Race-related Alternative Splicing: Novel Targets in Prostate Cancer (PCaP splicing)
2022年2月1日 更新者：Duke University
Data from evaluating prostate cancer (PCa) biopsy tissue from AA and white patients has led to the discovery of alternative splicing as a novel molecular mechanism underlying more aggressive PCa in AA men.
Coded archival radical prostatectomy tissue specimens and annotated clinical data, questionnaire data, and ancestral genotyping data will be obtained from the racially diverse and federally funded North Carolina-Louisiana PCa Project (NC-LA PCaP).
We will use 33 tissue specimens from each of the following 6 groups (n=198 total): white low aggressive, white intermediate aggressive, white high aggressive, AA low aggressive, AA intermediate aggressive and AA high aggressive.
The aforementioned tissues will first be screened for tumor content and Gleason grade by a genitourinary pathologist.
To identify race-related splice variants, RNA will be isolated for targeted sequencing of prioritized race-related alternatively spliced genes using the NimbleGen SeqCap Target Enrichment, SeqCap RNA System to capture regions of interest and the Illumina HiSeq sequencing platform to sequence these regions at a depth and coverage sufficient to accurately call alternative splicing events.
調査の概要
研究の種類
観察的
入学 (実際)
169
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究場所
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-
North Carolina
-
Durham、North Carolina、アメリカ、27710
- Duke University Medical Center
-
-
参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
18年歳以上 (大人、高齢者)
健康ボランティアの受け入れ
いいえ
受講資格のある性別
男
サンプリング方法
非確率サンプル
調査対象母集団
The study population includes AA and white male patients having confirmed prostate cancer and enrolled in NC-LA PCaP, a population-based, case-only study of prostate cancer in AA and white men in NC and LA.
Radical prostatectomy specimens will be selected from AA and white patients who have consented to NC-LA PCaP and have adequate tumor specimens of appropriate aggressiveness banked.
説明
Inclusion Criteria:
- Confirmed diagnosis of prostate cancer.
- Self-reported race of AA or white.
- Availability of five unstained slides per radical prostatectomy specimen and an associated Hematoxylin and Eosin stained slide for each radical prostatectomy specimen from NC-LA PCaP.
- Classification of prostate cancer of low, intermediate or high aggressiveness, as defined by NC-LA PCaP.
Exclusion Criteria:
1. Obtained radical prostatectomy tissue is inadequate for RNA analysis and/or is not positive for adenocarcinoma of the prostate of low, intermediate or high aggressiveness.
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
|---|---|
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white low aggressive
low aggressive = Gleason score < 7 and stage cT1-cT2 and PSA < 10 ng/ml
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No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
|
white high aggressive
high aggressive = Gleason score ≥ 8 or PSA > 20 ng/ml or Gleason score = 7 and stage cT3-cT4
|
No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
|
white intermediate aggressive
intermediate aggressive = all other cases
|
No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
|
AA low aggressive
low aggressive = Gleason score < 7 and stage cT1-cT2 and PSA < 10 ng/ml
|
No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
|
AA high aggressive
high aggressive = Gleason score ≥ 8 or PSA > 20 ng/ml or Gleason score = 7 and stage cT3-cT4
|
No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
|
AA intermediate aggressive
intermediate aggressive = all other cases
|
No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
|---|---|
|
Frequency of candidate race-related splice variants in localized prostate cancer of varying degrees of aggressiveness
時間枠：at the time of analysis
|
at the time of analysis
|
協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
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捜査官
- 主任研究者：Steve Patierno, PhD、Duke University
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2018年1月30日
一次修了 (実際)
2021年7月14日
研究の完了 (実際)
2021年7月14日
試験登録日
最初に提出
2018年1月31日
QC基準を満たした最初の提出物
2018年1月31日
最初の投稿 (実際)
2018年2月6日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2022年2月2日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2022年2月1日
最終確認日
2022年1月1日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
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