Laboratory Study of Lymphoblasts in Young Patients With High-Risk Acute Lymphoblastic Leukemia
13 de mayo de 2016 actualizado por: Children's Oncology Group
Childhood Cancer Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments (TARGET) Initiative High-Risk ALL Pilot Project: Application of Array-Based Methods and Gene Re-Sequencing to Identify Candidate Molecular Targets for High-Risk Pediatric Acute Lymphoblastic Leukemia
RATIONALE: Collecting and storing samples of bone marrow and blood from patients with cancer to study in the laboratory may help doctors learn more about changes that may occur in DNA and identify biomarkers related to cancer.
PURPOSE: This laboratory study is looking at lymphoblasts in young patients with high-risk acute lymphoblastic leukemia.
Descripción general del estudio
Estado
Terminado
Condiciones
Descripción detallada
OBJECTIVES:
- Identify regions of copy number abnormalities (CNA) and uniparental disomy in leukemic lymphoblasts from pediatric patients with high-risk acute lymphoblastic leukemia (ALL) using Affymetrix GeneChip Mapping 500K array sets. (Pilot project)
- Identify regions of CNA and loss-of-heterozygosity using Affymetrix SNP 6.0 microarrays. (Expansion project)
- Define gene expression profiles for leukemic lymphoblasts using Affymetrix U133 Plus 2.0 arrays.
- Assess the global expression of microRNAs in leukemic lymphoblasts using microRNA gene chips.
- Utilize array-generated gene expression data and data for CNAs and uniparental disomy to prioritize candidate genes and genomic regions for resequencing.
- Characterize epigenomic profiles using the HpaII tiny fragment Enrichment by Ligation-mediated PCR (HELP) assay. (Expansion project)
- Discover candidate therapeutic targets for these patients by identifying genes that are consistently mutated in leukemic lymphoblasts using high-throughput focused gene resequencing. (Pilot project)
- Discover candidate therapeutic targets for these patients by next generation sequencing technologies, including whole genome, whole transcriptome, and whole exome. (Expansion project)
OUTLINE: This is a multicenter study.
Banked biological samples (bone marrow and peripheral blood) are analyzed using gene expression profiling, single-nucleotide polymorphism and genotyping assays, DNA copy number and loss of heterozygosity estimates, epigenetic profiling, and gene resequencing.
PROJECTED ACCRUAL: A total of 150 patient samples will be accrued for this study.
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Anticipado)
150
Contactos y Ubicaciones
Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.
Ubicaciones de estudio
-
-
South Carolina
-
Charleston, South Carolina, Estados Unidos, 29425
- Hollings Cancer Center at Medical University of South Carolina
-
-
Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
1 año a 21 años (Niño, Adulto)
Acepta Voluntarios Saludables
No
Géneros elegibles para el estudio
Todos
Método de muestreo
Muestra no probabilística
Población de estudio
Targets for High-Risk Pediatric Acute Lymphoblastic Leukemia
Descripción
DISEASE CHARACTERISTICS:
Diagnosis of B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (ALL)
- High-risk disease
Participation in clinical trial COG-P9906 required (pilot project)
- In complete remission
- Consented to future studies using banked tissue specimens
Participation in clinical trial and COG-AALL03B1 and linked therapeutic studies COG-AALL0232 and COG- AALL0331(expansion project)
- Experienced a bone marrow relapse within 36 months of initial diagnosis
- Consented to future studies using banked tissue specimens
- Have matched ALL blast and germline specimens
- Demographic, clinical and pathologic data elements for these biospecimens available
PATIENT CHARACTERISTICS:
- Not specified
PRIOR CONCURRENT THERAPY:
- Not specified
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
|---|
|
Identification of regions of copy number abnormalities (CNA) and uniparental disomy in leukemic lymphoblasts using Affymetrix GeneChip Mapping 500K array sets
|
|
Identification of regions of CNA and loss-of-heterozygosity using Affymetrix SNP 6.0 microarrays. (Expansion project)
|
|
Gene expression profiles for leukemic lymphoblasts using Affymetrix U133 Plus 2.0 arrays
|
|
Global expression of microRNAs in leukemic lymphoblasts using microRNA gene chips
|
|
Epigenomic profiles using the HpaII tiny fragment Enrichment by Ligation-mediated PCR (HELP) assay. (Expansion project)
|
|
Prioritization of candidate genes and genomic regions for resequencing using array-generated gene expression data and data for CNAs
|
|
Identification of genes that are consistently mutated in leukemic lymphoblasts using high-throughput focused gene resequencing
|
Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
Patrocinador
Colaboradores
Investigadores
- Silla de estudio: Stephen P. Hunger, MD, Children's Hospital Colorado Center for Cancer and Blood Disorders
Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio
1 de mayo de 2006
Finalización primaria (Actual)
1 de mayo de 2016
Finalización del estudio (Actual)
1 de mayo de 2016
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
9 de mayo de 2009
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
9 de mayo de 2009
Publicado por primera vez (Estimar)
12 de mayo de 2009
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Estimar)
17 de mayo de 2016
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
13 de mayo de 2016
Última verificación
1 de mayo de 2016
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- AALL06B1
- COG-AALL06B1 (Otro identificador: Children's Oncology Group)
- CDR0000496763 (Otro identificador: Clinical Trials.gov)
- NCI-2009-00314 (Identificador de registro: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .