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A Molecular Toolkit for the Microbial Investigation of Severe Community Acquired Pneumonia (S-CAP)

1 mai 2019 mis à jour par: Imperial College London

A Molecular Toolkit for the Microbial Investigation of Severe Community Acquired Pneumonia (S-CAP Study)

Severe community acquired pneumonia is common and associated with high mortality. Conventional microbiological diagnostics identify pathogens in approximately half of cases, which is inadequate for both clinical and epidemiological purposes. This study applies next-generation sequencing based metagenomic techniques to patients with extremely severe community acquired pneumonia, to investigate the microbiome of severe community acquired pneumonia and evaluate metagenomic approaches as diagnostic tools.

Aperçu de l'étude

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Réel)

103

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

      • Paddington, Royaume-Uni, W2 1PG
        • Ajit Lalvani

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Oui

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Adults admitted to Extra-Corporeal Membrane Oxygenation (ECMO) and Intensive Care Units (ICU) centres in England for severe community-acquired pneumonia

La description

Inclusion Criteria:

  • Adults aged 18 or over
  • Admitted to a participating severe respiratory failure centre or ICU
  • Admitted due to community acquired pneumonia (CAP) according to clinical and radiological criteria
  • Tracheal intubation, receiving mechanical ventilation +/- ECMO
  • Requires bronchoscopy as part of routine diagnostic care plan
  • Bronchoscopy takes place within 72 hours of first admission to hospital

Exclusion Criteria:

  • Any current or previous condition/circumstance that, in the opinion of the investigator or study nurse, may put the individual at risk if participating
  • Patients receiving end of life care
  • Hospitalisation within the previous 28 days (not including pre-ECMO hospitalisation for ECMO patients)
  • Consent or assent not given

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
SCAP requiring ECMO

Patients diagnosed with severe respiratory failure due to community acquired pneumonia that require extra-corporeal membrane oxygenation and a routine bronchoscopy for clinical purposes.

Molecular laboratory techniques will be applied to residual respiratory tract samples including bronchoalveolar lavage and non-directed bronchoalveolar lavage. Comparisons will be made to conventional diagnostic tests used in the diagnosis of community acquired pneumonia.

SCAP requiring ITU support

Patients diagnosed with severe respiratory failure due to community acquired pneumonia that require intensive care support and undergo a routine bronchoscopy for clinical purposes.

Molecular laboratory techniques will be applied to residual respiratory tract samples including bronchoalveolar lavage and non-directed bronchoalveolar lavage. Comparisons will be made to conventional diagnostic tests used in the diagnosis of community acquired pneumonia.

Healthy controls

Healthy volunteers who undergo bronchoscopy as part of a designated research bronchoscopy list.

Molecular laboratory techniques will be applied to bronchoalveolar lavage samples.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Detection of pathogens by metagenomic sequencing applied to bronchoalveolar lavage samples
Délai: 28 days (From time of enrollment up until end of inclusion)
The proportion of pathogen genome that can be detected in bronchial lavage samples detected by the proportion of the sequenced nucleic acid which is pathogen derived and the proportion of the pathogen genome which be reconstructed.
28 days (From time of enrollment up until end of inclusion)

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Metagenomic detection of pathogen genomes compared to the results of conventional diagnostic techniques
Délai: 28 days (From time of enrollment up until end of inclusion)

Metagenomic sequencing data obtained will be compared to results obtained from conventional diagnostic tests undertaken as part of the participant's routine clinical care. Data will be used to evaluate the ability of each technique to detect any pathogens found.

The conventional microbiological tests that will be used for comparison include those undertaken as part of the participants routine clinical care and will include urinary antigen tests (Pneumococcal and Leigonella); blood, sputum and bronchial lavage culture including polymerase chain reaction (PCR) for Legionella spp, Mycoplasma pneumoniae and Chlamydophila pneumoniae and respiratory viral PCR multiplex assays. The results of serological tests and PCR for Influenza A &B from nose and throat swabs will also be compared.

28 days (From time of enrollment up until end of inclusion)

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Les enquêteurs

  • Chaise d'étude: Ajit Lalvani, MBBS,MRCP,FRCP, Imperial College London

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

1 décembre 2016

Achèvement primaire (Réel)

1 octobre 2018

Achèvement de l'étude (Réel)

1 octobre 2018

Dates d'inscription aux études

Première soumission

27 octobre 2016

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

9 novembre 2016

Première publication (Estimation)

15 novembre 2016

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

2 mai 2019

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

1 mai 2019

Dernière vérification

1 août 2018

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

INDÉCIS

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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