Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Utility of Whole Genome Sequencing in Fetuses With Abnormal Ultrasound Findings

Clinical Study on Prenatal Diagnosis of Fetal Abnormalities of Unknown Cause Using Whole-Genome Sequencing: A Multicenter Study

The goal of this observational study is to learn if whole-genome sequencing (WGS) can help find the genetic cause in fetuses with structural abnormalities that remain unexplained after standard genetic testing (such as karyotyping, chromosomal microarray, or whole-exome sequencing). It will also learn how WGS results may affect pregnancy management and family decision-making.

The main questions it aims to answer are:

How often does WGS identify a genetic cause in these fetuses? Does WGS find more genetic causes compared to standard genetic tests? Can combining WGS with other molecular analyses help discover new disease genes or pathways? Researchers will compare WGS results to results from standard genetic tests to see if WGS finds more genetic causes.

Participants are pregnant women whose fetuses have structural abnormalities seen on ultrasound or MRI, with negative results from routine genetic testing. Participants will:

Undergo an invasive procedure (such as amniocentesis) or provide postnatal samples as part of their regular medical care Allow the use of leftover samples for WGS and additional molecular studies Be followed until after delivery to collect information on pregnancy outcomes and neonatal health

Přehled studie

Postavení

Nábor

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Odhadovaný)

1000

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

  • Jméno: Qiong Luo
  • Telefonní číslo: +86 571 89998819
  • E-mail: luoq@zju.edu.cn

Studijní místa

    • Zhejiang
      • Hangzhou, Zhejiang, Čína, 310006
        • Nábor
        • Women's Hospital School of Medicine Zhejiang University
        • Kontakt:
      • Huzhou, Zhejiang, Čína, 313000
        • Nábor
        • Huzhou Maternity & Child Care Hospital
        • Kontakt:
      • Quzhou, Zhejiang, Čína, 324000
        • Nábor
        • Quzhou Maternal and Child Health Care Hospital
        • Kontakt:
      • Shaoxing, Zhejiang, Čína, 312000
        • Nábor
        • Shaoxing Maternity & Child Care Hospital
        • Kontakt:

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

  • Dospělý
  • Starší dospělý

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Pregnant women aged 18 years or older with singleton pregnancies, whose fetuses have structural abnormalities detected by ultrasound or MRI between 11+0 and 32+0 weeks of gestation, and who are scheduled to undergo invasive or postnatal genetic diagnostic procedures.

Popis

Inclusion Criteria:

  1. Pregnant women aged ≥ 18 years.
  2. Singleton pregnancy.
  3. Gestational age between 11+0 and 32+0 weeks, with ultrasound or MRI indicating a definite structural malformation in the fetus (may be with or without soft marker abnormalities) requiring prenatal diagnosis (see Appendices 1 and 2). Fetal developmental abnormalities include those of the central nervous system, cardiovascular system, craniofacial/neck region, chest/mediastinum, abdomen/digestive tract, urinary system, skeletal system/limbs, and systemic abnormalities such as fetal hydrops, abnormally thickened placenta with hydrops, and severe growth restriction. Criteria for ultrasound soft markers and structural malformations are provided in the appendices.
  4. Planned to undergo at least one invasive or postnatal procedure for genetic diagnosis, and consent to the use of residual diagnostic samples for research testing.
  5. Signed unified informed consent form, agreement to follow-up, and consent for storage and submission of samples and data according to the protocol.

Exclusion Criteria:

  1. Age < 18 years or individuals lacking full capacity for civil conduct.
  2. Twin or multiple pregnancies.
  3. Known parental or familial carrier status of a pathogenic variant highly consistent with the current fetal phenotype, where testing is planned only for targeted confirmation.
  4. Refusal to consent to the storage and use of samples and data for this study.
  5. Other conditions deemed unsuitable for participation in this study by the investigator.

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Diagnostic yield of WGS
Časové okno: 8 weeks after enrollment of the last participant
Proportion of fetuses with structural malformations or significant ultrasound abnormalities in whom whole-genome sequencing (WGS) using fetal and related tissues identifies at least one pathogenic or likely pathogenic variant. Overall diagnostic yield (including pathogenic/likely pathogenic variants and variants of uncertain significance reclassified as pathogenic/likely pathogenic based on additional evidence) will also be reported.
8 weeks after enrollment of the last participant
Comparison of diagnostic increment of WGS vs. standard clinical testing pathway
Časové okno: 12 weeks after enrollment of the last participant
Difference in diagnostic rate (proportion of fetuses with pathogenic/likely pathogenic variants) between whole-genome sequencing (WGS) and the current standard clinical testing pathway (karyotyping, CMA/CNV-seq, WES/panel). Stratified analysis by malformation type (e.g., isolated CNS, cardiac, skeletal, multiple systems) and by pattern of system involvement will be reported.
12 weeks after enrollment of the last participant
Number of novel candidate disease genes and enriched molecular pathways
Časové okno: At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Count of novel candidate disease genes or regulatory elements identified by integrated multi-omics analysis. List of enriched KEGG pathways and GO terms (with FDR < 0.05) associated with fetal developmental abnormalities.
At study completion (average 24 months after first participant enrollment)

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Phenotypic stratification system and gene pathway enrichment results
Časové okno: At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Phenotypic classification system (based on organ/system involvement: isolated, multiple, syndromic). For each subtype: (1) count and frequency of pathogenic/likely pathogenic variants; (2) count of variant types (SNV, Indel, SV, CNV); (3) list of enriched KEGG pathways and GO terms with FDR < 0.05.
At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Reclassification rate of variants of uncertain significance (VUS) and impact on counseling decisions
Časové okno: At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Proportion of VUS reclassified to pathogenic/likely pathogenic or benign/likely benign after multi-omics integration. Number of participants/families with altered genetic counseling or clinical decision-making (e.g., termination, prenatal intervention, postnatal follow-up plan) due to reclassification.
At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Establishment of a multicenter database and biobank
Časové okno: At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
A unified, relational database containing de-identified clinical phenotypes, genotypes (WGS variants), multi-omics data (e.g., transcriptomic, epigenomic), and biospecimen inventory (e.g., DNA, RNA, plasma, tissue blocks) from participating centers. Database completion will be defined as ≥90% of expected participants with all required data types uploaded and quality-controlled. Biobank completion will be defined as ≥90% of expected biospecimens collected, processed, and stored with traceable metadata.
At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Standardized data submission and sharing protocols
Časové okno: At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Completion of a written protocol document (yes/no) covering sample submission, data formats, quality thresholds, reporting template (ACMG/AMP classification), clinical data dictionary, and de-identification rules, with sign-off obtained from all participating centers' principal investigators and data managers.
At study completion (average 24 months after first participant enrollment)

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

12. března 2026

Primární dokončení (Odhadovaný)

12. září 2027

Dokončení studie (Odhadovaný)

12. března 2028

Termíny zápisu do studia

První předloženo

9. dubna 2026

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

20. května 2026

První zveřejněno (Aktuální)

26. května 2026

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

26. května 2026

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

20. května 2026

Naposledy ověřeno

1. března 2026

Více informací

Termíny související s touto studií

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Onemocnění plodu

Předplatit