Oral Microbiome and Pancreatic Cancer
Oral Microbiome and Pancreatic Cancer: a Prospective Case-Control Study
This is a prospective population based study to examine the relationship of oral and pancreatic microbiome, and their functions, to pancreatic cancer risk.
The identification of specific oral bacteria and their functional relationship to pancreatic cancer will advance scientific knowledge on the etiology of pancreatic cancer. This could provide a new microbially-based research paradigm, possibly leading to new drug targets for this disease. Second, the oral bacteria may serve as a readily accessible, non-invasive biomarker for subsequent pancreatic cancer risk, which help to identify people at high risk of this disease. Finally, the identified oral bacteria may lead to microbial prophylactic preventions, with antibiotic therapy aimed at eradicating the specific species associated with increased cancer risk or, alternatively, combined with probiotics to introduce species that are associated with a decreased cancer risk. Thus, the study outcomes will lead to actionable means for pancreatic cancer prevention.
調査の概要
詳細な説明
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
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New York
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New York、New York、アメリカ、10016
- New York University School of Medicine
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
Inclusion Criteria:
- DNA extracted from oral wash samples from NIH-PLCO and ACS-CPS cohorts
Exclusion Criteria:
-
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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Cases
subjects with histology-confirmed incident pancreatic cancer, with no prior history of cancer (except non-melanoma skin cancer), a valid consent, and pre-diagnostic oral wash samples.
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extraction of genomic DNA from oral samples using the Mobio DNA Isolation Kit.
16S rRNA amplicons covering variable regions V3 to V4 will be generated using primers (347F-5'GGAGGCAGCAGTRRGGAAT'-3' and 803R 5'-CTACCRGGGTATCTAATCC-3')66 incorporating adapters and a sample barcode sequence at PI's lab.
Amplicons will be sequenced with the Roche 454 FLX Titanium sequencing system at the NYU genome technology center, following the manufacturer's specifications.
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Control
selected by incidence density sampling63 among cohort members who had no cancer prior to selection, provided a valid consent and an oral wash.
Controls were frequency matched to cases by cohort, age at cohort entry (5 year), sex, race, and calendar year of cohort entry.
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extraction of genomic DNA from oral samples using the Mobio DNA Isolation Kit.
16S rRNA amplicons covering variable regions V3 to V4 will be generated using primers (347F-5'GGAGGCAGCAGTRRGGAAT'-3' and 803R 5'-CTACCRGGGTATCTAATCC-3')66 incorporating adapters and a sample barcode sequence at PI's lab.
Amplicons will be sequenced with the Roche 454 FLX Titanium sequencing system at the NYU genome technology center, following the manufacturer's specifications.
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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Presence or absence of bacterial taxa will be compared in oral and pancreatic samples.
時間枠：4 Years
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For the taxa present at both sites, correlation between the abundance of taxa will be examined between the two sites.
To adjust for confounders, multivariate linear regression will be used with abundance of oral taxa (exposure) and that of pancreas taxa (outcome).
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4 Years
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協力者と研究者
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研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
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