Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Molecular Profiling for Risk Stratification in Appendiceal Cancer

torstai 25. kesäkuuta 2026 päivittänyt: City of Hope Medical Center

Molecular Profiling for Tumor Characterization and Risk Stratification in Patients With Appendiceal Cancer

This study investigates integrated epigenetic and epitranscriptomic features of appendiceal cancer using archived tumor tissue specimens from the same patient cohort. The study includes DNA methylation profiling and m6A epitranscriptomic profiling to define molecular subtypes, evaluate associations with clinicopathologic features, and develop molecular risk scores for prognostic stratification. The primary goal is to determine whether DNA methylation- and m6A-based molecular features can complement conventional histopathologic grading and improve risk stratification.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Yksityiskohtainen kuvaus

Appendiceal cancer is a rare and heterogeneous malignancy with limited clinically actionable biomarkers for risk stratification. Histologic grade remains one of the strongest determinants of prognosis, but outcomes among patients with lower-grade disease remain variable. This study is designed to characterize the molecular architecture of appendiceal cancer through integrated analysis of DNA methylation and m6A epitranscriptomic profiles generated from archived tumor tissue specimens from the same patient cohort.

The study uses formalin-fixed paraffin-embedded appendiceal cancer tissues, and where available benign or normal appendix tissues, together with matched clinicopathologic and follow-up data. DNA methylation profiling is performed to evaluate tumor-associated methylation patterns, identify differentially methylated regions or features, and assess their association with clinical and survival outcomes. In parallel, m6A epitranscriptomic profiling is performed using m6A-enriched RNA sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment.

Molecular data are analyzed to identify tumor-associated epigenetic and epitranscriptomic alterations, define molecular subtypes, and construct continuous molecular risk scores. These molecular features are evaluated in relation to histologic grade, histologic subtype, lymph node metastasis, lymphovascular invasion, perineural invasion, peritoneal cancer index, overall survival, and progression-free survival.

The study aims to determine whether DNA methylation and m6A-based profiling can provide complementary molecular information for appendiceal cancer classification, prognostic modeling, and future biomarker development.

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Arvioitu)

400

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskeluyhteys

  • Nimi: Ajay Goel
  • Puhelinnumero: 6262184673
  • Sähköposti: ajgoel@coh.org

Opiskelupaikat

    • California
      • Durate, California, Yhdysvallat, 91016
        • Rekrytointi
        • City of Hope Medical Center
        • Ottaa yhteyttä:
          • Ajay Goel, MD
          • Puhelinnumero: 6262184673
          • Sähköposti: ajgoel@coh.org

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

  • Aikuinen
  • Vanhempi Aikuinen

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

The study population includes adult patients with appendiceal cancer whose archived tumor specimens and associated clinicopathologic data are available for retrospective molecular profiling. The same patient cohort is used for DNA methylation and m6A epitranscriptomic analyses where sufficient biospecimen material is available. Benign or normal appendix tissue specimens may be included as non-malignant reference controls.

Kuvaus

Inclusion Criteria:

  • Patients with histologically confirmed appendiceal adenocarcinoma or appendiceal cancer.
  • Availability of archived tumor tissue suitable for molecular profiling.
  • Availability of tissue for DNA methylation profiling, m6A epitranscriptomic profiling, or both.
  • Availability of relevant clinicopathologic data.
  • Availability of survival or follow-up information when applicable.
  • Age 18 years or older at diagnosis or tissue collection.

Exclusion Criteria:

  • Insufficient tissue quantity or quality for molecular profiling.
  • Inadequate DNA or RNA quality for sequencing or molecular assay preparation.
  • Missing essential clinicopathologic information required for analysis.
  • Non-appendiceal primary tumor or metastatic tumor to the appendix from another primary site.
  • Patients who do not meet institutional review board or consent requirements, if applicable.

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Interventio / Hoito
Appendiceal Cancer Cohort
Patients with histologically confirmed appendiceal cancer whose archived tumor tissue specimens and clinicopathologic data are available for integrated DNA methylation and m6A epitranscriptomic profiling.
Archived tissue specimens undergo DNA methylation profiling to characterize tumor-associated methylation alterations and identify methylation-based molecular features associated with clinicopathologic variables and survival outcomes. The profiling is performed for research purposes only and does not assign treatment.
Archived tissue specimens undergo m6A methylated RNA immunoprecipitation sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment. The resulting molecular data are used for subtype discovery, m6A score construction, reduced-panel development, and association with clinicopathologic and survival outcomes.
Benign Appendix Reference Cohort
Individuals with benign or normal appendix tissue specimens used as non-malignant reference samples for comparison of tumor-associated DNA methylation and m6A epitranscriptomic features.
Archived tissue specimens undergo DNA methylation profiling to characterize tumor-associated methylation alterations and identify methylation-based molecular features associated with clinicopathologic variables and survival outcomes. The profiling is performed for research purposes only and does not assign treatment.
Archived tissue specimens undergo m6A methylated RNA immunoprecipitation sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment. The resulting molecular data are used for subtype discovery, m6A score construction, reduced-panel development, and association with clinicopathologic and survival outcomes.

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Overall Survival
Aikaikkuna: Through study completion, an average of 1 year
Overall survival will be evaluated in relation to molecular profiling results and available clinicopathologic characteristics. Survival analyses may include Kaplan-Meier analysis and Cox proportional hazards models
Through study completion, an average of 1 year
Progression-Free Survival
Aikaikkuna: Through study completion, an average of 1 year
Progression-free survival will be evaluated in relation to molecular profiling results and available clinicopathologic characteristics. Time-to-event analyses may be performed using standard survival analysis methods.
Through study completion, an average of 1 year

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Perjantai 1. toukokuuta 2026

Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)

Perjantai 1. tammikuuta 2027

Opintojen valmistuminen (Arvioitu)

Perjantai 1. tammikuuta 2027

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Maanantai 4. toukokuuta 2026

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Perjantai 8. toukokuuta 2026

Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)

Torstai 14. toukokuuta 2026

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)

Maanantai 29. kesäkuuta 2026

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Torstai 25. kesäkuuta 2026

Viimeksi vahvistettu

Maanantai 1. kesäkuuta 2026

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)

Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?

EI

Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta

Ei

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta

Ei

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Tilaa