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Firmas de ARN en sangre del huésped para el diagnóstico de TB (RADIANT) (RADIANT)

20 de febrero de 2024 actualizado por: Grant Theron, University of Stellenbosch

Firmas transcripcionales seleccionadas de huéspedes concisos para el diagnóstico basado en sangre de tuberculosis activa en un entorno con prevalencia de VIH (diagnóstico de tuberculosis basado en ARN)

La tuberculosis (TB) es la principal causa infecciosa de muerte en todo el mundo y la principal causa de muerte en el África subsahariana entre los pacientes con VIH. Existe la necesidad de una prueba de triaje rápida no basada en esputo que identifique a las personas con presunción de TB que requieran una investigación diagnóstica confirmatoria. Tal prueba podría reducir la carga sobre los sistemas de salud, acelerar la derivación y las pruebas de confirmación, y el tratamiento, reduciendo así la transmisión.

Se necesita una prueba de triaje que no sea de esputo, ya que muchos pacientes sintomáticos, incluidos aquellos con VIH, a menudo no pueden producir esputo de alta calidad (en el que se basan la mayoría de los diagnósticos actuales). Varias firmas diagnósticas transcripcionales de la sangre producidas debido a las respuestas inmunitarias a la infección por M. tuberculosis se han descrito previamente, sin embargo, faltan datos de rendimiento en el mundo real, especialmente en entornos africanos con alta endemia de TB/VIH donde las tasas de VIH (que podrían comprometer la sensibilidad) y TB previa (que podría comprometer la especificidad) son elevados. Además, al basarse en investigaciones anteriores que utilizaron enfoques de secuenciación no dirigidos para identificar firmas candidatas, los investigadores ahora están en una etapa para realizar la medición de firma dirigida a gran escala y de manera rentable como parte de los análisis prospectivos de precisión diagnóstica en el mundo real. ajustes.

Utilizando el marco proporcionado por un estudio principal financiado por EDCTP (SeroSelectTB; PI Holm-Hansen), que es una evaluación panafricana de una prueba serológica en el punto de atención para la TB activa, RADIANT tiene una oportunidad única de llevar a cabo varias investigaciones importantes preguntas. Los objetivos de RADIANT son 1) evaluar la sensibilidad y la especificidad de firmas transcripcionales seleccionadas de huéspedes periféricos concisos para la TB activa entre personas sintomáticas (en Sudáfrica = 1260 y Tanzania = 840); 2) diseñar un algoritmo de diagnóstico de costo optimizado basado en firmas transcripcionales, resultados de SeroSelectTB y pruebas bacteriológicas confirmatorias, y 3) caracterizar a los pacientes bacteriológicamente negativos clasificados como sin TB para determinar si aquellos con firmas transcripcionales elevadas del huésped (n=100 esperado) tiene otros patógenos respiratorios (detectados en hisopos nasofaríngeos usando un panel multiplex comercial) y/o desarrolla TB activa dentro de los seis meses (incidente de TB activa).

Descripción general del estudio

Descripción detallada

El diagnóstico oportuno y correcto de la TB es vital para el control de la epidemia mundial de TB. El cribado de TB para la detección pasiva de casos se basa en los síntomas y está limitado por su sensibilidad subóptima, por lo que se necesita una prueba de triaje rápida que identifique a las personas sintomáticas antes de la investigación diagnóstica confirmatoria. Tal prueba podría reducir la carga sobre los sistemas de salud y los pacientes, y acelerar la derivación, las pruebas de confirmación y el tratamiento. En general, no se dispone de pruebas adecuadas que no sean de esputo, y esto se debe principalmente a la falta de biomarcadores. Se requiere una prueba de triaje no basada en esputo ya que muchas personas con TB, incluidas aquellas coinfectadas con VIH y aquellas con enfermedad temprana incipiente, a menudo no pueden producir esputo de alta calidad, que la mayoría de los diagnósticos actuales (microscopía de frotis basada en esputo, Mycobacteria Cultivo líquido del tubo indicador de crecimiento (MGIT) 960 y detección molecular por Xpert MTB/RIF (Xpert) o Xpert MTB/RIF Ultra (Ultra)).

En pacientes sometidos a evaluaciones de TB pulmonar y/o extrapulmonar, una prueba diagnóstica basada en biomarcadores sanguíneos sería óptima, ya que la sangre es fácilmente obtenible. Las respuestas inmunitarias a M. tuberculosis (MTB) conducen a patrones transcripcionales específicos solo para la TB, y dichos patrones de firma biológica se han utilizado desde entonces para identificar con precisión a los pacientes con TB activa. Varias firmas diagnósticas transcripcionales de sangre se han descrito previamente, y estos clasificadores transcripcionales de sangre detectaron TB activa entre adultos racialmente diversos en los EE. UU. en un estudio de validación de casos y controles. Estos biomarcadores son los más prometedores en el futuro cercano para cumplir con los criterios de perfil de producto objetivo de la prueba de triaje de la Organización Mundial de la Salud. Sin embargo, hay una falta de datos de desempeño prospectivo del mundo real, especialmente en entornos africanos con alta endemia de TB/VIH.

