- ICH GCP
- 미국 임상 시험 레지스트리
- 임상시험 NCT00899834
DNA Analysis of Tumor Tissue Samples From Patients With Diffuse Brain Stem Glioma
2016년 7월 25일 업데이트: St. Jude Children's Research Hospital
Comprehensive Molecular Analysis of Tumor Samples Derived From Patients With Diffuse Brainstem Glioma - A Pilot Study
This multi-institutional study will prospectively collect tumor and constitutional tissue samples from patients with diffuse brainstem glioma and other types of brainstem gliomas either during therapy or at autopsy to perform an extensive analysis of genetic and molecular abnormalities in these tumors.
연구 개요
상세 설명
Since very little is known about the biology of diffuse brainstem glioma, the goal of this protocol is to undertake a systematic analysis of DNA abnormalities, and of RNA and protein expression in prospectively collected fresh-frozen and fixed tumor samples and correspondent normal tissue from patients affected with this tumor.
OBJECTIVES:
- Perform genome-wide analysis of DNA gains and losses and RNA expression in tumor samples and normal tissue from patients with diffuse brain stem glioma.
- Identify regions of genomic gain or loss using either array comparative genomic hybridization or single nucleotide polymorphism arrays.
- Investigate genome-wide expression patterns of RNA derived from tumor samples and normal tissue from these patients via Affymetrix gene expression profiling.
- Validate the results of the genome-wide analysis by conducting further evaluation of candidate genes or by investigating the expression of relevant gene products at the RNA and protein levels.
- Perform analysis of mutations in candidate tumor-suppressor genes and oncogenes (including whole genome sequencing studies) using direct sequence analysis of tumor DNA and confirm the tumor-specific nature of these mutations by analyzing the correspondent constitutional DNA.
- Confirm genomic gains or losses identified by means of fluorescence in situ hybridization (FISH) performed on tissue microarray using non-neoplastic brain tissue from each patient as control when available.
- Explore protein expression patterns identified by immunohistochemistry or western blot and compare them to normal brain stem tissue.
- To obtain a follow-up (questionnaire and/or telephone interview) after autopsy with parent(s), legal guardian(s), or family members of research participants in the United States to assess aspects associated with this procedure, including potential benefits and drawbacks
연구 유형
관찰
등록 (실제)
81
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 장소
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California
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Palo Alto, California, 미국, 94305
- Stanford University Medical Center
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Tennessee
-
Memphis, Tennessee, 미국, 38105
- St. Jude Children's Research Hospital
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Washington
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Seattle, Washington, 미국, 98105
- Seattle Children's Hospital
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
18년 이하 (어린이, 성인)
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
아니
연구 대상 성별
모두
샘플링 방법
비확률 샘플
연구 인구
Fresh-frozen and fixed tumor samples and correspondent normal tissue from patients affected with this tumor (peripheral blood is applicable only to patients with focal brainstem gliomas and patients who undergo biopsy of a diffuse brainstem glioma at diagnosis)
설명
Inclusion Criteria
- Patients of any age with clinical and radiologic diagnosis of diffuse brainstem glioma
- Patients with other high-grade gliomas originating in the brainstem
- Patients with focal gliomas (WHO grade I/II) of the brainstem
- Enrollment in the current version of the St. Jude Tissue Bank protocol for patients whose tissue samples were obtained at diagnosis and who received treatment at St. Jude Children's Research Hospital (SJCRH), or correspondent tissue banking consent for patients treated in other institutions if tissue was obtained prior to death (as applicable, depending on the standard of each institution)
Exclusion Criteria
- Patients with any type of infiltrative low-grade (WHO grade II) or high-grade glioma (WHO grade III and IV) originating outside the brainstem
- Patients harboring primary brainstem tumors with other histologic diagnoses (e.g., PNET)
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
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Tumor Samples
fresh-frozen and fixed tumor samples and correspondent normal tissue from patients affected with this tumor.(peripheral
blood is applicable only to patients with focal brainstem gliomas and patients who undergo biopsy of a diffuse brainstem glioma at diagnosis)
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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DNA gains and losses and RNA expression in tumor samples and normal tissue
기간: at autopsy
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Tissue samples will be obtained at autopsy.
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at autopsy
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Genome-wide expression patterns of RNA in tumor samples and normal tissue as assessed by Affymetrix gene expression profiling
기간: at autopsy
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Tissue samples will be obtained at autopsy.
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at autopsy
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Validation of results of the genome-wide analysis
기간: at autopsy
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Tissue samples will be obtained at autopsy.
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at autopsy
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Mutations in candidate tumor-suppressor genes and oncogenes as assessed by direct sequencing analysis of tumor DNA
기간: at autopsy
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Tissue samples will be obtained at autopsy.
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at autopsy
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Confirmation of the tumor-specific nature of candidate tumor-suppressor gene and oncogene mutation as assessed by the correspondent constitutional DNA
기간: at autopsy
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Tissue samples will be obtained at autopsy.
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at autopsy
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Confirmation of genomic gains or losses as assessed by fluorescence in situ hybridization (FISH) performed on tissue microarray (TMA) using non-neoplastic brain tissue
기간: at autopsy
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Tissue samples will be obtained at autopsy.
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at autopsy
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Protein expression patterns as assessed by immunohistochemistry or western blot compared to normal brain stem tissue
기간: at autopsy
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Tissue samples will be obtained at autopsy.
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at autopsy
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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Assess aspects associated with this procedure, including potential benefits and drawbacks
기간: at autopsy
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Tissue samples will be obtained at autopsy.
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at autopsy
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
수사관
- 수석 연구원: Alberto Broniscer, MD, St. Jude Children's Research Hospital
간행물 및 유용한 링크
연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작
2006년 6월 1일
기본 완료 (실제)
2015년 8월 1일
연구 완료 (실제)
2015년 8월 1일
연구 등록 날짜
최초 제출
2009년 5월 9일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2009년 5월 9일
처음 게시됨 (추정)
2009년 5월 12일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (추정)
2016년 7월 26일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2016년 7월 25일
마지막으로 확인됨
2016년 7월 1일
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- NBTP02-SJ
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