Tutkiva analyysi sairastuuksien vaikutuksesta paksusuolensyövän seulonnan ottamiseen

Tietojen linkittäminen ja eettiset ongelmat.

South Yorkshiren kohortin (SYC) tiedot (mukaan lukien potilastunnisteet) ovat Sheffieldin yliopiston kliinisten kokeiden tutkimusyksikön (CTRU) hallussa, kun taas suolen syöpäseulontaohjelman (BCSP) tiedot ovat NHS:n syövänseulontaohjelmien hallussa (osa Englannin kansanterveys).

Yhteys perustuu SYC:n vastaajien osajoukkoon, jotka ovat antaneet suostumuksensa SYC:n tutkijoille tarkastella NHS:n terveystietojaan ja jotka ovat oikeutettuja kutsumaan paksusuolensyövän (CRC) seulontaan. Ehdotettu yhdistämismenetelmä on seuraava:

• Niiden vastaajien, jotka ovat antaneet tämän suostumuksen, CTRU lähettää NHS-numeronsa ja SYC-tutkimustunnuksensa BCSP:lle.
• NHS-numeron avulla BCSP poimii tiedot siitä, onko henkilö kutsuttu seulontaan, ja jos niin on, hyväksyikö henkilö seulonnan vai ei.
• BCSP lähettää sitten seulontatiedot yhdessä SYC-tutkimuksen tunnuksen kanssa CTRU:lle. NHS-numeroa ei sisällytetä BCSP:stä lähetettyihin tietoihin (toisin sanoen se pseudoanonymisoidaan).
• CTRU käyttää pseudo-ID:tä linkittääkseen seulontaohjelman tiedot SYC-tietoihin. Tämän jälkeen pseudoanonymisoitu tietojoukko luovutetaan tutkimusryhmälle.

Tällä tavalla ainoat potilastunnistettavat tiedot, jotka BCSP vastaanottaisi, ovat tiedot, jotka heillä on jo hallussaan (NHS-numero), kun taas CTRU ei saisi ylimääräisiä potilaan tunnistettavia tietoja.

On myös korostettava, että tähän hankkeeseen osallistuvalla tutkimusryhmällä ei olisi pääsyä potilaan tunnistettavissa oleviin tietoihin projektin missään vaiheessa.

Käytetty data.

Tässä hankkeessa käytetään seuraavia tietoja:

• Valotusmuuttujat. Altistumismuuttujat ovat pitkäaikaisten olosuhteiden esiintyminen. Nämä kerätään SYC:ssä itseraportoituina pitkäaikaisina olosuhteina. Kaksitoista nimettyä ehtoa tallennetaan sekä "muu" ehto, joka sisältää vapaata tekstiä, jotta vastaaja voi ilmoittaa ehdon. Nämä sairaudet (ja niiden esiintyvyys SYC:n 60–74-vuotiaiden alustavassa otoksessa) ovat: masennus (8 %), ahdistuneisuus (10 %), väsymys (19 %), kipu (28 %), unettomuus (8 %). ), diabetes (10 %), hengitysvaikeudet (13 %), korkea verenpaine (31 %), sydänsairaus (10 %), nivelrikko (16 %), aivohalvaus (3 %), syöpä (5 %) ja muut ( 29 %).

Kaikki pitkäaikaiset sairaudet tulee ottaa huomioon syöpää lukuun ottamatta (koska tämä sisältää CRC:n, ja sitä sairastavat potilaat eivät ole oikeutettuja seulontaan) ja vapaatekstiset kuvaukset (nämä analysoidaan "muuksi").

• Tulosmuuttuja. Tulosmuuttuja on, jos henkilö osallistui CRC-seulontaan. Tämä linkitetään SYC-tietoihin käyttämällä kansallisen suolistosyöpäseulontaohjelman toimittamia tietoja. On huomattava, että CRC-seulonta liittyy ensimmäiseen yksilön seulontakertaan (yleinen seulonta). Pääanalyysissä tarkastellaan, onko henkilöllä ollut CRC-seulonta (riippumatta lähetettyjen seulontakutsujen määrästä). Käytettävissä olevista todisteista riippuen toissijaisessa analyysissä otettaisiin huomioon tulosmuuttuja "yksittäisen hyväksytyn CRC-seulonnan jälkeen alkuperäisen CRC-seulonnan kutsun hylkäämisen jälkeen".
• Hämmentäviä muuttujia. Seuraavia mahdollisesti hämmentäviä muuttujia tulee arvioida: ikä, sukupuoli, etnisyys, korkein koulutustaso, liikuntataso, tupakointitila, alkoholin kulutus ja IMD-puutepisteet.
• Muita kuvaavia muuttujia. Seuraavia muuttujia ei käytetä tilastomalleissa, mutta ne tulee ottaa mukaan, kun suoritetaan kuvaava vertailu seulonnassa käyneistä henkilöistä henkilöihin, jotka eivät osallistu seulontaan: itse ilmoittama EQ-5D yhteenvetopiste, itse ilmoittama terveydenhuollon käyttö viimeiset 3 kuukautta (tämä sisältää 22 nimettyä luokkaa, on odotettavissa, että pienestä määrästä johtuen osa näistä on ryhmiteltävä. Mahdolliset harkittavat ryhmittelyt ovat: Onnettomuus ja hätätilanne (A&E), Sairaalakäyttö (paitsi A&E), Terveydenhoitaja: Yleislääkäri, Terveydenhoitaja: Sairaanhoitaja, Muut terveydenhoitajat, Muut hoitajat, Vaihtoehtoiset terapeutit.

