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Serotonin Variants & Gut Microbiota in Mental Health: Pilot Study

4. Juni 2026 aktualisiert von: Neurobiologix

Association Between Serotonin Pathway Genetic Variants and Tryptophan-Metabolizing Gut Microbiota in Adults With Mental Health Conditions: An Observational Pilot Study

This observational pilot study investigates whether a broad panel of genetic variants relevant to the serotonin pathway (including serotonergic system, methylation cycle, intestinal barrier integrity, and inflammatory response genes) are associated with distinct gut microbiome compositional and functional signatures in adults aged 18-44 years with self-reported mental health conditions (Major Depressive Disorder, Generalized Anxiety Disorder, PTSD, or Panic Disorder).

This is a decentralized, participant-funded (Citizen Science) study. Eligible participants provide at-home saliva (buccal swab) and stool samples. Genomic analysis is performed using the NeuroBiologix GenePro+ SNP Panel (Illumina Infinium Global Screening Array-24, ~654,000 SNPs) via Gene By Gene, a CLIA/CAP-accredited laboratory. Gut microbiome analysis is performed by Tiny Health using deep whole-genome shotgun metagenomics (≥20 million reads) on a NextGen Illumina Platform.

The study is non-interventional and hypothesis-generating, aiming to identify potential genotype-microbiome associations and estimate effect sizes to inform a future interventional trial. N=30 participants. Study Start: July 2026.

Studienübersicht

Detaillierte Beschreibung

Background: The gut-brain-microbiota axis (GBA) represents a complex, bidirectional communication system. Microbial tryptophan metabolism is a key mechanism within this axis - approximately 95% of the body's serotonin is synthesized peripherally in the gut. Host genetic variants can influence both serotonin biology and gut microbiome composition.

Objective: To explore correlations between multi-system genetic variants (TPH2, SLC6A4, MTHFR, FUT2, MUC1, IL-6, and others) and gut microbiome compositional and functional profiles (particularly tryptophan metabolism pathways) in adults with self-reported mental health conditions.

Design: Decentralized observational pilot study. Participants complete digital questionnaires and provide at-home biospecimen collections (saliva and stool) using prepaid medical-grade kits.

Genomic Methodology: Saliva samples undergo DNA extraction and array-based genotyping (Illumina GSA-24 v3.0) at Gene By Gene (CLIA No. 45D1102202, CAP-accredited). Data processed via OmicsEdge bioinformatics platform.

Metagenomic Methodology: Stool samples analyzed by Tiny Health using whole-genome shotgun metagenomics. Human reads are depleted against GRCh38. Taxonomic profiling via GTDB/GenBank database (111,000+ genomes). Functional annotation via KEGG Orthology and CAZy.

Statistical Analysis: Descriptive statistics; alpha diversity (Shannon index); beta diversity (Bray-Curtis dissimilarity); PERMANOVA; exploratory non-parametric comparisons between genotype-defined groups. Effect sizes calculated for future study design.

IRB: Approved by Sterling Institutional Review Board (Atlanta, GA), IRB ID 16153.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Geschätzt)

30

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienkontakt

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Erwachsene

Akzeptiert gesunde Freiwillige

N/A

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

US adults aged 18-44 years with self-reported MDD, GAD, PTSD, or Panic Disorder. Recruited via Neurobiologix and Tiny Health digital platforms and social media. Decentralized, direct-to-participant model.

Beschreibung

Inclusion Criteria:

  1. Age: Adults aged 18 to 44 years.
  2. Residency: Current legal residents of the United States.
  3. Clinical Phenotype: Self-report of Major Depressive Disorder (MDD), Generalized Anxiety Disorder (GAD), Post-Traumatic Stress Disorder (PTSD), or Panic Disorder.
  4. Medication Stability: If currently prescribed psychotropic medications (e.g., SSRIs, SNRIs, benzodiazepines), the dosage must remain stable with no changes in molecule or quantity for at least 3 months prior to enrollment.
  5. Language and Technology: Proficiency in English and access to a smartphone or computer for digital data entry.
  6. Financial Commitment: Explicit agreement to the "Citizen Science" model, including payment for discounted testing kits. Kit shipping (both directions) is prepaid by the study.

Exclusion Criteria:

  1. Use of systemic antibiotics, antifungals, or antivirals within the 8 weeks prior to specimen collection.
  2. Regular use of commercial probiotics or concentrated prebiotic supplements within 4 weeks of collection.
  3. Frequent use of osmotic or stimulant laxatives, or motility agents, within 4 weeks of collection.
  4. Chronic use (>3 times/week) of NSAIDs, systemic corticosteroids, or high-dose Omega-3 supplementation (>2g/day) within 4 weeks of enrollment.
  5. Use of weight-loss medications or GLP-1 receptor agonists (e.g., semaglutide, liraglutide, tirzepatide) within the 3 months prior to enrollment.
  6. Confirmed diagnosis of Irritable Bowel Syndrome (IBS), Inflammatory Bowel Disease (Crohn's or Ulcerative Colitis), Celiac Disease, or history of major gastric/intestinal resection.
  7. Current pregnancy or lactation.
  8. Presence of cognitive impairments that preclude the ability to provide informed consent.
  9. Individuals undergoing active cancer treatment.

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Adults with Mental Health Conditions
US adults aged 18-44 years with self-reported MDD, GAD, PTSD, or Panic Disorder who are on stable psychotropic medication (or unmedicated). Participants provide at-home saliva and stool samples for genomic SNP analysis (NeuroBiologix GenePro+ SNP Panel) and gut microbiome shotgun metagenomics sequencing (Tiny Health platform).
Genomic analysis using NeuroBiologix GenePro+ SNP Panel: Illumina Infinium Global Screening Array-24 v3.0 (~654,000 SNPs), genotyped at Gene By Gene (CLIA No. 45D1102202, CAP-accredited). Data processed via OmicsEdge bioinformatics platform analyzing serotonergic, methylation, intestinal barrier, and inflammatory pathway variants. Gut microbiome analysis using Tiny Health deep whole-genome shotgun metagenomics (NextGen Illumina Platform, ≥20 million reads), with taxonomic profiling (GTDB/GenBank) and functional annotation (KEGG Orthology, CAZy).

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Gut Microbiome Compositional and Functional Profile
Zeitfenster: At study completion (approximately 8-12 weeks after enrollment)
Shotgun metagenomic sequencing of stool samples to assess gut microbial taxonomic composition (alpha and beta diversity) and functional potential, specifically tryptophan metabolism pathways (KEGG Orthology), and their association with host genetic variants in the serotonin pathway.
At study completion (approximately 8-12 weeks after enrollment)

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Geschätzt)

1. Juli 2026

Primärer Abschluss (Geschätzt)

1. Juli 2027

Studienabschluss (Geschätzt)

1. September 2027

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

4. Juni 2026

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

4. Juni 2026

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

8. Juni 2026

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

8. Juni 2026

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

4. Juni 2026

Zuletzt verifiziert

1. Juni 2026

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

NEIN

Beschreibung des IPD-Plans

Individual participant data will not be shared due to the sensitive nature of genomic and mental health data. De-identified aggregate data and findings will be reported in peer-reviewed publications.

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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