Leddsproteser kan behandle invalidiserende artrose med suksess. Infeksjon er imidlertid en viktig årsak til svikt. Adekvat diagnostikk forblir utfordrende. Kombinasjon av avansert bildebehandling med neste generasjons sekvensering av prøver som er oppnådd endoskopisk, bør bidra til å kartlegge og karakterisere. (PJI MAP/DEF)

Muligheten til å utføre ytterligere DNA-analyse på restmaterialet fra disse prøvene (som ellers ville blitt kassert) gir utsikten til å få et mer nøyaktig bilde av mikrobioten og biofilmene som finnes på protesekomponentene. Dette er målet med prosjektet. Basert på kriterier for mistenkt infeksjon (Musculoskeletal Infection Society og European Society for Bone and Joint Infections), gjennomgår utvalgte pasienter standard testing via analyse av blod, synovialvæske, vev og bein (marg)prøver, samt bildeundersøkelser som røntgen, MR og kjernefysiske skanninger. Hvis, basert på dette (Fase 1), diagnosen og art av infeksjon er klar, fortsetter den diagnostiske prosedyren med artroskopi kombinert med periprotetiske synovialvev, bein og beinmarg biopsier (Fase 2) og går direkte til åpen kirurgi, hvor deler eller hele protesen erstattes i en eller to sesjoner (Fase 3), og synovialvæske, vev, bein og beinmargprøver også tas.

Alle prøver innhentet under Fase 1, 2 eller 3 underlegges standard mikrobiologisk og patologisk testing; imidlertid underlegges restmaterialet nå også genetisk analyse av bakteriell/sopp DNA. Pasientens menneskelige DNA testes ikke. Prøver tas med separate instrumenter for å hindre krysskontaminering. Synovialvæske (1 til 10 mL), synovialvev (2 til 6 mm³), og bein (beinmarg) (2 til 6 mL) høstet i og rundt protesekomponentene samles og lagres i sterile beholdere for mikrobiologisk undersøkelse og i sterile beholdere som inneholder formaldehyd for patologisk undersøkelse. Hver beholder merkes med pasientidentifikasjon og høststedet (f.eks., underben, lateral side). En pose som inneholder 6 til 8 merket beholdere transporteres til Mikrobiologilab. En lignende pose sendes til Patologilab. Det er alltid overskytende væske, vev, bein eller beinmargmateriale (1 til 2 ml eller mm³ per sted). Dette materialet kastes normalt. For dette forskningsprosjektet samles det, men i motsetning til de mikrobiologiske og patologiske prøvene, er disse beholderne kun kodet (f.eks., SEPTORT001 (tallet står for pasient en) synovialvæske, synovium 1, synovium 2, (biofilm i) acetabulum, (biofilm i) femur greater trochanter, (biofilm) femur mid-diafysen, (biofilm på) tuppen av stammen i en hofteprotese). Ved slutten av sesjonen samles beholderne i en liten plastpose. Denne posen plasseres i en større plastpose sammen med et MicroGenDx skjema. Dette skjemaet inneholder følgende informasjon: SEPTORT og pasientnummer, alder, kjønn, høyre eller venstre side, ledd (hofte, kne, skulderprotese…), innsamlingsdato, arbeidsdiagnose (periprotetisk leddinflamme), avkrysningsboks for ortopedisk undersøkelse, avkrysningsboks for ønsket analyse (qPCR Rapid Screening og NGS), samt hovedforskerens signatur. Ved slutten av den kirurgiske sesjonen, leverer han personlig dette til HIRUZ BioBank for overlevering for lagring i en -80°C fryser. Når omtrent fem poser er samlet over en periode på noen uker, henter en internasjonal budbærer en pappeske som inneholder disse posene. Medisinsk forskningsesken (ingen tørris nødvendig) forsegles av en labtekniker ved HIRUZ Biobank. Esken hentes vanligvis på en tirsdag ettermiddag og ankommer laboratoriet i Texas neste morgen på onsdag (lokaltid). Avhengig av den normale kliniske arbeidsmengden, behandles forskningsprøvene for genetisk analyse av mikrobioten enten samme dag eller på et senere tidspunkt etter lagring. Det amerikanske laboratoriet mottar ingen data som kan identifisere pasienten. Dataene fra resultatene av den genetiske analysen krypteres og overføres elektronisk i et sikkert format til hovedforskeren ved UZ Gent. Kun hovedforskeren og Professor David Creytens er autorisert til å få tilgang til denne databasen. Begge er ansvarlige for kontinuerlig kvalitetskontroll av sikkerhetssystemet, og forhindrer dermed uautorisert tilgang til dataene, i samsvar med retningslinjene for God klinisk praksis. Denne forskningen skal gjøre det mulig for oss å bekrefte eller utelukke om en underliggende proteseinfeksjon faktisk er årsaken til pasientens symptomer, men den kan også bidra til å bestemme topografien til infeksjonen - spesifikt, om den er diffus eller konsentrert i en spesifikk protesekomponent - samt sammensetningen av mikrobioten og biofilmene.