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肠道菌群分析结合粪便DNA甲基化检测结直肠癌 (IMMDC)

2020年3月6日 更新者:WEIDONG LIU,MD

肠道菌群分析结合粪便 DNA 甲基化检测结直肠癌:结直肠肿瘤筛查的研究方案

简介:结直肠癌(CRC)的发病率位居世界第三,死亡率位居世界第四。 传统结肠镜检查作为一种侵入性检查方法,不能广泛应用于结直肠肿瘤的筛查。 粪便免疫化学试验在敏感性方面有一些局限性。 此外,种族和地区差异可能会影响结果。 肠道菌群组成的异常被认为是结直肠癌发生和发展的潜在重要病因。 分析粪便菌群和脱落细胞基因可能代表一种新的结直肠癌筛查工具。本研究旨在使用16S rRNA比较结直肠癌患者和健康对照者粪便菌群的差异。 这些数据与粪便脱落细胞的 DNA 发现相结合,可能会进一步阐明这种差异,从而建立一个筛查中国人早期结直肠癌的模型。

方法与分析:共招募 300 名结肠镜检查结果为阳性的患者和 200 名健康对照者。 所有参与者都将填写信息表和问卷。 粪便样本将通过 16S rRNA 分析进行检查。 将在粪便脱落细胞中检测基因甲基化水平。 将建立相关肠道微生物群和甲基化基因的模型。 受试者工作特征(ROC)曲线分析将用于选择一些具有适当灵敏度和特异性的模型。这些模型将通过多中心研究进一步验证。

研究概览

详细说明

简介: 结直肠癌(CRC)的发病率位居世界第三,死亡率位居世界第四。 在中国,CRC 是癌症死亡的第五大原因。 CRC 的年龄标化发病率呈上升趋势。西方化的生活方式,尤其是身体活动不足,以及近几十年来中国肥胖患病率的增加可能解释了 CRC 发病率的增加。

CRC 患者的 5 年生存率为 65%。 CRC 的存活率可能因各种因素而异,尤其是癌症分期。 局限期 CRC 的 5 年生存率为 90%。 大约 39% 的患者在这个早期阶段被诊断出来。 由于缺乏典型的临床症状,早期结直肠癌不易被发现,大多数患者在确诊结直肠癌时已处于晚期,错过了最佳干预阶段。 因此,早发现、早治疗是降低结直肠癌死亡率的有效手段。 筛查有很多好处,包括早期诊断、降低 CRC 的发病率和死亡率。

目前,结直肠癌的主要筛查方法是大便隐血试验和结肠镜检查。 结肠镜检查是筛查 CRC 的金标准。 然而,传统的结肠镜检查是一种侵入性的检查方法,不能广泛应用于大肠肿瘤的筛查。

粪便样本获取方便。利用粪便筛查CRC是目前的研究共识。 根据最新的亚太地区结直肠癌筛查共识建议,FIT(粪便免疫化学检测)用于选择高危患者进行结肠镜检查。 FIT在世界其他地区也得到广泛应用。 FIT 的敏感性有限 (0.79; 95% CI, 0.69-0.86), 最近的系统荟萃分析显示研究之间的敏感性存在很大差异。 此外,种族和地区差异可能会影响测试结果。 因此,需要一种无创、高灵敏度、适合中国人的早期筛查方法。

检测粪便中的分子生物标志物以无创诊断 CRC 可能是当前临床环境中检测血液/血浆生物标志物的一种有前途的替代方法。 肠道微生物群组成的异常被认为是 CRC 的潜在重要原因。 随着宏基因组测序和焦磷酸测序在肠道微生物群研究中的广泛应用,越来越多的细菌被发现与 CRC 发病率呈正相关。 在最近的一项研究中,16S rRNA 测序被用于对结直肠肿瘤发生不同阶段的人体肠道粘膜中的微生物群落进行分类,发现结直肠肿瘤中富含梭杆菌。

对于CRC,良性息肉变成恶性肿瘤的主要过程是将结肠上皮细胞转化为结肠腺癌细胞的遗传和表观遗传改变的积累。 这些细胞不断流入结肠腔并与粪便混合。 在肿瘤形成过程中,表观遗传变化可能比突变更早发生。 表观遗传机制的失调在癌症中起着重要作用。 癌症中的大多数表观遗传变化是由特定基因的基因组改变引发的,这些基因参与控制其中一种表观遗传机制。肿瘤抑制基因的异常 DNA 甲基化诱导下游基因的异常表达,这是肿瘤发生过程中的重要步骤。 CRC 进展过程中 DNA 的甲基化状态发生变化。 在最近的研究中发现的一些与 CRC 相关的基因甲基化异常包括 SFRP2、SEPT9、BMP3、NDRG4 和 SPG20。 此外,一些基因突变与CRC有关。 例如,TP53 和 KRAS 突变在 CRC 中很常见。

