ウイルス性呼吸器病原体の多重検出のための生体再構成可能な電子プラットフォーム (BIOPLEX)
ウイルス性呼吸器病原体の高感度多重検出のための生体再構成可能な差動インピーダンス電子プラットフォーム
このプロジェクトは、標的生体分子を高感度かつ特異的に検出するための最先端の電子バイオセンサー プラットフォームの開発に焦点を当てており、最初のアプリケーションは SARS-CoV-2 検出を対象としています。 このシステムは、比類のない分解能 (1 ppm) を実現するロックイン モードを利用して、微小電極間のインピーダンス測定で動作します。 シグナル検出の強化は、デングウイルス抗体検出におけるこれまでの成功に基づいて、インピーダンス変化を増幅する機能化ポリスチレンマイクロビーズによって実現されます。
主なイノベーションには、さまざまなターゲットのリアルタイム比較分析を実現する複数のチャネルにわたる差動インピーダンス センシングや、プローブの固定化とターゲットの相互作用を最適化するために DMA ベースの機能性ポリマーで修飾されたバイオセンサー チップが含まれます。 このバイオセンサーは既存のマイクロ流体システムと統合されており、相補的なオリゴヌクレオチド官能化ビーズと組み合わせた、SARS-CoV-2 スパイクタンパク質に対する DNA 標識抗体を使用したウイルス全体の検出をサポートします。 この戦略は、薬局でのポイントオブケア検査などの実際の用途のための抗原特異的検出によって補完されます。
このプロジェクトには、ウイルス粒子検出におけるプラットフォームの感度を検証するために、新型コロナウイルス感染症バイオバンクから採取した匿名化された呼吸器サンプルと血漿サンプルを分析する遡及研究が含まれています。 これらの取り組みは、安全性、拡張性、汎用性に重点を置き、呼吸器感染症の診断技術を進歩させることを目的としています。
調査の概要
詳細な説明
このプロジェクトは、バイオセンサー表面に事前にグラフトされた選択的バイオプローブによる標的生体分子の捕捉時の微小電極間のインピーダンス変化の測定を実行する電子プラットフォームの開発に基づいています。 必要な感度は、バイオセンサーをロックイン モードで動作させることによって達成されます。これにより、インピーダンス信号の振幅と位相の変化を追跡する際に最高の分解能が保証されます (1 ppm は他のアプリケーションで POLIMI によって実証されています)。 デング熱ウイルスに対する抗体の検出に成功した支持者によって実証されているように、電子信号を増強するには、オリゴヌクレオチドまたは抗体で適切に機能化されたポリスチレンマイクロビーズを使用して標的を結合し、インピーダンス変化を増加させます。 同じバイオセンサーチップ上で複数のセンシングサイトに並行して対処し、検出感度と制御を強化するために同じ生体サンプルからの異なるターゲットのリアルタイム比較分析を可能にするために、差動インピーダンスセンシングを実行するためのカスタムメイドの電子プラットフォームが開発されます。 、複数のチャネルでのターゲットセンサーとリファレンス間の直接比較)。 このバイオセンサーチップは、金の微小電極を備えたホウケイ酸塩で作られており、CNRが開発した機能性ポリマー(N,N-ジメチルアクリルアミド-DMAベースのポリマーの一種)で表面が特異的に修飾されており、チップ表面にナノメートルの親水性フィルムを形成します。 これらのコポリマーの官能基により、プローブの共有結合による固定化が可能になり、その活性構造、適切な空間距離、配向および密度が維持され、ターゲットとの相互作用が促進されます。 バイオセンサーチップは、同グループですでに提供されているマイクロ流体システムに統合される予定だ。
SARS-CoV-2 は、挑戦的な戦略で標的とされるでしょう。 まず、SARS-CoV-2 スパイクタンパク質に対する DNA 標識抗体を使用して、溶液中のウイルス全体を捕捉する予定です。
抗体に結合した DNA 配列に相補的なオリゴヌクレオチド プローブがスポットされたセンサー領域は、ウイルスの表面全体を装飾している DNA 標識抗体と相互作用します。 プラットフォームのインピーダンス変化を増加させるために、ポリスチレンビーズが使用されます。特に、ビーズは、ウイルスを捕捉した抗体に結合したオリゴヌクレオチドに相補的なオリゴヌクレオチドで修飾されます。 DNA による抗原の捕捉と差動インピーダンス センシングの高感度プラットフォームを組み合わせたこのウイルス全体の検出方法は、まったく新しいものであり、抗体の検出において提唱者がすでに達成した結果に基づいて成功が期待されています。デング熱ウイルスに感染した人の血液中に含まれます。 並行して、電子プラットフォームの使用をウイルス抗原の検出にも拡張する予定です。 スパイクプロテイン S またはヌクレオカプシド プロテイン N。感染症の診断にウイルス全体ではなく抗原を使用すると、特別な安全要件が必要ないため、重要な実際のドロップアウトにつながる可能性があり、そのため任意の場所で検査を実施できます。 、特に薬局や診療所では、標準的な抗原性側方流動検査と同様の検査が行われます。
これは、プロジェクト PRIN Prot で開発中のプラットフォームの分析感度を評価するために呼吸器サンプルを検査する遡及的単施設研究です。 2022EJL28B。 サンプルは完全に匿名化され、サンプル分析は、呼吸器サンプルなどの生物学的マトリックス中のウイルス粒子の存在を明らかにする装置の能力をチェックするために実行されます。また、機器のセットアップに必要な場合は、無作為化および匿名化された血漿サンプルも使用されます。 この研究には患者や臨床データの使用は関与しませんが、サンラファエレの施設内新型コロナウイルス感染症臨床生物学的バイオバンク(COVID-BioB、NCT04318366)に保管されているサンプルのみを使用しました。 研究に使用されたサンプルは、2020年3月19日から2024年5月31日までの期間に収集されました。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究場所
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Milan、イタリア、20132
- IRCCS San Raffaele
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 呼吸器系ウイルスについて検査されたサンプル。サンラファエレの施設内 COVID-19 臨床生物学バイオバンク (COVID-BioB、NCT04318366) に保管されています。
除外基準:
- なし
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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呼吸器系ウイルス陽性
79の遡及的サンプルが呼吸器ウイルスの検査で陽性となった
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微小電極間のインピーダンス変化を測定する電子プラットフォームは、バイオセンサー表面上に事前にグラフトされた選択的バイオプローブによって標的生体分子を捕捉する際に使用されます。
