Podpisy RNA hostitelské krve pro diagnostiku TBC (RADIANT) (RADIANT)

Včasná a správná diagnóza TBC je zásadní pro kontrolu celosvětové epidemie TBC. Screening TBC pro pasivní vyhledávání případů závisí na symptomech a je omezen suboptimální senzitivitou, a proto je potřeba provést test rychlého třídění, který identifikuje symptomatické jedince před konfirmačním diagnostickým vyšetřením. Takový test by mohl snížit zátěž zdravotnických systémů a pacientů a urychlit doporučení, potvrzující testování a léčbu. Obecně nejsou k dispozici vhodné testy mimo sputum, a to především kvůli nedostatku biomarkerů. Třídicí test, který není založen na sputu, je nutný, protože mnoho lidí s TBC, včetně těch, kteří jsou koinfikovaní HIV a pacientů s počínajícím časným onemocněním, často nemůže produkovat vysoce kvalitní sputum, které většina současných diagnostik (stěrová mikroskopie na bázi sputa, mykobakteria Growth Indicator Tube (MGIT) 960 kapalná kultura a molekulární detekce pomocí Xpert MTB/RIF (Xpert) nebo Xpert MTB/RIF Ultra (Ultra)).

U pacientů podstupujících vyšetření plicní a/nebo mimoplicní TBC by byl optimální diagnostický test založený na krevních biomarkerech, protože krev je snadno dostupná. Imunitní reakce na M. tuberculosis (MTB) vedou k transkripčním vzorům specifickým pouze pro TBC a takové vzorce biologického podpisu se od té doby používají k přesné identifikaci pacientů s aktivní TBC. Již dříve bylo popsáno několik krevních transkripčních diagnostických signatur a tyto krevní transkripční klasifikátory detekovaly aktivní TBC mezi rasově odlišnými dospělými v USA v případové kontrolní validační studii. Tyto biomarkery jsou v blízké budoucnosti nejslibnější, pokud jde o splnění kritérií profilu cílového produktu třídění podle Světové zdravotnické organizace. Existuje však nedostatek skutečných potenciálních údajů o výkonu, zejména v afrických prostředích s vysokým endemickým výskytem TB/HIV.

Jedna nedávná studie, která používala pacienty rekrutované skupinou, na níž je založen tento návrh, poskytla první prospektivní, systematické přímé srovnání diagnostické přesnosti 27 krevních transkripčních signatur pro aktivní TBC identifikovaných v předchozím systematickém přezkumu. Tato studie umožnila identifikovat stručné signatury se signaturami Sweeney3, Kaforou25, Roe3 a BATF2 s nejvyšší diagnostickou přesností. Tato studie je však omezena velikostí vzorku a byla provedena v jedné zemi a nekomplexně necharakterizovala pacienty bez TBC, kteří měli pozitivní signaturní skóre. Proto jsou důležité další rozsáhlé, prospektivní ověřovací studie pro porovnání více transkripčních signatur v reálném světě a napříč různými epidemiologickými a geografickými lokalitami, aby bylo možné posunout transkripční signatury prostřednictvím diagnostického potrubí. Zjednodušeně řečeno, testovací vývojáři potřebují vědět, které z podpisů, které jsou nyní dostupné a relativně stručné, jsou nejslibnější.

Důležité je, že tyto signatury odrážejí zánětlivý stav hostitele. Navíc pacienti, kteří mají zvýšené signatury, ale jsou kultivačně negativní, mohou mít subklinicky počínající TBC, takže se brzy stanou kultivovaně pozitivní a rozvine se u nich incidentní aktivní TBC. Jinými slovy, v takové situaci by signatury mohly mít prospektivní prediktivní hodnotu a umožnit klinikám detekovat pacienty dříve, než budou představovat významné infekční riziko. Vzhledem k tomu, že změny krevní transkripce mohou předcházet mikrobiologickému potvrzení, zpoždění zahájení léčby až do mikrobiologické kultivace vede ke zvýšenému riziku přenosu MTB. Studie, která zahrnovala longitudinální odběr vzorků HIV-negativních dospívajících s latentní TBC, odhalila, že krevní transkripční signatury mohly detekovat subklinické počínající onemocnění až 12 měsíců před stanovením konvenční klinické diagnózy.

Také pacienti, kteří jsou signifikantně pozitivní, ale nemají aktivní TBC (klasicky definované kultivačně pozitivní sputum), jsou stále nemocní a vyžadují charakterizaci. To by mohlo informovat budoucí algoritmy, které takové pacienty vyšetřují. Vyšetřovatelé proto použijí panel multiplexní analýzy PCR s polymerázovou řetězovou reakcí v reálném čase (RT-PCR) k detekci respiračních patogenů u našich pacientů.

Vzhledem k tomu, že vysoké náklady by mohly být omezením implementace transkripčních signatur jako testu na aktivní TBC v prostředí s omezenými zdroji, může být strategie výběru pacientů se zvýšenou pravděpodobností, že budou mít TBC, aby byli před konfirmačním testováním vyšetřeni triage testem na bázi RNA. Výsledkem je cenově dostupnější diagnostický algoritmus a zlepšení nákladové efektivity testu TBC založeného na RNA. Vyšetřovatelé budou zkoumat kombinace citlivosti a specifičnosti každého předem definovaného transkripčního podpisu s dalšími testy TBC, včetně nového testu SeroSelectTB, aby zjistili, které optimální kombinace testů zlepší cenovou dostupnost testu založeného na RNA. Předchozí studie dříve používala tuto strategii pro optimální využití testu Xpert.

Tento návrh si proto klade za cíl vyhodnotit diagnostickou přesnost vybraných hostitelských transkripčních signatur v krvi symptomatických účastníků hledajících péči na dvou místních klinikách v Kapském Městě v Jižní Africe a vybraných zdravotnických zařízeních v Tanzanii a charakterizovat bakteriologicky negativní pacienty klasifikované jako non-TB určit, zda jsou zvýšené transkripční signatury hostitele spojeny s jinými respiračními patogeny (detekovány ve výtěrech z nosohltanu pomocí komerčního multiplexního panelu) nebo mohou předpovědět aktivní TBC do šesti měsíců (incidentní aktivní TBC). Vyšetřovatelé využijí jako lešení rodičovskou studii financovanou EDCTP (SeroSelectTB), což je panafrické hodnocení sérologického třídícího testu na aktivní TBC v místě péče a získávání pacientů s přetrvávajícími respiračními příznaky a provádění testování. (sérologický test SeroSelectTB, Xpert, Ultra a kultivace se provádějí ve studii SeroSelectTB) a klinické sledování pro dodržování léčby.

Hypotézy studie jsou 1) vybrané krevní transkripční signatury mají vysokou diagnostickou přesnost, definovanou jako minimálně 90% senzitivitu a 70% specificitu pro profil cílového produktu WHO pro třídicí test ve srovnání s mikrobiologickým referenčním standardem; 2) U bakteriologicky negativních pacientů klasifikovaných jako non-TB mohou výchozí transkripční signatury hostitele predikovat aktivní TB během šesti měsíců (incident TB); (3) respirační patogeny jiné než TBC u pacientů bakteriologicky negativních na TBC jsou spojeny se zvýšenými transkripčními signaturami.

Validace kandidátských hostitelských transkripčních signatur může vést k implementaci vylepšených testů na TBC, které pomohou zmírnit zátěž nemocí spojenou s TBC v subsaharské Africe a povedou ke zlepšení kvality života.