INST 1204: PIK3CA-mutasjoner som biomarkører for metastaser ved tykktarmskreft

Dette forslaget tar sikte på å identifisere PIK3CA-mutasjoner som en biomarkør for metastase.

For å gjøre dette vil DNA bli ekstrahert fra enten frosset eller parafininnstøpt tykktarmskreftvev for å sekvensere PIK3CA, KRAS og BRAF. Kliniske utfallsdata vil bli samlet inn for å inkludere metastaser og overlevelse for å korrelere med PIK3CA, KRAS og BRAF mutasjonsstatus. Pasienter med stadium II og stadium Ill tykktarmskreft vil bli identifisert i University of New Mexico Human Tissue Repository og NIH PLCO biorepository for forebygging.

Eksisterende bankvev fra stadium II og Ill tykktarmskreft vil bli samlet inn. Det vil ikke være direkte kontakt med levende individer. Epidemiologiske faktorer som alder, rase, kjønn og utfallsdata for metastaser og overlevelse vil bli samlet inn.

Spesifikke mål:

1. Å utvikle og standardisere metoder for høykapasitets DNA-ekstraksjon og analyse fra tykktarmssvulster hos pasienter med stadium II og stadium III sykdom som huser PIK3CA ekson 9 og ekson 20 mutasjoner.
2. For å bestemme korrelasjonen mellom villtype og PIK3CA, PIK3CA ekson 9 og PIK3CA ekson 20 mutasjoner og utvikling av metastatisk sykdom og total overlevelse i stadium II og stadium III pasienter med kolorektal kreft.