必要な感度は、バイオセンサーをロックイン モードで動作させることによって達成されます。これにより、インピーダンス信号の振幅と位相の変化を追跡する際に最高の分解能が保証されます。
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呼吸器系ウイルス陰性
79件の遡及的サンプルは呼吸器ウイルスの検査で陰性だった
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微小電極間のインピーダンス変化を測定する電子プラットフォームは、バイオセンサー表面上に事前にグラフトされた選択的バイオプローブによって標的生体分子を捕捉する際に使用されます。
必要な感度は、バイオセンサーをロックイン モードで動作させることによって達成されます。これにより、インピーダンス信号の振幅と位相の変化を追跡する際に最高の分解能が保証されます。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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鼻咽頭スワブを使用したバイオセンサー プラットフォームの検証
時間枠:12ヶ月
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呼吸器ウイルスを検出するための、無作為化された呼吸器サンプルのリアルタイムインピーダンス測定
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12ヶ月
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協力者と研究者
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Liu W, Liu L, Kou G, Zheng Y, Ding Y, Ni W, Wang Q, Tan L, Wu W, Tang S, Xiong Z, Zheng S. Evaluation of Nucleocapsid and Spike Protein-Based Enzyme-Linked Immunosorbent Assays for Detecting Antibodies against SARS-CoV-2. J Clin Microbiol. 2020 May 26;58(6):e00461-20. doi: 10.1128/JCM.00461-20. Print 2020 May 26.
- Seo G, Lee G, Kim MJ, Baek SH, Choi M, Ku KB, Lee CS, Jun S, Park D, Kim HG, Kim SJ, Lee JO, Kim BT, Park EC, Kim SI. Rapid Detection of COVID-19 Causative Virus (SARS-CoV-2) in Human Nasopharyngeal Swab Specimens Using Field-Effect Transistor-Based Biosensor. ACS Nano. 2020 Apr 28;14(4):5135-5142. doi: 10.1021/acsnano.0c02823. Epub 2020 Apr 20. Erratum In: ACS Nano. 2020 Sep 22;14(9):12257-12258. doi: 10.1021/acsnano.0c06726.
- Sola L, Damin F, Gagni P, Consonni R, Chiari M. Synthesis of Clickable Coating Polymers by Postpolymerization Modification: Applications in Microarray Technology. Langmuir. 2016 Oct 11;32(40):10284-10295. doi: 10.1021/acs.langmuir.6b02816. Epub 2016 Sep 29.
- Piedimonte P, Sola L, Cretich M, Gori A, Chiari M, Marchisio E, Borga P, Bertacco R, Melloni A, Ferrari G, Sampietro M. Differential Impedance Sensing platform for high selectivity antibody detection down to few counts: A case study on Dengue Virus. Biosens Bioelectron. 2022 Apr 15;202:113996. doi: 10.1016/j.bios.2022.113996. Epub 2022 Jan 15.
- F. Morichetti et al., "Non-Invasive On-Chip Light Observation by Contactless Waveguide Conductivity Monitoring," in IEEE Journal of Selected Topics in Quantum Electronics, vol. 20, no. 4, pp. 292-301, July-Aug. 2014, Art no. 8201710, doi: 10.1109/JSTQE.2014.2300046.
- Ciccarella, Pietro et al. "Multichannel 65 zF rms Resolution CMOS Monolithic Capacitive Sensor for Counting Single Micrometer-Sized Airborne Particles on Chip." IEEE Journal of Solid-State Circuits 51 (2016): 2545-2553.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (推定)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (推定)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- BIOPLEX 2022EJL28B
- 2022EJL28B (その他の助成金/資金番号:Ministero dell'Università e della Ricerca (MUR))
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
米国で製造され、米国から輸出された製品。
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