Un estudio reciente, que utilizó pacientes reclutados por el grupo en el que se basa esta propuesta, brindó la primera comparación directa prospectiva y sistemática de la precisión diagnóstica de 27 firmas transcripcionales de sangre para la TB activa identificadas a través de una revisión sistemática anterior. Este estudio permitió identificar firmas concisas con las firmas Sweeney3, Kaforou25, Roe3 y BATF2 que tienen la mayor precisión diagnóstica. Sin embargo, este estudio tiene un tamaño de muestra limitado y se realizó en un solo país y no caracterizó de manera integral a los pacientes sin TB que tenían una puntuación característica positiva. Por lo tanto, más estudios de validación prospectivos a gran escala para comparar múltiples firmas transcripcionales en entornos del mundo real y en múltiples ubicaciones epidemiológicas y geográficas son importantes para avanzar en las firmas transcripcionales a través de la tubería de diagnóstico. En pocas palabras, los desarrolladores de pruebas necesitan saber cuál, de las firmas que están disponibles ahora y son relativamente concisas, es la más prometedora.

Es importante destacar que estas firmas reflejan el estado inflamatorio del huésped. Además, los pacientes que tienen firmas elevadas pero cuyo cultivo es negativo pueden tener una TB incipiente subclínica, ya que en poco tiempo tendrán un cultivo positivo y desarrollarán una TB activa incidental. En otras palabras, en tal situación, las firmas podrían tener un valor predictivo prospectivo y permitir que las clínicas detecten pacientes antes de que representen un riesgo infeccioso significativo. Dado que los cambios en la transcripción de la sangre pueden ser anteriores a la confirmación microbiológica, el retraso en el inicio del tratamiento en espera del cultivo microbiológico conduce a un mayor riesgo de transmisión de MTB. Un estudio que incluyó muestras longitudinales de adolescentes VIH negativos con TB latente reveló que las firmas transcripcionales de la sangre podían detectar la enfermedad incipiente subclínica hasta 12 meses antes de que se hiciera un diagnóstico clínico convencional.

Además, los pacientes que son positivos para la firma pero que no tienen TB activa (esputo con cultivo positivo definido clásicamente) todavía están enfermos y requieren caracterización. Esto podría informar a futuros algoritmos que investiguen a estos pacientes. Por lo tanto, los investigadores aplicarán un panel de ensayo multiplex de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (RT-PCR) para detectar patógenos respiratorios en nuestros pacientes.

Dado que los altos costos podrían ser una limitación para la implementación de firmas transcripcionales como una prueba para la TB activa en entornos con recursos limitados, una estrategia para seleccionar pacientes con mayor probabilidad de tener TB, para ser examinados mediante una prueba de triaje basada en ARN antes de la prueba de confirmación puede dar como resultado un algoritmo de diagnóstico más asequible y mejorar la rentabilidad de la prueba de TB basada en ARN. Los investigadores explorarán combinaciones de sensibilidad y especificidad de cada firma transcripcional predefinida con otras pruebas de TB, incluida la nueva prueba SeroSelectTB, para detectar qué combinaciones de pruebas óptimas mejorarán la asequibilidad del ensayo basado en ARN. Un estudio anterior había empleado anteriormente esta estrategia para el uso óptimo de la prueba Xpert.

Por lo tanto, esta propuesta tiene como objetivo evaluar la precisión diagnóstica de las firmas transcripcionales del huésped seleccionado en la sangre de los participantes sintomáticos que buscan atención en dos clínicas locales en Ciudad del Cabo, Sudáfrica y centros de salud seleccionados en Tanzania, y caracterizar a los pacientes bacteriológicamente negativos clasificados como no TB para Determinar si las firmas transcripcionales elevadas del huésped están asociadas con otros patógenos respiratorios (detectados en hisopos nasofaríngeos mediante un panel multiplex comercial) o pueden predecir la TB activa dentro de los seis meses (TB activa incidente). Los investigadores utilizarán, como andamiaje, el estudio principal financiado por el EDCTP (SeroSelectTB), que es una evaluación panafricana de una prueba de triaje serológica en el punto de atención para la TB activa, y el reclutamiento de pacientes con síntomas respiratorios persistentes, y la realización de pruebas (en el estudio SeroSelectTB se realizan la prueba serológica SeroSelectTB, Xpert, Ultra y cultivo) y seguimiento clínico para la adherencia al tratamiento.

Las hipótesis del estudio son 1) las firmas transcripcionales de sangre seleccionadas tienen una alta precisión diagnóstica, definida como un mínimo de 90 % de sensibilidad y 70 % de especificidad para el perfil de producto objetivo de la OMS para una prueba de triaje, en comparación con un estándar microbiológico de referencia; 2) En pacientes bacteriológicamente negativos clasificados como sin TB, las firmas transcripcionales iniciales del huésped pueden predecir la TB activa dentro de los seis meses (TB incidente); (3) los patógenos respiratorios distintos de la TB en pacientes bacteriológicamente negativos para la TB están asociados con firmas transcripcionales elevadas.

