカニズム ネットワーク データベースにリンクされた UW モデル生物研究者データベースと、モデル生物研究者データベースの新たなグローバル ネットワークの使用を通じて促進されます。

この研究プロジェクトは、診断されていない患者に対する UW-UDP の包括的な臨床評価と密接に統合されています。 標準的な臨床ケアコンポーネントには、患者の紹介、医療記録の収集と訪問前の評価、および研究の開始時の広範な表現型検査と研究の終了時の結果の返却のための診療所の訪問が含まれます。 研究ワークフローには、ゲノム配列決定、世界的な疾患遺伝子発見ネットワークとのデータ共有、および遺伝子検査によって特定されたバリアントの因果関係を判断するためのフォローアップ研究が含まれます。 この研究は、遺伝性疾患の病理生物学の理解を深め、臨床診断を改善し、ウィスコンシン州内外で、これまで診断されていなかった希少疾患を持つ個人の診断と管理を支援します。