悪性胸膜中皮腫における遺伝的感受性：生殖細胞系の変動の臨床的意味 (MAGNETS)

悪性胸膜中皮腫（MPM）は、主にアスベスト曝露に関連する胸膜中皮のまれで攻撃的な新生物であり、依然として効果的な治療法がありません。 ヨーロッパの発生率は、暴露と疾患の発症の間の長い潜伏期により、2025年頃にピークに達すると予測されています。 アスベスト産業用途は1970年代にピークに達し、1994年にイタリアで停止しました（L.D. 257）。 しかし、パビア州では、2007年にブロニ町のセメント工場の開拓が開始されました。作品はまだ完了しておらず、今日も人口の暴露が続いています。 Asst Pavia州とIRCCS Policlinico San Matteo Foundationのネットワークは、過去2年間で80以上の事件を特定しました。 したがって、私たちは、平均寿命が少ない（診断から12〜15か月）、まれな癌に注意を向けました。 他の疾患は、卵巣癌などの中胚葉から同じ発生学的起源でさえ、より一般的で、よく研究されており、より確立された治療法を持っています。 また、私たちの領土の特定の福祉と満たされていないニーズに対応する必要性を感じています。 吸入されたアスベスト繊維は胸膜に移動し、そこで持続し、刺激を引き起こし、組織の損傷を永続させ、死後（1）を見つけることができます。

アスベストは変異原性物質ではありません：そのナノ化された繊維は、チロシンキナーゼ（TK）と直接相互作用します（例： EGFR）および体細胞変異を活性化することなく、不適切な受容体の二量体化と活性化を誘導する可能性があります。 TK受容体の活性化は、細胞シグナル伝達カスケードと発癌を開始します。 したがって、アスベストは、遺伝的素因を持つ個人の腫瘍の成長をサポートする可能性のある炎症性免疫抑制微生微小環境の生成を誘導します（2）。 その結果、不均一な間質と一緒に作用可能な腫瘍の欠如は、TKと免疫チェックポイント阻害剤（TKI、ICIS）の両方の最新の薬物の失敗をサポートします。 この複雑な文脈では、MPMにおける生殖細胞の変化の役割は、疾患の素因となることが知られているBAP1遺伝子の変化を除き、ほとんど未調査のままです（3）。

炎症性浸潤、薬物反応、潜在的な予後的および予測的な意味を持つ生殖系署名を定義するための癌の素因に関与する遺伝子のパネルに焦点を当てます。 この研究は、まだ未開拓の環境を解読し、MPM生物学とアスベストに対する個人間感受性に関する機械的知識を改善することに貢献します。 さらに、新しい実用的なターゲットを特定し、パーソナライズされたより効率的な治療戦略を設計するのに役立つ可能性があります。

この研究の主な目標は、微小環境浸潤調節、薬物反応、癌の素因に関与する遺伝子パネルの生殖系の変化を探すことです。 この研究は、アスベストに曝露された被験者およびMPM患者から得られた血液サンプルで並行して実施されます。 このアプローチにより、i）MPMの発症の素因（または保護）に関連する推定生殖細胞系の署名が予後および予測的な意味合いを検出することができます。

主な目的は、MPM患者とアスベストに露出した健康な被験者における生殖細胞変異の有病率の比較です。

二次的な目的は、MPM患者の変異状態に応じた全生存（OS）の比較です。

この研究は、3つのフェーズで構成されます。 最初のステップでは、サンプルの収集について説明します。 MPMの影響を受けた患者は、空気学ユニットでフォローされていた患者が研究の候補者になります（30症例/年）。

それらのそれぞれについて、4mlの全血が血液吸引によって収集されます（EDTAを抗凝固剤として使用）。 同等の量の血液は、MPM患者（50症例）およびアスベストに曝露した被験者（30症例）から得られたICS Maugeriで既に実行可能なバイオバンクに由来します。 腫瘍学的バイオバンクサービスユニットは、ICS Maugeriの研究研究所にあります。 2009年に、研究目的で人間の生物学的材料の収集、保全、保管、および配布を目的とした資金提供を受けました。 Maugeri施設の腫瘍学的バイオバンクでは、さまざまな種類の癌に苦しむ患者の生物学的サンプルがこれまで保存されており（4％悪性胸膜中皮腫）、臨床既往と追跡調査が十分に記録されています。 登録された各ケースについて、書面によるインフォームドコンセントを取得した後、PIによって臨床および人口統計データが収集されます。 MPM患者は、国際的なガイドラインに従って治療され、胸部新生物（GINT）評価の学際的グループに基づいて管理されます。

