Radiomiikkaan perustuva visualisointi ja IDH1-heterogeenisuuden kvantitatiivinen validointi glioomissa
Radiomiikkaan perustuva isositraattidehydrogenaasi 1:n heterogeenisuuden visualisointi ja kvantitatiivinen validointi glioomissa
Tämän kliinisen polun tavoitteena on visualisoida ei-invasiivisesti ja kvantitatiivisesti validoida geneettisen heterogeenisyyden radiomiikkamalli aikuisilla potilailla, joilla on diffuusi gliooma, jotta kliinikot voivat ohjata paremmin kirurgisia resektiota ja hoitovaihtoehtoja. Sen tavoitteena on vastata:
- Voittamaan nykyisen geneettisen diagnostisen prosessin rajoitukset, jotka liittyvät laitteisto- ja teknologiavaatimuksiin, korkeisiin kustannuksiin ja pitkiin aikatauluihin, ja mahdollistaa isositraattidehydrogenaasi 1:n (IDH1) mutaatioiden kvantitatiiviset tutkimukset, mikä mahdollistaa potilaiden tarkemman kerrostumisen ja lisätutkimuksen molekyylimarkkerit parantamaan potilaan ennustetta.
- Saavuttaa kasvainten sisällä olevien geenimutaatioiden ei-invasiivinen diagnoosi käyttämällä hyväksi tekoälyä ja lääketieteellisiä kuvia sekä testata mallin kliinistä toteutettavuutta tyypillisen kohdepunktion, geenisekvensoinnin ja kvantitatiivisen geeniekspressioanalyysin avulla.
Osallistujat lukevat tietoisen suostumussopimuksen ennen leikkausta ja päättävät vapaaehtoisesti liittyäkö koeryhmään vai eivät. Heille tehdään ennen leikkausta magneettikuvaus, tyypillisten kasvainkohtien intraoperatiivinen aivopunktio ja postoperatiivinen genotyypin tunnistaminen. Heidän kuvantamistietojaan, genotyyppitietojaan, kliinisen historian tietoja ja patologiatietoja käytetään kokeelliseen tutkimukseen.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
TAUSTA
WHO 2016 otti virallisesti molekyylimarkkerit käyttöön glioomien patologiseen diagnoosiin, mikä merkitsee askelta glioomien molekyylidiagnoosin aikakauteen. Niistä isositraattidehydrogenaasi 1 (IDH1) -mutaation katsotaan olevan glioomien kehittymisen "selkäranka", ja se vaikuttaa potilaiden hoitosuunnitelmaan ja ennusteeseen. Tämän molekyylibiomarkkerin kliininen käyttö on kuitenkin edelleen kiistanalaista, mikä johtuu IDH1-mutaatioiden kvantitatiivisten tutkimusten puutteesta. Glioomien spatiaalinen heterogeenisuus on osoitettu olemassa olevissa tutkimuksissa, eli kasvainkudokset saman gliooman eri osissa kuuluvat eri geneettisiin alatyyppeihin. Tämä tarkoittaa, että IDH1-mutanttikasvaimet eivät osoita mutaatioiden esiintymistä kaikissa kasvainsoluissa, mikä pahentaa entisestään kliinisen geneettisen diagnoosin ongelmia.
TAVOITE
Kasvainten geenimutaatioiden kvantifioimiseksi aiomme käyttää radiomiikkamallia tekoälyn ja kliinisen big datan kanssa ja varmistaa sen tarkkuuden kudospunktiolla. Tällä tavalla voimme voittaa monipistenäytteenoton ja toisen sukupolven sekvensoinnin haasteet, kuten korkeat laite- ja teknologiavaatimukset, korkeat kustannukset ja pitkä aika, ja näin teoreettisesti toteuttaa glioomien geneettisen heterogeenisyyden visualisoinnin ja kvantifioinnin.
KÄSITELLÄ ASIAA
Osallistujat lukevat tietoisen suostumussopimuksen ennen leikkausta ja päättävät vapaaehtoisesti liittyäkö koeryhmään vai eivät.
Geneettisen heterogeenisyyden visualisoinnin mallinnus
Ennen leikkausta osallistujat ensin Rutiininomaista kuvantamista ja niistä saatuja kuvia käytetään radiomiikkamallin rakentamiseen. Malli ennustaa ei-invasiivisesti IDH1-mutaatioita glioomissa.
Tyypillinen pistokohta
Kun ilmoittautuneet osallistujat nukutettiin ja kraniotomisoitiin, kliinikot valitsivat tyypilliset kasvainkohdat pistosta varten mallitulosten perusteella.
