Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Laboratory Study of Lymphoblasts in Young Patients With High-Risk Acute Lymphoblastic Leukemia

perjantai 13. toukokuuta 2016 päivittänyt: Children's Oncology Group

Childhood Cancer Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments (TARGET) Initiative High-Risk ALL Pilot Project: Application of Array-Based Methods and Gene Re-Sequencing to Identify Candidate Molecular Targets for High-Risk Pediatric Acute Lymphoblastic Leukemia

RATIONALE: Collecting and storing samples of bone marrow and blood from patients with cancer to study in the laboratory may help doctors learn more about changes that may occur in DNA and identify biomarkers related to cancer.

PURPOSE: This laboratory study is looking at lymphoblasts in young patients with high-risk acute lymphoblastic leukemia.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Yksityiskohtainen kuvaus

OBJECTIVES:

  • Identify regions of copy number abnormalities (CNA) and uniparental disomy in leukemic lymphoblasts from pediatric patients with high-risk acute lymphoblastic leukemia (ALL) using Affymetrix GeneChip Mapping 500K array sets. (Pilot project)
  • Identify regions of CNA and loss-of-heterozygosity using Affymetrix SNP 6.0 microarrays. (Expansion project)
  • Define gene expression profiles for leukemic lymphoblasts using Affymetrix U133 Plus 2.0 arrays.
  • Assess the global expression of microRNAs in leukemic lymphoblasts using microRNA gene chips.
  • Utilize array-generated gene expression data and data for CNAs and uniparental disomy to prioritize candidate genes and genomic regions for resequencing.
  • Characterize epigenomic profiles using the HpaII tiny fragment Enrichment by Ligation-mediated PCR (HELP) assay. (Expansion project)
  • Discover candidate therapeutic targets for these patients by identifying genes that are consistently mutated in leukemic lymphoblasts using high-throughput focused gene resequencing. (Pilot project)
  • Discover candidate therapeutic targets for these patients by next generation sequencing technologies, including whole genome, whole transcriptome, and whole exome. (Expansion project)

OUTLINE: This is a multicenter study.

Banked biological samples (bone marrow and peripheral blood) are analyzed using gene expression profiling, single-nucleotide polymorphism and genotyping assays, DNA copy number and loss of heterozygosity estimates, epigenetic profiling, and gene resequencing.

PROJECTED ACCRUAL: A total of 150 patient samples will be accrued for this study.

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Odotettu)

150

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskelupaikat

    • South Carolina
      • Charleston, South Carolina, Yhdysvallat, 29425
        • Hollings Cancer Center at Medical University of South Carolina

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

1 vuosi - 21 vuotta (Lapsi, Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Targets for High-Risk Pediatric Acute Lymphoblastic Leukemia

Kuvaus

DISEASE CHARACTERISTICS:

  • Diagnosis of B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (ALL)

    • High-risk disease
  • Participation in clinical trial COG-P9906 required (pilot project)

    • In complete remission
    • Consented to future studies using banked tissue specimens
  • Participation in clinical trial and COG-AALL03B1 and linked therapeutic studies COG-AALL0232 and COG- AALL0331(expansion project)

    • Experienced a bone marrow relapse within 36 months of initial diagnosis
    • Consented to future studies using banked tissue specimens
    • Have matched ALL blast and germline specimens
    • Demographic, clinical and pathologic data elements for these biospecimens available

PATIENT CHARACTERISTICS:

  • Not specified

PRIOR CONCURRENT THERAPY:

  • Not specified

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Identification of regions of copy number abnormalities (CNA) and uniparental disomy in leukemic lymphoblasts using Affymetrix GeneChip Mapping 500K array sets
Identification of regions of CNA and loss-of-heterozygosity using Affymetrix SNP 6.0 microarrays. (Expansion project)
Gene expression profiles for leukemic lymphoblasts using Affymetrix U133 Plus 2.0 arrays
Global expression of microRNAs in leukemic lymphoblasts using microRNA gene chips
Epigenomic profiles using the HpaII tiny fragment Enrichment by Ligation-mediated PCR (HELP) assay. (Expansion project)
Prioritization of candidate genes and genomic regions for resequencing using array-generated gene expression data and data for CNAs
Identification of genes that are consistently mutated in leukemic lymphoblasts using high-throughput focused gene resequencing

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Yhteistyökumppanit

Tutkijat

  • Opintojen puheenjohtaja: Stephen P. Hunger, MD, Children's Hospital Colorado Center for Cancer and Blood Disorders

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus

Maanantai 1. toukokuuta 2006

Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)

Sunnuntai 1. toukokuuta 2016

Opintojen valmistuminen (Todellinen)

Sunnuntai 1. toukokuuta 2016

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Lauantai 9. toukokuuta 2009

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Lauantai 9. toukokuuta 2009

Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)

Tiistai 12. toukokuuta 2009

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Arvio)

Tiistai 17. toukokuuta 2016

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Perjantai 13. toukokuuta 2016

Viimeksi vahvistettu

Sunnuntai 1. toukokuuta 2016

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Muut tutkimustunnusnumerot

  • AALL06B1
  • COG-AALL06B1 (Muu tunniste: Children's Oncology Group)
  • CDR0000496763 (Muu tunniste: Clinical Trials.gov)
  • NCI-2009-00314 (Rekisterin tunniste: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Tilaa