プロジェクトの次のステップには、微小環境浸潤調節、薬物反応、および癌感受性に関与する遺伝子のパネルに影響を与える生殖細胞系の変動を特定することを目的とした包括的かつ詳細な発見の取り組みが含まれます。 次世代シーケンス方法を利用した腫瘍の特性評価は、現在、個別化医療の分野の最前線にあります。 ほとんどの癌タイプでは、遺伝的資産は、少数の山（腫瘍の高い割合で変化した遺伝子）とはるかに多くの丘、すなわちそれらの遺伝子がめったに変化しない丘で構成される景観として定義されるべきであることが強調されるべきです。 公開された研究により、約140の遺伝子が明らかになりました。これは、遺伝子内変異によって変化すると、腫瘍形成を促進または促進することができます。他の突然変異は乗客であり、選択的成長の利点を付与しません。 一方、いくつかの遺伝子は、生殖系統で変異体の形で遺伝したときに癌の素因となることが知られており、かなりの程度に癌で体系的に変異していません。 これらの遺伝子は、変更されたときに有意な選択的成長の利点を付与するものではなく、間接的な方法で腫瘍形成を促進することができます。 MPMの遺伝的特性は、患者間の有意な変動性とほとんど報告されていない体性異常により、これまで完全に明確にされていません。 MPMの遺伝的変化のほとんどは、腫瘍抑制遺伝子または世話人遺伝子の機能の喪失です。 発癌性依存症のコンテキストがない場合、活性化されたトランスデューサー（MTOR阻害剤、FAK阻害剤）の医薬品ターゲティングは、MPM療法を改善するための鍵を握る可能性があります。 したがって、現在のプロジェクトは、MPMの生殖系統の変動を深く調査し、MPMプロモーションに関与する宿主因子を決定するために、露出した集団を深く調査することを目的としています。 MPMの病原性生殖細胞変異体は、DNA損傷修復とクロマチンリモデリング経路にしばしば関与しており、最も頻繁に特定された生殖細胞変異はBAP1にあり、腫瘍抑制遺伝子をコードします。 そのタンパク質は、クロマチン調節、転写調節、細胞増殖、DNA修復、細胞死、および糖の代謝に重要な役割を果たす核脱ユビキチン化酵素です。

関連するすべてのデータを特定するために実行された系統的文献レビューに基づいて、微小環境浸潤変調に関与する30の遺伝子のセット（例： rbl1）、薬物反応（例 XRCC1）およびがんの素因（例： BRAC1-2）が定義されています。 このフェーズには、末梢血単核細胞（PBMC）由来のDNA上の微小環境免疫炎症に関与する遺伝子のカスタムパネルを分析することを目的とした深い変異スクリーニングに焦点を当てた最初のステップが含まれます。 次世代シーケンス（NGS）アプローチは、Illumina-ISEQ 100シーケンスシステムによって適用されます。 この研究に登録された各被験者から、総DNAは自動精製システムによって抽出され、その後、癌関連遺伝子からのすべてのコーディングエクソンのライブラリー構築と次世代シーケンスに20 ngの入力DNAが使用されます。 特定されたバリアントは、ポリフェン-2、SIFTおよびENSEMBLバリアント効果予測因子（VEP）によるバイオインフォマティクス分析に提出され、対応するアミノ酸置換がエンコードされたタンパク質の構造と機能に与える影響を評価します。 さらに、Clinvar-NCBI、GNOMAD、およびCOSMICデータベースを使用して、臨床的に重要なバリアントに注釈が付けられます。 最近の臨床研究では、患者の反応率の改善と免疫チェックポイント阻害剤の生存利益と高い腫瘍変異負担（TMB）を関連付けています。したがって、TMBはこれらの免疫療法薬の反応のバイオマーカーとして浮上しています。 さらに、生殖細胞系は腫瘍の分子表現型に影響を与え、チェックポイント阻害剤の有効性を予測できることが示されています。 これらの考慮事項から凝視して、この研究では、選択した各遺伝子の非同義変異の総数を評価することにより、生殖系腫瘍変異負荷（GTMB）も分析します。