La validación de las firmas transcripcionales del huésped candidato puede conducir a la implementación de pruebas de TB mejoradas, lo que ayudará a aliviar la carga de la enfermedad asociada con la TB en el África subsahariana y conducirá a una mejor calidad de vida.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Estimado)

1000

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Estudio Contacto

  • Nombre: Anna Okunola, PhD
  • Número de teléfono: +27834925284
  • Correo electrónico: annaojo@sun.ac.za

Copia de seguridad de contactos de estudio

  • Nombre: Grant Theron, PhD
  • Número de teléfono: +27219389693
  • Correo electrónico: gtheron@sun.ac.za

Ubicaciones de estudio

    • Western Cape
      • Cape Town, Western Cape, Sudáfrica, 7505
        • Reclutamiento
        • Stellenbosch University
        • Contacto:
          • Anna Okunola, PhD
          • Número de teléfono: +27834925284
          • Correo electrónico: annaojo@sun.ac.za
        • Contacto:
          • Grant Theron, PhD
          • Número de teléfono: +27219389693
          • Correo electrónico: gtheron@sun.ac.za

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

18 años y mayores (Adulto, Adulto Mayor)

Acepta Voluntarios Saludables

No

Método de muestreo

Muestra no probabilística

Población de estudio

Adultos de 18 años de edad y mayores que se autoinforman en los centros de atención médica seleccionados en Ciudad del Cabo, Sudáfrica y Tanzania, que buscan atención médica debido a síntomas que sugieren tuberculosis dentro del estudio principal SeroSelectTB y dan su consentimiento para RADIANT.

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Adultos mayores de 18 años
  • Consentimiento informado por escrito firmado o consentimiento oral presenciado en caso de analfabetismo, antes de emprender cualquier actividad relacionada con el estudio.
  • No se encuentra bien y se sospecha que tiene tuberculosis o neumonía.

Criterio de exclusión:

  • Actualmente recibiendo tratamiento para la TB
  • En los últimos 3 meses, los participantes han estado en tratamiento contra la TB durante 30 días o más
  • Recibió tratamiento dentro de 1 mes

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Modelos observacionales: Grupo
  • Perspectivas temporales: Futuro

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Valide las firmas transcripcionales concisas del host para la TB activa
Periodo de tiempo: 24 meses
El rendimiento diagnóstico de las firmas transcripcionales de sangre predescritas Sweeney3, Kaforou25, Roe3 y BATF2 para la TB activa se mide con el ensayo NanoString nCounter personalizado de NanoString Technologies al inicio del estudio.
24 meses

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Caracterización de microorganismos respiratorios
Periodo de tiempo: 24 meses
La caracterización de patógenos respiratorios distintos de Mycobacterium tuberculosis en no TB se mide mediante un panel de patógenos respiratorios basado en secuenciación de próxima generación (NGS) al inicio del estudio.
24 meses
Detección de Incidentes de TB activa
Periodo de tiempo: 24 meses
La TB activa incidente se detecta utilizando cultivo líquido MGIT 960 en el mes 6, en pacientes sin TB al inicio del estudio con lecturas de firmas transcripcionales elevadas.
24 meses

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Investigadores

  • Investigador principal: Anna Okunola, PhD, University of Stellenbosch

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

23 de junio de 2022

Finalización primaria (Estimado)

31 de mayo de 2024

Finalización del estudio (Estimado)

1 de septiembre de 2024

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

12 de septiembre de 2022

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

12 de septiembre de 2022

Publicado por primera vez (Actual)

15 de septiembre de 2022

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

22 de febrero de 2024

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

20 de febrero de 2024

Última verificación

1 de febrero de 2024

Más información

Términos relacionados con este estudio

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

Descripción del plan IPD

Los datos de identificación individual (demográficos, clínicos y de laboratorio) acumulados durante el proyecto se almacenarán en una base de datos electrónica protegida con contraseña, REDCap. Los datos se anonimizarán y los nombres o direcciones de los pacientes no se almacenarán en la base de datos. A los pacientes se les asigna un número de estudio que se utilizará para la documentación del estudio y los informes anuales de progreso. Los conjuntos de datos de perfiles transcripcionales generados durante el estudio actual se almacenarán en un repositorio disponible públicamente, como los repositorios de datos Gene Expression Omnibus (GEO) del Instituto Europeo de Bioinformática y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), al mismo tiempo que se publican los manuscritos.

Marco de tiempo para compartir IPD

Los datos se compartirán un año después de la finalización del estudio.

Criterios de acceso compartido de IPD

Cualquiera que esté interesado en acceder a los datos puede comunicarse con la Dra. Anna Okunola por correo electrónico (annaojo@sun.ac.za) y se les dará acceso para anonimizar los datos previa solicitud razonable, después de la publicación del manuscrito principal del estudio. El solicitante también deberá firmar un Acuerdo de transferencia de datos (DTA) con la Universidad de Stellenbosch.

Tipo de información de apoyo para compartir IPD

  • PROTOCOLO DE ESTUDIO
  • CIF

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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