Optimering av sepsisterapi baserat på patientspecifik digital precisionsdiagnostik (DigiSep)

Sepsis är en sjukdom som utlöses av en infektion och utgör en av de största utmaningarna inom modern intensivvårdsmedicin. När det gäller riktad antimikrobiell behandling är tidigast möjliga patogendetektering av avgörande betydelse. Hittills representerar kulturbaserade detektionsmetoder guldstandarden för diagnos, även om många begränsningar kännetecknar dessa. I detta sammanhang är kulturoberoende molekylärbiologiska processer ett alternativ. Speciellt tycks konceptet med serumdetektering av cirkulerande, fritt DNA med hjälp av nästa generations sekvensering (NGS) representera en lovande diagnostisk procedur hos patienter med blodomloppsinfektioner. Sökandens omfattande förarbete tyder på att NGS-baserad diagnostik med SIQ-poäng har högre specificitet och sensitivitet jämfört med traditionella kulturbaserade metoder för att upptäcka blodomloppsinfektioner. Detta förarbete för DigiSep-studien med hjälp av interventionell studiedesign ger den optimala grunden för att etablera detta nya koncept som en del av den nationella standarden baserat på bästa möjliga evidens. DigiSep-studien är tänkt att karakterisera effekten av kombinationen av digital precisionsdiagnostik, expertutbyte och kulturbaserad standarddiagnostik jämfört med en rent kulturbaserad konventionell diagnos i den kliniska bilden av sepsis/septisk chock. Studien undersöker hos 410 patienter (n = 205 per arm) med sepsis/septisk chock om den så kallade DOOR-RADAR-poängen (Desirability of Outcome Ranking / Response Adjusted for Duration of Antibiotic Risk Score) kan förbättras avsevärt, genom tillämpning av NGS. Vi siktar också på att även studera om det nya förfarandet är kostnadseffektivt. Det postuleras att inläggningstiden för slutenvård, dödligheten, incidensen av akut njursvikt (ARF), varaktigheten av antimikrobiell behandling samt kostnaderna för komplikationer och öppenvård eftervård kan minskas. Dessutom kan en betydande förbättring av livskvaliteten för de drabbade patienterna förväntas.

Som en del av studien samlas de väsentliga data in en gång vid tidpunkten för sepsis (= debut). Den odlingsbaserade diagnostiken inkluderar den riktlinjeorienterade insamlingen av 2 blododlingsset (2 x aerob / 2 x anaerob) till början och tre dagar senare. Samtidigt tas serumprover för NGS-baserad patogendiagnostik. Ytterligare provtagning för NGS-baserad diagnostik kan göras fram till dag 14 efter debut eller närhelst den behandlande läkaren fastställer en klinisk indikation för insamling av ytterligare blododlingar. Ovannämnda kulturer kontra NGS-baserad patogendiagnostik åtföljs också av utökad immunologisk övervakning från blodplasmaprover samt en NGS-baserad transkriptomanalys. Den associerade provtagningen sker vid tidpunkten för debut, 3, 7 och 14 dagar efter början av sepsis. Rutinmässiga mikrobiologiska fynd från andra biologiska prover (t.ex. kirurgiska pinnar, dräneringssekret, trakealsekret, vävnadsprover) ingår i utvärderingen om dessa insamlats tre dagar före eller efter extraktion av serumprover för NGS-baserad diagnostik. Den kliniska datainsamlingen utförs också vid tidpunkten för sepsis (= debut), 3, 7 och 14 dagar senare, analogt med ovan nämnda provtagning. Den slutliga utvärderingen sker 28 dagar (= 28 d) efter uppkomsten av sepsis. Den studierelaterade bördan för den enskilda studiepatienten inkluderar totalt 17 ml helblod för NGS-baserad diagnostik, de fyra proverna på 7,5 ml helblod för immunologisk övervakning och de fyra proverna på 2,7 ml helblod för transkriptomanalys . Den minsta totala volymen uppgår därför till uppsamling av cirka 75 ml helblod inom de första 14 dagarna efter uppkomsten av sepsis. Provtagningen sker med insamling av blododlingarna eller inom ramen för de dagliga blodproverna så att inga ytterligare venpunkteringar behövs här. Infektionsparametrar som prokalcitonin (PCT) utförs inom ramen för daglig regelbunden blodinsamling och kräver därför inga ytterligare vaskulära punkteringar. Samma princip gäller för insamling av blodkulturer som rutinmässigt erhålls som en del av standarddiagnostik hos patienter med misstänkt eller påvisad sepsis. De erforderliga blodproverna på två 40 ml helblod (vardera två set med 2 x aerob / 2 x anaerob = 4 x 10 ml = 40 ml) representerar därför ingen extra börda på grund av studien. Ytterligare en extra börda för patienten avseende invasiva ingrepp eller undersökningar förväntas inte i studien.