Tilastollinen analyysi.

Tilastollinen analyysi sisältää seuraavat osat:

• Alustava tutkiva analyysi. Tämän alustavan analyysin tulee antaa yleiskuva saatavilla olevista tiedoista ja tuoda esiin kaikki ongelmat, jotka saattavat olla tarpeen käsitellä tilastollisessa mallintamisessa.

Kuvaavassa analyysissä verrataan CRC-seulontaan osallistuvien ihmisten ominaisuuksia niihin, jotka eivät osallistu. Tämä vertailu sisältää altistumismuuttujat, hämmentävät muuttujat ja muut kuvaavat muuttujat (kuten on kuvattu edellisessä osiossa). Vertailujen tilastollinen merkitsevyys testataan sillä varauksella, että koska spesifisiä eroja ei ole etukäteen oletettu, tuloksena olevia p-arvoja tulee tulkita varoen. Jatkuvia muuttujia verrataan T-testeillä, binäärimuuttujien vertailussa Fisherin eksaktilla testillä ja järjestysmuuttujien vertailuun Kruskal-Wallis-testillä. Kaikki p-arvot, jotka ovat alle 5 %, katsotaan osoittamaan tilastollisesti merkitsevää yhteyttä.

Kuvaavan analyysin lisäksi mahdollisten jatkuvien muuttujien ja tuloksen välisen yhteyden toiminnallista muotoa on arvioitava visuaalisesti tasoitusmenetelmillä. Jos ilmoitetaan epälineaarinen funktionaalinen muoto, on harkittava epälineaaristen funktioiden käyttöä (fraktiopolynomit, luonnolliset splainit).

• Puuttuvien tietojen käsittely. Puuttuvan tiedon määrä määrää käytetyn strategian (Harrell, 2001). Jos puuttuvien tietojen kokonaisosuus on alle 5 %, puuttuvien arvojen yksittäinen imputointi suoritetaan. Muussa tapauksessa puuttuvien arvojen moninkertainen imputointi suoritetaan.
• Tilastollinen mallinnus. CRC:n seulontaosuudet on analysoitava logistista regressiota käyttäen siten, että potilaan demografiset tiedot, sosioekonominen asema, elämäntapatekijät ja sairastuvuus ovat mahdollisesti selittäviä muuttujia.

Ensisijainen kiinnostus on se, mitkä sairaudet vaikuttavat sairastuvuusasteeseen, erityisesti mielenterveysongelmiin (joista masennusta ja ahdistusta mitataan SYC:ssä). Tästä syystä vain vuorovaikutus näiden kahden mielenterveyden sairauden kanssa tulee ottaa huomioon. Jotta voitaisiin tutkia mielenterveyssairauksien ja sisäänoton välistä yhteyttä ja nähdä, kuinka muut muuttujat vaikuttavat tähän assosiaatioon, on esitettävä sarja malleja:

• Malli 1 (yksimuuttujamalli): tämä sisältää vain pitkäaikaiset olosuhteet (altistumismuuttujat) riippumattomina muuttujina.
• Malli 2 (demografisesti mukautettu malli): tämän tulee sisältää mallin 1 riippumattomat muuttujat sekä demografiset muuttujat (ikä, sukupuoli ja etninen tausta).
• Malli 3 (koko malli): tämän tulee sisältää kaikki tässä tutkimuksessa tarkastellut muuttujat. Vuorovaikutuksia ei oteta huomioon.
• Malli 4 (tutkiva malli): tämä koskee mallin 3 alijoukkovalintaa (askelittain taaksepäin, poistumistodennäköisyydellä 0,05). Vuorovaikutukset otetaan huomioon osajoukon valinnan soveltamisen jälkeen.

Mallisarjan esittelyn tarkoituksena on näyttää säätämätön yhteys sairastumisten ja seulonnan suorittamisen välillä ja korostaa, missä määrin nämä assosiaatiot ovat potilaan ominaisuuksien välittämiä. Tehdään ero "luontaisten" ominaisuuksien (ikä, sukupuoli ja etnisyys), joiden muuttaminen (yleensä) ei ole henkilön hallinnassa, ja jäljelle jäävät ominaisuudet, joita henkilö hallitsee paremmin.

