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Serotonin Variants & Gut Microbiota in Mental Health: Pilot Study

4 giugno 2026 aggiornato da: Neurobiologix

Association Between Serotonin Pathway Genetic Variants and Tryptophan-Metabolizing Gut Microbiota in Adults With Mental Health Conditions: An Observational Pilot Study

This observational pilot study investigates whether a broad panel of genetic variants relevant to the serotonin pathway (including serotonergic system, methylation cycle, intestinal barrier integrity, and inflammatory response genes) are associated with distinct gut microbiome compositional and functional signatures in adults aged 18-44 years with self-reported mental health conditions (Major Depressive Disorder, Generalized Anxiety Disorder, PTSD, or Panic Disorder).

This is a decentralized, participant-funded (Citizen Science) study. Eligible participants provide at-home saliva (buccal swab) and stool samples. Genomic analysis is performed using the NeuroBiologix GenePro+ SNP Panel (Illumina Infinium Global Screening Array-24, ~654,000 SNPs) via Gene By Gene, a CLIA/CAP-accredited laboratory. Gut microbiome analysis is performed by Tiny Health using deep whole-genome shotgun metagenomics (≥20 million reads) on a NextGen Illumina Platform.

The study is non-interventional and hypothesis-generating, aiming to identify potential genotype-microbiome associations and estimate effect sizes to inform a future interventional trial. N=30 participants. Study Start: July 2026.

Panoramica dello studio

Stato

Non ancora reclutamento

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

Background: The gut-brain-microbiota axis (GBA) represents a complex, bidirectional communication system. Microbial tryptophan metabolism is a key mechanism within this axis - approximately 95% of the body's serotonin is synthesized peripherally in the gut. Host genetic variants can influence both serotonin biology and gut microbiome composition.

Objective: To explore correlations between multi-system genetic variants (TPH2, SLC6A4, MTHFR, FUT2, MUC1, IL-6, and others) and gut microbiome compositional and functional profiles (particularly tryptophan metabolism pathways) in adults with self-reported mental health conditions.

Design: Decentralized observational pilot study. Participants complete digital questionnaires and provide at-home biospecimen collections (saliva and stool) using prepaid medical-grade kits.

Genomic Methodology: Saliva samples undergo DNA extraction and array-based genotyping (Illumina GSA-24 v3.0) at Gene By Gene (CLIA No. 45D1102202, CAP-accredited). Data processed via OmicsEdge bioinformatics platform.

Metagenomic Methodology: Stool samples analyzed by Tiny Health using whole-genome shotgun metagenomics. Human reads are depleted against GRCh38. Taxonomic profiling via GTDB/GenBank database (111,000+ genomes). Functional annotation via KEGG Orthology and CAZy.

Statistical Analysis: Descriptive statistics; alpha diversity (Shannon index); beta diversity (Bray-Curtis dissimilarity); PERMANOVA; exploratory non-parametric comparisons between genotype-defined groups. Effect sizes calculated for future study design.

IRB: Approved by Sterling Institutional Review Board (Atlanta, GA), IRB ID 16153.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Stimato)

30

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Adulto

Accetta volontari sani

N/A

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

US adults aged 18-44 years with self-reported MDD, GAD, PTSD, or Panic Disorder. Recruited via Neurobiologix and Tiny Health digital platforms and social media. Decentralized, direct-to-participant model.

Descrizione

Inclusion Criteria:

  1. Age: Adults aged 18 to 44 years.
  2. Residency: Current legal residents of the United States.
  3. Clinical Phenotype: Self-report of Major Depressive Disorder (MDD), Generalized Anxiety Disorder (GAD), Post-Traumatic Stress Disorder (PTSD), or Panic Disorder.
  4. Medication Stability: If currently prescribed psychotropic medications (e.g., SSRIs, SNRIs, benzodiazepines), the dosage must remain stable with no changes in molecule or quantity for at least 3 months prior to enrollment.
  5. Language and Technology: Proficiency in English and access to a smartphone or computer for digital data entry.
  6. Financial Commitment: Explicit agreement to the "Citizen Science" model, including payment for discounted testing kits. Kit shipping (both directions) is prepaid by the study.

Exclusion Criteria:

  1. Use of systemic antibiotics, antifungals, or antivirals within the 8 weeks prior to specimen collection.
  2. Regular use of commercial probiotics or concentrated prebiotic supplements within 4 weeks of collection.
  3. Frequent use of osmotic or stimulant laxatives, or motility agents, within 4 weeks of collection.
  4. Chronic use (>3 times/week) of NSAIDs, systemic corticosteroids, or high-dose Omega-3 supplementation (>2g/day) within 4 weeks of enrollment.
  5. Use of weight-loss medications or GLP-1 receptor agonists (e.g., semaglutide, liraglutide, tirzepatide) within the 3 months prior to enrollment.
  6. Confirmed diagnosis of Irritable Bowel Syndrome (IBS), Inflammatory Bowel Disease (Crohn's or Ulcerative Colitis), Celiac Disease, or history of major gastric/intestinal resection.
  7. Current pregnancy or lactation.
  8. Presence of cognitive impairments that preclude the ability to provide informed consent.
  9. Individuals undergoing active cancer treatment.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Adults with Mental Health Conditions
US adults aged 18-44 years with self-reported MDD, GAD, PTSD, or Panic Disorder who are on stable psychotropic medication (or unmedicated). Participants provide at-home saliva and stool samples for genomic SNP analysis (NeuroBiologix GenePro+ SNP Panel) and gut microbiome shotgun metagenomics sequencing (Tiny Health platform).
Test diagnostico: SNP Genotyping and Gut Metagenomics
Genomic analysis using NeuroBiologix GenePro+ SNP Panel: Illumina Infinium Global Screening Array-24 v3.0 (~654,000 SNPs), genotyped at Gene By Gene (CLIA No. 45D1102202, CAP-accredited). Data processed via OmicsEdge bioinformatics platform analyzing serotonergic, methylation, intestinal barrier, and inflammatory pathway variants. Gut microbiome analysis using Tiny Health deep whole-genome shotgun metagenomics (NextGen Illumina Platform, ≥20 million reads), with taxonomic profiling (GTDB/GenBank) and functional annotation (KEGG Orthology, CAZy).

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Gut Microbiome Compositional and Functional Profile
Lasso di tempo: At study completion (approximately 8-12 weeks after enrollment)
Shotgun metagenomic sequencing of stool samples to assess gut microbial taxonomic composition (alpha and beta diversity) and functional potential, specifically tryptophan metabolism pathways (KEGG Orthology), and their association with host genetic variants in the serotonin pathway.
At study completion (approximately 8-12 weeks after enrollment)

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

Neurobiologix

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Stimato)

1 luglio 2026

Completamento primario (Stimato)

1 luglio 2027

Completamento dello studio (Stimato)

1 settembre 2027

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

4 giugno 2026

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

4 giugno 2026

Primo Inserito (Effettivo)

8 giugno 2026

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

8 giugno 2026

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

4 giugno 2026

Ultimo verificato

1 giugno 2026

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • 16153

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Descrizione del piano IPD

Individual participant data will not be shared due to the sensitive nature of genomic and mental health data. De-identified aggregate data and findings will be reported in peer-reviewed publications.

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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