在之前的研究中,研究人员发现 SEPT9、NDRG4 和 SDC2 在肿瘤中的甲基化频率和水平高于正常或非肿瘤邻近 CRC 组织,表明这些甲基化基因可能具有用于 CRC 筛查的诊断潜力。 然而,BMP3 对粪便样本检测准确性的贡献非常有限。 此外,甲基化 SEPT9、NDRG4 和 SDC2 的组合显示出检测 CRC 和腺瘤的高度可行性,进一步的研究表明检测 CRC 的性能优于腺瘤。 我们的研究还证明了不同种族群体之间粪便基因的差异。

本研究旨在通过 16S rRNA 分析检测 CRC 患者和健康对照者粪便中的肠道菌群差异。 它将结合粪便脱落细胞的DNA分析进一步阐明这种差异,从而建立一些用于筛查中国人早期结直肠癌的模型。 同时,该研究还将研究中国人的饮食习惯对肠道菌群的影响。

研究类型

观察性的

注册 (预期的)

500

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

    • Hunan
      • Changsha、Hunan、中国、410000
        • 招聘中
        • Xiangya Hospital of Central South University
        • 首席研究员:
          • Jie Chen
        • 接触:
        • 首席研究员:
          • mingmei Liao, PhD
        • 首席研究员:
          • xi Xie, PhD
        • 首席研究员:
          • zhan Qu

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 至 75年 (成人、年长者)

接受健康志愿者

不适用

有资格学习的性别

全部

取样方法

非概率样本

研究人群

该项目在中国湖南省长沙市湘雅医院(招募中)进行。

仅招募接受结肠镜检查的参与者

描述

纳入标准:

  • 结肠镜检查显示结肠或直肠肿瘤和活检证实的腺癌或腺瘤。
  • 没有化​​疗或手术,也没有其他癌症病史。
  • 必须能够理解并愿意签署知情同意书。
  • 健康对照没有肿瘤和癌症病史。

排除标准:

  • 不愿在研究开始前提供标本或回答问卷者。
  • 粪便样本不符合要求的人。
  • 不愿签署书面知情同意书或遵守研究方案的人。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

  • 观测模型:病例对照
  • 时间观点:追溯

队列和干预

团体/队列
干预/治疗
控制组
健康对照必须是18-75岁,无肿瘤,无癌症病史。
粪便微生物群检测和脱落细胞基因检测
测试组
实验组的纳入标准为年龄18-75岁,结肠镜检查显示结肠或直肠肿瘤,活检证实为腺癌或腺瘤,未化疗或手术,无其他癌症病史。 两组都必须能够理解并愿意签署知情同意书。
粪便微生物群检测和脱落细胞基因检测

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
中国人结直肠癌模型的诊断效能
大体时间:2年
CRC患者与健康个体肠道菌群和基因甲基化的差异。
2年

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
饮食对中国人肠道菌群和DNA甲基化的影响
大体时间:3年
调查频率(例如 “一周多少次”),数量(例如 "g") 和食物种类的半定量食物频率问卷 (SQFFQ)
3年

其他结果措施

结果测量
措施说明
大体时间
胆囊切除术对肠道菌群和甲基化的影响
大体时间:3年
所有参与者填写一份信息表,收集有关年龄、性别、职业等的数据。 同时,我们还将收集胆囊切除术的病史和时间。
3年
不同粪便特征下肠道菌群和DNA甲基化的影响
大体时间:3年-4年
使用 Bristol Stool Scale 方法对粪便进行分类。分数从 1 到 7,分数越低表示粪便越硬。
3年-4年

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 学习椅:weidong Liu, PhD、Xiangya Hospital of Central South University
  • 研究主任:mingmei Liao, PhD、Xiangya Hospital of Central South University
  • 首席研究员:xi Xie, PhD、Xiangya Hospital of Central South University
  • 首席研究员:jie Chen, PhD、Xiangya Hospital of Central South University
  • 首席研究员:zhan Qu, PhD、Xiangya Hospital of Central South University

出版物和有用的链接

负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。

一般刊物

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2018年2月1日

初级完成 (预期的)

2020年12月1日

研究完成 (预期的)

2021年12月1日

研究注册日期

首次提交

2019年11月5日

首先提交符合 QC 标准的

2020年3月6日

首次发布 (实际的)

2020年3月10日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2020年3月10日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2020年3月6日

最后验证

2020年3月1日

更多信息

与本研究相关的术语

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

未定

IPD 计划说明

数据共享不适用于本文,因为在当前研究期间没有生成或分析数据集。数据将以电子形式保存在 excel 表格中,图像将以 PNG 格式保存。所有数据将由魏教授保存- 刘东。

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

不

研究美国 FDA 监管的设备产品

不

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