Teholaskelmat.

Tehoanalyysit suoritettiin käyttämällä G*Power 3.1.9:ää. Tarvittava otoskoko ennalta määritellyn muuttujan merkittävän vaikutuksen havaitsemiseksi laskettiin. Näihin analyyseihin käytettiin 5 % alfatasoa ja kaksisuuntaista testiä. Oli useita lisätekijöitä, jotka piti arvioida tai valita:

• Vaadittu teho: käytettiin arvoja 95 % ja 80 %.
• Todennäköisyyssuhde: arvot välillä 1,2-3 testattiin.
• Käyttöönoton todennäköisyys niiden keskuudessa, joilla ei ole sairastavuutta: käytettiin BCSP:n vuosina 2008–2011 havaittua 47 prosentin yleistä.
• Mahdollisesti selittävien muuttujien välinen korrelaatioaste: testattiin arvot 20 % ja 40 % (tämä on merkitty "R2":lla alla olevassa taulukossa).
• Ennalta määritellyn muuttujan esiintyvyys: käytettiin arvoa 8 %, joka vastaa masennuksen esiintyvyyttä SYC-tietojen alustavassa analyysissä. Tässä analyysissä 74 %:lla otoksesta oli sairastuvuutta, keskimäärin 1,8 pitkäaikaista sairautta henkilöä kohden.

Taulukko 1: Vaadittu otoskoko tehon, korrelaation ja todennäköisyyssuhteen funktiona.

Teho = 80 % Teho = 95 % Todennäköisyyssuhde R2 = 0,2 R2 = 0,4 R2 = 0,2 R2 = 0,4 1,2 16 066 21 422 26 605 35 473 1,3 7 780 10 373 10 373 6 7 12 373 6,1 1 ,335 7,857 10 476 1,5 3 292 4 389 5 437 7 249 1,6 2 466 3 289 4 069 5 425 1,8 1 603 2 137 2 637 3 516 2,0 1 174 1 566 1 925 2 567 2,2 926 1 234 1 513 2 017 2,4 767 1 022 1 248 1 665 8 248 1 665 2,8 2765 . 79 772 935 1 247 3,0 519 693 837 1 116

Käytettävissä olevan otoskoon odotetaan olevan noin 7 500, mikä osoittaa, että kaikki 1,4:n tai suuremmat todennäköisyyssuhteet havaitaan 80 prosentin teholla, kun taas todennäköisyyssuhteet 1,5 tai sitä suuremmat havaitaan 95 prosentin teholla.

Esimerkki käyttöasteen muutoksesta, joka liittyy kertoimeen 1,5, olisi käytön lasku 60 prosentista 57 prosenttiin. Lisää esimerkkejä on taulukossa 2.

Taulukko 2: Käyttöönottonopeuden laskut, jotka vastaavat todennäköisyyssuhdetta 1,5. Käyttöönottoaste ryhmässä 1: 90 % 80 % 70 % 60 % Käyttöaste ryhmässä 2: 81 % 72 % 64 % 57 %

Vaihtoehtoista menetelmää näytteiden koon arvioimiseksi testattiin (Campbell, Julious ja Altman 1996). Tämä käyttää julkaistuja taulukoita, jotka arvioivat otoskoon (ryhmää kohti), joka tarvitaan ennalta määritetyn eron tunnistamiseen kahdessa suhteessa 5 %:n merkitsevyystasolla 80 %:n teholla. Ryhmäkoot mukautetaan sitten ryhmien koon erojen huomioon ottamiseksi. Jos esimerkiksi masennusta sairastava ryhmä edustaa 8 prosenttia koko väestöstä, niin 65 prosentin eron havaitsemiseksi masennusta sairastavien ihmisten keskuudessa ja 60 prosentin eroa masennusta sairastavien joukossa tarvitaan 425:n kokonaisotos, josta 34 391:llä ei olisi masennusta. Taulukossa 3 on esitetty otoskoko, joka vaaditaan erilaisille ottomäärien eroille (kaikki sisäänottonopeudet ovat 5 %:n kerrannaisia, koska näitä arvoja käytetään julkaistuissa taulukoissa).

Taulukko 3: Näytekoot, jotka vaaditaan ennalta määritettyjen erojen havaitsemiseen ottokyvyssä. Käyttöönotto ryhmässä A Otos ryhmässä B Kokonaisotoskoko 60 % 55 % 1 188 65 % 60 % 425 70 % 65 % 213 75 % 70 % 138

* Olettaen, että vertailu on masennusta sairastavien (esiintyvyys 8 %, joka vastaa ryhmää B) ja ilman masennusta.