关节内假体可以成功治疗致残性骨关节炎。然而，感染是导致失败的重要原因。充分的诊断仍然具有挑战性。将先进成像技术与内窥镜取样下一代测序相结合，应有助于定位和表征。 (PJI MAP/DEF)

对这些样本（否则将被丢弃）的残留材料进行额外DNA分析的能力，为获得假体组件上微生物组和生物膜的更准确图像提供了前景。 这是该项目的目标。 基于疑似感染的标准（肌肉骨骼感染协会和欧洲骨与关节感染协会），选定的患者通过血液、滑液、组织和骨（髓）样本分析以及X光、MRI和核扫描等成像进行标准测试。 如果基于此（第1阶段），感染的诊断和性质明确，则进行关节镜检查结合假体周围滑膜组织、骨和骨髓活检的诊断程序（第2阶段），并直接进行开放手术，在一次或两次手术中更换部分或全部假体（第3阶段），同时采集滑液、组织、骨和骨髓样本。

在第1、2或3阶段获得的所有样本都进行标准微生物学和病理学测试；然而，残留材料现在也进行细菌/真菌DNA的基因分析。 不测试患者的人类DNA。 使用单独的器械采集样本以防止交叉污染。 在假体组件内和周围采集的滑液（1至10毫升）、滑膜组织（2至6毫米³）和骨（骨髓）（2至6毫升）被收集并储存在无菌容器中进行微生物学检查，以及储存在含有甲醛的无菌容器中进行病理学检查。 每个容器都标有患者识别信息和采集位置（例如，小腿，外侧）。 一个包含6至8个标记容器的袋子被运送到微生物学实验室。 一个类似的袋子被送到病理学实验室。 每个部位总是有多余的液体、组织、骨或骨髓材料（1至2毫升或毫米³）。 这种材料通常被丢弃。 对于这个研究项目，它被收集起来，但与微生物学和病理学样本不同，这些容器仅被编码（例如，SEPTORT001（数字代表患者一）滑液，滑膜1，滑膜2，（生物膜在）髋臼，（生物膜在）股骨大转子，（生物膜）股骨中段，（生物膜在）髋关节假体柄尖）。 手术结束时，容器被收集在一个小塑料袋中。 这个袋子与一个MicroGenDx表格一起放入一个更大的塑料袋中。 该表格包含以下信息：SEPTORT和患者编号、年龄、性别、右侧或左侧、关节（髋关节、膝关节、肩关节假体…）、采集日期、初步诊断（假体周围关节感染）、骨科检查复选框、所需分析复选框（qPCR快速筛查和NGS）以及主要研究者的签名。 手术结束时，他亲自将其带到HIRUZ生物库进行交接，储存在-80°C的冷冻箱中。 一旦在几周内收集了大约五个袋子，国际快递员会取走一个包含这些袋子的纸板箱。 医学研究箱（无需干冰）由HIRUZ生物库的实验室技术员密封。 箱子通常在周二下午取走，并于次日上午（当地时间周三）到达德克萨斯州的实验室。 根据正常的临床工作量，研究样本在储存的同一天或稍后时间进行处理，进行微生物组的基因分析。 美国实验室不接收任何可能识别患者身份的数据。 基因分析结果的数据被加密并以安全格式电子传输给根特大学医院的主要研究者。 只有主要研究者和David Creytens教授有权访问此数据库。 两者都负责安全系统的持续质量控制，从而根据良好临床实践指南防止未经授权访问数据。 这项研究应使我们能够确认或排除潜在的假体感染是否确实是患者症状的原因，但它也有助于确定感染的地形——特别是它是弥漫性的还是集中在特定的假体组件中——以及微生物组和生物膜的组成。