Badanie wpływu wrodzonego na odpowiedź zapalną na endotoksynę

To badanie naukowe zbada rolę wrodzonej odporności na odpowiedź zapalną monocytów i makrofagów na endotoksynę. Około 1450 zdrowych uczestników w wieku 18 lat i starszych zostanie zidentyfikowanych i zrekrutowanych z rejestru polimorfizmu środowiskowego (EPR). EPR to długoterminowy projekt mający na celu zebranie i przechowywanie do 15 000 próbek DNA do wykorzystania w badaniach naukowych od osób z aglomeracji Trójkąta Karoliny Północnej. Przewiduje się, że około 50% uczestników, z którymi się skontaktowano, zapisze się, a około 15% zapisanych uczestników wycofa się.

To kontrolowane, obserwacyjne badanie asocjacji genów będzie rekrutować uczestników na podstawie genotypu, a następnie obserwować fenotyp każdego uczestnika. Istnieje kilka interesujących SNP w genach TIRAP, MyD88, ABCA1, CD14, CD44, ITIH3, ITIH4, TLR4, TNFa, TLR5, IRGM i APOL1. Ponadto istnieją allele będące przedmiotem zainteresowania w genie ApoE. Te allele razem wzięte są uważane za polimorfizm. Dla każdego polimorfizmu będącego przedmiotem zainteresowania zostanie zrekrutowana oddzielna grupa uczestników (w tym heterozygoty i homozygoty zarówno dla mniejszych, jak i głównych alleli dla każdego SNP). Maksymalnie 200 ml krwi zostanie pobrane od każdego uczestnika podczas jednej wizyty trwającej około 1-1,5 godziny. Z pobranych próbek krwi zostaną wyizolowane monocyty krwi i hodowane w celu uzyskania makrofagów. Makrofagi zostaną wystawione ex vivo na działanie endotoksyny (LPS) i PAM3CSK4 w celu określenia odpowiedzi komórkowej w zależności od genotypu. W badaniach APOL1 zostanie również pobrana próbka moczu w celu oceny filtracji białek.

Głównym celem jest określenie powiązań pomiędzy wybranymi polimorfizmami w genach [TIRAP (TIR Associated Protein), MyD88 (Myeloid Differentiation Primary Response Protein 88), ApoE (Apolipoproteina E), ABCA1 (ATP Binding Cassette Transporter A1), CD14, CD44, ITIH3 , ITIH4, TLR4, TNFa, TLR5, IRGM i APOL1] oraz ilościowe funkcje zapalne in vitro dwóch typów komórek, makrofagów i neutrofili. Pierwszorzędowymi punktami końcowymi tego badania dla obu typów komórek będą poziomy 6 cytokin TNF alfa, IL-6, MIP-2, IL-8, MCP-1 i IFN-beta (ELISA) indukowane przez LPS i PAM3CSK4 plus linia podstawowa poziomy cytokin (brak ekspozycji na LPS lub PAM3CSK4). Poziom białka w moczu zostanie określony ilościowo w niektórych badaniach jako miara wczesnej dysfunkcji nerek.

Mamy nadzieję, że wyniki tego badania mogą doprowadzić do odkrycia ważnych informacji dotyczących roli MDC1 (Mediator of DNA damage Checkpoint protein 1) w chorobach człowieka, potencjalnie identyfikując nowe cele dla przyszłych badań.