Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

DNA Analysis of Tumor Tissue Samples From Patients With Diffuse Brain Stem Glioma

maanantai 25. heinäkuuta 2016 päivittänyt: St. Jude Children's Research Hospital

Comprehensive Molecular Analysis of Tumor Samples Derived From Patients With Diffuse Brainstem Glioma - A Pilot Study

This multi-institutional study will prospectively collect tumor and constitutional tissue samples from patients with diffuse brainstem glioma and other types of brainstem gliomas either during therapy or at autopsy to perform an extensive analysis of genetic and molecular abnormalities in these tumors.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Valmis

Ehdot

Yksityiskohtainen kuvaus

Since very little is known about the biology of diffuse brainstem glioma, the goal of this protocol is to undertake a systematic analysis of DNA abnormalities, and of RNA and protein expression in prospectively collected fresh-frozen and fixed tumor samples and correspondent normal tissue from patients affected with this tumor.

OBJECTIVES:

Perform genome-wide analysis of DNA gains and losses and RNA expression in tumor samples and normal tissue from patients with diffuse brain stem glioma.
Identify regions of genomic gain or loss using either array comparative genomic hybridization or single nucleotide polymorphism arrays.
Investigate genome-wide expression patterns of RNA derived from tumor samples and normal tissue from these patients via Affymetrix gene expression profiling.
Validate the results of the genome-wide analysis by conducting further evaluation of candidate genes or by investigating the expression of relevant gene products at the RNA and protein levels.
Perform analysis of mutations in candidate tumor-suppressor genes and oncogenes (including whole genome sequencing studies) using direct sequence analysis of tumor DNA and confirm the tumor-specific nature of these mutations by analyzing the correspondent constitutional DNA.
Confirm genomic gains or losses identified by means of fluorescence in situ hybridization (FISH) performed on tissue microarray using non-neoplastic brain tissue from each patient as control when available.
Explore protein expression patterns identified by immunohistochemistry or western blot and compare them to normal brain stem tissue.
To obtain a follow-up (questionnaire and/or telephone interview) after autopsy with parent(s), legal guardian(s), or family members of research participants in the United States to assess aspects associated with this procedure, including potential benefits and drawbacks

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Todellinen)

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskelupaikat

Yhdysvallat
- California
  - Palo Alto, California, Yhdysvallat, 94305
    - Stanford University Medical Center
- Tennessee
  - Memphis, Tennessee, Yhdysvallat, 38105
    - St. Jude Children's Research Hospital
- Washington
  - Seattle, Washington, Yhdysvallat, 98105
    - Seattle Children's Hospital

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

Ei vanhempi kuin 18 vuotta (Lapsi, Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Fresh-frozen and fixed tumor samples and correspondent normal tissue from patients affected with this tumor (peripheral blood is applicable only to patients with focal brainstem gliomas and patients who undergo biopsy of a diffuse brainstem glioma at diagnosis)

Kuvaus

Inclusion Criteria

Patients of any age with clinical and radiologic diagnosis of diffuse brainstem glioma
Patients with other high-grade gliomas originating in the brainstem
Patients with focal gliomas (WHO grade I/II) of the brainstem
Enrollment in the current version of the St. Jude Tissue Bank protocol for patients whose tissue samples were obtained at diagnosis and who received treatment at St. Jude Children's Research Hospital (SJCRH), or correspondent tissue banking consent for patients treated in other institutions if tissue was obtained prior to death (as applicable, depending on the standard of each institution)

Exclusion Criteria

Patients with any type of infiltrative low-grade (WHO grade II) or high-grade glioma (WHO grade III and IV) originating outside the brainstem
Patients harboring primary brainstem tumors with other histologic diagnoses (e.g., PNET)

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

Ryhmien/kohorttien lukumäärä

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Tumor Samples fresh-frozen and fixed tumor samples and correspondent normal tissue from patients affected with this tumor.(peripheral blood is applicable only to patients with focal brainstem gliomas and patients who undergo biopsy of a diffuse brainstem glioma at diagnosis)

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus	Toimenpiteen kuvaus	Aikaikkuna
DNA gains and losses and RNA expression in tumor samples and normal tissue Aikaikkuna: at autopsy	Tissue samples will be obtained at autopsy.	at autopsy
Genome-wide expression patterns of RNA in tumor samples and normal tissue as assessed by Affymetrix gene expression profiling Aikaikkuna: at autopsy	Tissue samples will be obtained at autopsy.	at autopsy
Validation of results of the genome-wide analysis Aikaikkuna: at autopsy	Tissue samples will be obtained at autopsy.	at autopsy
Mutations in candidate tumor-suppressor genes and oncogenes as assessed by direct sequencing analysis of tumor DNA Aikaikkuna: at autopsy	Tissue samples will be obtained at autopsy.	at autopsy
Confirmation of the tumor-specific nature of candidate tumor-suppressor gene and oncogene mutation as assessed by the correspondent constitutional DNA Aikaikkuna: at autopsy	Tissue samples will be obtained at autopsy.	at autopsy
Confirmation of genomic gains or losses as assessed by fluorescence in situ hybridization (FISH) performed on tissue microarray (TMA) using non-neoplastic brain tissue Aikaikkuna: at autopsy	Tissue samples will be obtained at autopsy.	at autopsy
Protein expression patterns as assessed by immunohistochemistry or western blot compared to normal brain stem tissue Aikaikkuna: at autopsy	Tissue samples will be obtained at autopsy.	at autopsy

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus	Toimenpiteen kuvaus	Aikaikkuna
Assess aspects associated with this procedure, including potential benefits and drawbacks Aikaikkuna: at autopsy	Tissue samples will be obtained at autopsy.	at autopsy

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

St. Jude Children's Research Hospital

Tutkijat

Päätutkija: Alberto Broniscer, MD, St. Jude Children's Research Hospital

Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä

Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.

Hyödyllisiä linkkejä

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus

Torstai 1. kesäkuuta 2006

Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)

Lauantai 1. elokuuta 2015

Opintojen valmistuminen (Todellinen)