Histopatologinen diagnoosi
Samasta pistoskohdasta otettu näyte on jaettu kahteen osaan, ja ensimmäinen osa on rutiininomaisesti formaliinikiinnitetty parafiinin upottamista varten ja lopuksi H&E-värjätyt leikkeet. Patologi lukee ensin H&E-osat ja tekee histologisen diagnoosin, jossa kuvataan patologinen morfologia ja ominaisuudet, erityisesti kasvainsolujen sisältö ja jakautuminen.
IDH1 yhden nukleotidin sekvensointi
Toista osaa näytteestä käytetään nestemäisen typen säilöntään. Qiagen DNA/RNA Extraction Kit -pakkausta käytetään DNA:n erottamiseen nestemäisessä typessä säilytetystä kasvainkudoksesta, joka puhdistetaan ja altistetaan IDH1-polymeraasiketjureaktiolle (PCR). PCR-tuote puhdistetaan ja sille suoritetaan sekvensointi, ja sekvensointituote havaitaan ABI 7200 -sekvensoijalla sen määrittämiseksi, onko IDH1 mutatoitu vai ei.
2-hydroksiglutaraatin (2-HG) ilmentymistasojen massaspektrometria-analyysi
2-HG:n läsnäolo ja ilmentyminen glioomanäytteissä havaitaan ja analysoidaan massaspektrometrialla.
- Radiomiikkaan perustuvan IDH1-mutaatioennustusmallin validointi. 2-HG:n havaitsemistuloksia verrattiin numeerisesti mallituloksiin.
Tämä on yhden keskuksen validointitutkimus. Verrattuna rutiininomaiseen glioomakirurgiseen menettelyyn, tämä tutkimus lisää intraoperatiivisen kasvaintyypillisen istuma-punktion radiomiikkamallin ennustavan tarkkuuden validoimiseksi ja kerää vastaavat MRI-kuvat, kasvaimen histologisen diagnoosin ja molekyylipatologian diagnoosin. Radiomiikkamalli on rakennettu preoperatiivisten kliinisten tietojen perusteella ja se on ei-invasiivinen ja nopea työkalu kasvaingeenien kvantitatiiviseen analysointiin ja visualisointiin.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
Shanghai
-
Shanghai, Shanghai, Kiina, 200433
- Huashan Hospital, Fudan University
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- 18–70-vuotiaat potilaat, miehet tai naiset;
- Potilaat, joilla oli täydellinen preoperatiivinen magneettikuvaus ja joilla oli alun perin diagnosoitu gliooma magneettikuvaustulosten perusteella;
- Potilaat, joille ehdotettiin kallonpoistoa ilman leikkauksen vasta-aiheita ja jotka olivat allekirjoittaneet tietoon perustuvan suostumuslomakkeen itse tai edustajansa;
- Potilaat, joilla on vahvistettu glioomadiagnoosi postoperatiivisella patologisella diagnoosilla.
Poissulkemiskriteerit:
- Potilaat otetaan yksinkertaiseen pistobiopsiaan;
- Potilaat, joilla on yhdistelmä vakavia sairauksia ja jotka eivät siedä leikkausta;
- Potilaat, joilla on verenvuototaipumus tai epänormaali hyytymistoiminto tai jotka eivät ole lopettaneet antikoagulanttien, kuten aspiriinin ja klopidogreelin, pitkäaikaista käyttöä;
- Raskaana olevat ja imettävät naiset;
- Potilaat osallistuvat muihin kliinisiin tutkimuksiin samana ajanjaksona.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Muut
- Jako: Ei käytössä
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / Arm |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Kokeellinen: IDH1-mutaatioiden validointi radiomiikkamallista
Tässä kokeessa validoimme radiomiikkamallin tarkkuuden IDH1-ennusteelle puhkaisemalla tyypillisiä glioomien kohteita, geenisekvensoimalla ja kvantitatiivisella geenianalyysillä.
|
Leikkauksen aikana kliinikot valitsevat useita tyypillisiä pistokohteita preoperatiivisen mallin tulosten perusteella.
Leikkauksen jälkeen hankituille kasvainkudoksille tehdään histologinen diagnoosi ja patologinen diagnoosi ammattipatologien toimesta, ja tuloksia verrataan mallin tuottoon sen tarkkuuden varmistamiseksi.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
tarkkuus
Aikaikkuna: Opintojen loppu (24 viikkoa)
|
Oikeiden malliennusteiden suhde kaikkiin ennusteisiin lasketaan vertaamalla tuloksia puhkaisutuloksiin.
|
Opintojen loppu (24 viikkoa)
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Opintojohtaja: Zhifeng Shi, DM, Huashan Hospital
- Opintojen puheenjohtaja: Ying Mao, DM, Huashan Hospital
- Opintojohtaja: Jinhua Yu, DE, Fudan University
- Päätutkija: Zengxin Qi, DM, Huashan Hospital
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- MINGGE-SW-00003-V1-01
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .