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Race-related Alternative Splicing: Novel Targets in Prostate Cancer (PCaP splicing)

1. Februar 2022 aktualisiert von: Duke University
Data from evaluating prostate cancer (PCa) biopsy tissue from AA and white patients has led to the discovery of alternative splicing as a novel molecular mechanism underlying more aggressive PCa in AA men. Coded archival radical prostatectomy tissue specimens and annotated clinical data, questionnaire data, and ancestral genotyping data will be obtained from the racially diverse and federally funded North Carolina-Louisiana PCa Project (NC-LA PCaP). We will use 33 tissue specimens from each of the following 6 groups (n=198 total): white low aggressive, white intermediate aggressive, white high aggressive, AA low aggressive, AA intermediate aggressive and AA high aggressive. The aforementioned tissues will first be screened for tumor content and Gleason grade by a genitourinary pathologist. To identify race-related splice variants, RNA will be isolated for targeted sequencing of prioritized race-related alternatively spliced genes using the NimbleGen SeqCap Target Enrichment, SeqCap RNA System to capture regions of interest and the Illumina HiSeq sequencing platform to sequence these regions at a depth and coverage sufficient to accurately call alternative splicing events.

Studienübersicht

Status

Abgeschlossen

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Tatsächlich)

169

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

  • Vereinigte Staaten
    • North Carolina
      • Durham, North Carolina, Vereinigte Staaten, 27710
        • Duke University Medical Center

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

18 Jahre und älter (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Männlich

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

The study population includes AA and white male patients having confirmed prostate cancer and enrolled in NC-LA PCaP, a population-based, case-only study of prostate cancer in AA and white men in NC and LA. Radical prostatectomy specimens will be selected from AA and white patients who have consented to NC-LA PCaP and have adequate tumor specimens of appropriate aggressiveness banked.

Beschreibung

Inclusion Criteria:

  1. Confirmed diagnosis of prostate cancer.
  2. Self-reported race of AA or white.
  3. Availability of five unstained slides per radical prostatectomy specimen and an associated Hematoxylin and Eosin stained slide for each radical prostatectomy specimen from NC-LA PCaP.
  4. Classification of prostate cancer of low, intermediate or high aggressiveness, as defined by NC-LA PCaP.

Exclusion Criteria:

1. Obtained radical prostatectomy tissue is inadequate for RNA analysis and/or is not positive for adenocarcinoma of the prostate of low, intermediate or high aggressiveness.

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
white low aggressive
low aggressive = Gleason score < 7 and stage cT1-cT2 and PSA < 10 ng/ml
Sonstiges: No interventions - retrospective data collection
No new patients will be consented to this study. Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
white high aggressive
high aggressive = Gleason score ≥ 8 or PSA > 20 ng/ml or Gleason score = 7 and stage cT3-cT4
Sonstiges: No interventions - retrospective data collection
No new patients will be consented to this study. Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
white intermediate aggressive
intermediate aggressive = all other cases
Sonstiges: No interventions - retrospective data collection
No new patients will be consented to this study. Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
AA low aggressive
low aggressive = Gleason score < 7 and stage cT1-cT2 and PSA < 10 ng/ml
Sonstiges: No interventions - retrospective data collection
No new patients will be consented to this study. Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
AA high aggressive
high aggressive = Gleason score ≥ 8 or PSA > 20 ng/ml or Gleason score = 7 and stage cT3-cT4
Sonstiges: No interventions - retrospective data collection
No new patients will be consented to this study. Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
AA intermediate aggressive
intermediate aggressive = all other cases
Sonstiges: No interventions - retrospective data collection
No new patients will be consented to this study. Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Zeitfenster
Frequency of candidate race-related splice variants in localized prostate cancer of varying degrees of aggressiveness
Zeitfenster: at the time of analysis
at the time of analysis

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Duke University

Ermittler

  • Hauptermittler: Steve Patierno, PhD, Duke University

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

30. Januar 2018

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

14. Juli 2021

Studienabschluss (Tatsächlich)

14. Juli 2021

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

31. Januar 2018

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

31. Januar 2018

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

6. Februar 2018

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

2. Februar 2022

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

1. Februar 2022

Zuletzt verifiziert

1. Januar 2022

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • Pro00091092

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

NEIN

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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