肠道细菌和炎症 (BIG) 研究 (BIG)

零假设是对纯肠内营养 (EEN) 的临床反应和结肠炎症标志物的减少与特征性细菌分类学（组成）和代谢物（功能）无关；并且通过补充肠内营养维持任何细菌变化（ SEN），虽然恢复了习惯性饮食，但并不能降低疾病复发的风险。

该研究设计将建立在先前工作的基础上，通过观察肠道细菌（粪便和粘膜）和疾病活动不同阶段的细菌代谢活动的差异。 将检查疾病组之间细菌组成的变化；接受不同治疗的克罗恩病儿童之间；以及肠道不同部位之间的变化。 还将通过分析细菌代谢物来评估粪便和尿液中的克罗恩病生物标志物。

将招募多达 42 名患有克罗恩病的儿童。 还将招募42名健康儿童提供粪便和尿液样本，以显示健康儿童肠道细菌和代谢物的正常种类，以供比较。

接受结肠镜检查但未患有克罗恩病的儿童将被用作比较组，以尝试从粪便和尿液中鉴定克罗恩病细菌特征，并作为非克罗恩病对照组用于比较粘膜活检。

招募 三组儿童将参与这项研究。 A. 正在接受包括克罗恩氏病在内的结肠炎症的内窥镜检查（结肠镜检查）的儿童 [未发现克罗恩氏病的儿童将不参与本研究的后续方面（在 EEN 治疗期间）]。

B. 先前诊断患有克罗恩氏病的患者因疾病发作而开始使用 EEN 进行为期 8 周的标准疗程。

C. 将与克罗恩病患者无关的健康儿童作为对照组。

A 组和 B 组：最初的血液、尿液和粪便样本，随后在 12 个月内再进行 5 次粪便和尿液样本；和饮食信息。

[A 组还将在常规内窥镜检查期间进行 8 次粘膜活检]。 在 EEN 治疗期间（临床决定），在治疗开始和结束时的常规血液采样期间将要求额外的血液样本。

C 组：需要 1 份尿液和粪便样本。

所有组都将在基线测量身高、体重和握力。 接受 EEN 的参与者将在治疗开始后 60 天和治疗结束后 60 天重复此过程。

详细方法 通过简短的健康问卷进行初步健康检查——基本健康信息、年龄、任何药物。

粘膜标本：在新诊断的患者中，为诊断目的进行结肠镜检查，额外增加 6 个粘膜活检标本；如果可能，从末端回肠取 2 个，从近端结肠取 2 个，从远端结肠取 2 个（在正常结肠镜检查中收集 14-16 个）。 在上消化道内窥镜检查期间，还将从十二指肠采集另外 2 个活检样本。

饮食信息：使用经过验证的食物频率问卷 (FFQ) 评估的习惯性饮食摄入量和饮食模式；一个 5 步多次通过 24 小时饮食回忆问卷，用于收集粪便和尿液采样时的实际饮食数据。

EEN 合规性（仅限 A 组和 B 组）：在 28 天和 56 天时间点完成简短的 EEN 合规性调查问卷。

用药和病史：从病历中收集的有关疾病活动、用药和病史的信息。

实验室检测细菌多样性：粪便样本中的肠道细菌多样性和组成将使用分子技术进行测量，例如来自细菌核糖体 DNA 的定量聚合酶链反应 (PCR) 和下一代测序（宏基因组学）。 这些技术还将用于观察与粘膜组织活检相关的细菌组成。 将使用标准数值指数测量 12 个月期间收集的 6 个粪便样本以及各组之间的整体肠道细菌组成的变化。

细菌代谢：细菌代谢产生的大量不同产物，例如短链脂肪酸、硫化物和氨，将使用气相色谱法和气相色谱质谱法 (GCMS)（代谢组学）等一系列技术进行测量。 还将测量粪便 pH 值，这是细菌发酵的标志。

疾病标志物：将从粪便样本中测量其他疾病标志物和代谢物，例如粪便钙卫蛋白。