Biomarkers in Tumor Tissue Samples From Patients With Peripheral T-cell Lymphoma or Natural Killer Cell Neoplasms
The Molecular Mechanisms of Transformation in Peripheral T-cell and NK Lymphomas
RATIONALE: Studying samples of tumor tissue from patients with cancer in the laboratory may help doctors learn more about changes that occur in DNA and identify biomarkers related to cancer. It may also help doctors find better ways to treat the cancer.
PURPOSE: This research trial studies biomarkers in tumor tissue samples from patients with peripheral T-cell lymphoma or natural killer cell neoplasms.
調査の概要
詳細な説明
OBJECTIVES:
- To identify mutations in oncogenes and tumor suppressors of peripheral T-cell lymphoma or natural killer (NK) cell neoplasm.
- To delineate the mechanisms that mediate oncogenic effects and their clinical prognostic significance in these diseases.
- To perform a comprehensive mutation analysis via whole exome resequencing in a panel of peripheral T-cell or NK lymphomas.
OUTLINE: Fixed paraffin-embedded tumor tissue samples are analyzed for mutations by the Illumina HiSeq platform. Sequencing reads are performed by GAPipeline version 1.5.1 and mapping on the human genome performed using the MAQ software version 0.7.1. Genes harboring validated somatic mutations are then amplified by PCR and analyzed by Sanger resequencing.
研究の種類
入学 (実際)
参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
DISEASE CHARACTERISTICS:
- Diagnosed with peripheral T-cell lymphoma or natural killer cell neoplasms
- Available fresh tumor samples from patients treated on ECOG-E2404 and normal DNA (non-ECOG) samples
PATIENT CHARACTERISTICS:
- Not specified
PRIOR CONCURRENT THERAPY:
- See Disease Characteristics
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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New somatically mutated genes in T-cell and NK lymphoma samples
時間枠：1 year
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1 year
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者：Adolfo A. Ferrando, MD, PhD、Herbert Irving Comprehensive Cancer Center
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (見積もり)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
その他の研究ID番号
- CDR0000703260
- ECOG-E2404T1
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