Race-related Alternative Splicing: Novel Targets in Prostate Cancer (PCaP splicing)
1 février 2022 mis à jour par: Duke University
Data from evaluating prostate cancer (PCa) biopsy tissue from AA and white patients has led to the discovery of alternative splicing as a novel molecular mechanism underlying more aggressive PCa in AA men.
Coded archival radical prostatectomy tissue specimens and annotated clinical data, questionnaire data, and ancestral genotyping data will be obtained from the racially diverse and federally funded North Carolina-Louisiana PCa Project (NC-LA PCaP).
We will use 33 tissue specimens from each of the following 6 groups (n=198 total): white low aggressive, white intermediate aggressive, white high aggressive, AA low aggressive, AA intermediate aggressive and AA high aggressive.
The aforementioned tissues will first be screened for tumor content and Gleason grade by a genitourinary pathologist.
To identify race-related splice variants, RNA will be isolated for targeted sequencing of prioritized race-related alternatively spliced genes using the NimbleGen SeqCap Target Enrichment, SeqCap RNA System to capture regions of interest and the Illumina HiSeq sequencing platform to sequence these regions at a depth and coverage sufficient to accurately call alternative splicing events.
Aperçu de l'étude
Statut
Complété
Les conditions
Intervention / Traitement
Type d'étude
Observationnel
Inscription (Réel)
169
Contacts et emplacements
Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.
Lieux d'étude
-
-
North Carolina
-
Durham, North Carolina, États-Unis, 27710
- Duke University Medical Center
-
-
Critères de participation
Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
18 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)
Accepte les volontaires sains
Non
Sexes éligibles pour l'étude
Homme
Méthode d'échantillonnage
Échantillon non probabiliste
Population étudiée
The study population includes AA and white male patients having confirmed prostate cancer and enrolled in NC-LA PCaP, a population-based, case-only study of prostate cancer in AA and white men in NC and LA.
Radical prostatectomy specimens will be selected from AA and white patients who have consented to NC-LA PCaP and have adequate tumor specimens of appropriate aggressiveness banked.
La description
Inclusion Criteria:
- Confirmed diagnosis of prostate cancer.
- Self-reported race of AA or white.
- Availability of five unstained slides per radical prostatectomy specimen and an associated Hematoxylin and Eosin stained slide for each radical prostatectomy specimen from NC-LA PCaP.
- Classification of prostate cancer of low, intermediate or high aggressiveness, as defined by NC-LA PCaP.
Exclusion Criteria:
1. Obtained radical prostatectomy tissue is inadequate for RNA analysis and/or is not positive for adenocarcinoma of the prostate of low, intermediate or high aggressiveness.
Plan d'étude
Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
|---|---|
|
white low aggressive
low aggressive = Gleason score < 7 and stage cT1-cT2 and PSA < 10 ng/ml
|
No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
|
white high aggressive
high aggressive = Gleason score ≥ 8 or PSA > 20 ng/ml or Gleason score = 7 and stage cT3-cT4
|
No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
|
white intermediate aggressive
intermediate aggressive = all other cases
|
No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
|
AA low aggressive
low aggressive = Gleason score < 7 and stage cT1-cT2 and PSA < 10 ng/ml
|
No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
|
AA high aggressive
high aggressive = Gleason score ≥ 8 or PSA > 20 ng/ml or Gleason score = 7 and stage cT3-cT4
|
No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
|
AA intermediate aggressive
intermediate aggressive = all other cases
|
No new patients will be consented to this study.
Only retrospective data will be collected on prostatectomy specimens and correlated with health data
|
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Délai |
|---|---|
|
Frequency of candidate race-related splice variants in localized prostate cancer of varying degrees of aggressiveness
Délai: at the time of analysis
|
at the time of analysis
|
Collaborateurs et enquêteurs
C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Steve Patierno, PhD, Duke University
Dates d'enregistrement des études
Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
30 janvier 2018
Achèvement primaire (Réel)
14 juillet 2021
Achèvement de l'étude (Réel)
14 juillet 2021
Dates d'inscription aux études
Première soumission
31 janvier 2018
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
31 janvier 2018
Première publication (Réel)
6 février 2018
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
2 février 2022
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
1 février 2022
Dernière vérification
1 janvier 2022
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- Pro00091092
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
NON
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Non
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Non
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .
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