Prevence sebevražd pomocí digitálního fenotypování a intervencí založených na farmakogenetice (SMARTomicS-R)

Nábor účastníků proběhne osobně na ambulantních psychiatrických klinikách, na pohotovostních odděleních a v nemocničních jednotkách krátkodobého pobytu. Odborníci v oblasti duševního zdraví (psychiatři, psychologové a zdravotní sestry) posoudí způsobilost během klinických setkání, poskytnou informace o studii a získají informovaný souhlas. Data budou zadána do prostředí MeMind pro monitorování dat a ověření pacientů, zajištění splnění kritérií způsobilosti a zaznamenání případných chybějících informací.

Před zahájením náboru jsou pro zdravotnické pracovníky zajištěny školení a standardizované pokyny, aby byla zaručena dodržování protokolu studie.

Data budou ověřována s ohledem na statistiky INE a nemocniční záznamy, aby bylo možné posoudit reprezentativnost a úplnost dat.

Primárním výsledkem je riziko sebevražedného chování, hodnocené pomocí Kolumbijské stupnice závažnosti sebevražedného chování (C-SSRS), Brughovy škály, zdokumentovaných sebevražedných událostí, využívání zdravotní péče, behaviorálních vzorců, digitálního fenotypování a změn farmakologické léčby. Sekundární výsledky zahrnují hodnocení účinnosti farmakologických léčeb a nákladové efektivity genetických markerů při výběru antidepresiv.

Základní sběr dat zahrnuje:

1. Genetické odběry pro genomické a metabolické profilování.
2. Socio-demografické a klinické hodnocení.
3. Na základě souhlasu extrahování digitálních behaviorálních dat prostřednictvím Google Takeout.

Pro obohacení zdravotních profilů účastníků budou integrována retrospektivní data z elektronických zdravotních záznamů (EHR), registrů předpisů a socio-demografických ukazatelů ze Španělského národního statistického ústavu (INE). Data EHR budou zahrnovat Základní minimální soubor dat (BMSD), standardizovaný klinicko-administrativní soubor dat. Vzorky krve umožní extrakci DNA/RNA a metabolomické analýzy. Genetické nálezy budou porovnány s přehledovými statistikami GWAS z Konsorcia psychiatrické genomiky (PGC) o pokusech o sebevraždu a ověřeny proti kontrolním vzorkům z Banco Nacional de ADN a kohorty Madridské manické skupiny.

Data z Google Takeout budou použita k vytvoření digitálních fenotypů. Pacienti si vyberou, která data sdílet, za podpory výzkumného asistenta. Vybraná data budou pseudonymizována pomocí bezpečného skriptu před uložením na servery Univerzity Karla III. Historie předpisů z různých autonomních regionů bude analyzována za účelem sledování léčebných trajektorií v čase.

Tato studie je součástí národního konsorcia zaměřeného na vzorek alespoň 5 000 účastníků. Výpočty síly, založené na nedávné metaanalýze (Li, 2023), ukazují, že tato velikost vzorku by poskytla 93,5% sílu na úrovni genomové významnosti (p < 5×10⁻⁸), za předpokladu frekvence minoritního alelu 0,2 a poměru šancí 1,3, s přihlédnutím k variabilitě pohlaví, diagnózy a léčebné odpovědi.

Statistické analýzy budou provedeny pomocí softwaru SPSS verze 29.0. Logistické regresní modely budou použity k prozkoumání faktorů spojených s primárními výsledky a bude vyvinut multivariační regresní model pro posouzení nezávislých asociací. Všechny testy budou oboustranné, s definovanou statistickou významností jako p < 0,05 a uvedenými 95% intervaly spolehlivosti.

Pro identifikaci digitálních behaviorálních biomarkerů budou použity pokročilé statistické a strojové učící techniky. Budou generovány individualizované profily související se sebevraždou a porovnány pomocí integrovaných dat z genetických, metabolických, lékařských a digitálních fenotypizačních zdrojů. Dále bude vytvořen personalizovaný a anonymizovaný expozom kombinací geo-časových dat z Google Takeout s kontextuálními informacemi z veřejných socio-demografických datových sad (např. INE).