Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Molecular Profiling for Risk Stratification in Appendiceal Cancer

25 июня 2026 г. обновлено: City of Hope Medical Center

Molecular Profiling for Tumor Characterization and Risk Stratification in Patients With Appendiceal Cancer

This study investigates integrated epigenetic and epitranscriptomic features of appendiceal cancer using archived tumor tissue specimens from the same patient cohort. The study includes DNA methylation profiling and m6A epitranscriptomic profiling to define molecular subtypes, evaluate associations with clinicopathologic features, and develop molecular risk scores for prognostic stratification. The primary goal is to determine whether DNA methylation- and m6A-based molecular features can complement conventional histopathologic grading and improve risk stratification.

Обзор исследования

Статус

Рекрутинг

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

Appendiceal cancer is a rare and heterogeneous malignancy with limited clinically actionable biomarkers for risk stratification. Histologic grade remains one of the strongest determinants of prognosis, but outcomes among patients with lower-grade disease remain variable. This study is designed to characterize the molecular architecture of appendiceal cancer through integrated analysis of DNA methylation and m6A epitranscriptomic profiles generated from archived tumor tissue specimens from the same patient cohort.

The study uses formalin-fixed paraffin-embedded appendiceal cancer tissues, and where available benign or normal appendix tissues, together with matched clinicopathologic and follow-up data. DNA methylation profiling is performed to evaluate tumor-associated methylation patterns, identify differentially methylated regions or features, and assess their association with clinical and survival outcomes. In parallel, m6A epitranscriptomic profiling is performed using m6A-enriched RNA sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment.

Molecular data are analyzed to identify tumor-associated epigenetic and epitranscriptomic alterations, define molecular subtypes, and construct continuous molecular risk scores. These molecular features are evaluated in relation to histologic grade, histologic subtype, lymph node metastasis, lymphovascular invasion, perineural invasion, peritoneal cancer index, overall survival, and progression-free survival.

The study aims to determine whether DNA methylation and m6A-based profiling can provide complementary molecular information for appendiceal cancer classification, prognostic modeling, and future biomarker development.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Оцененный)

400

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

  • Имя: Ajay Goel
  • Номер телефона: 6262184673
  • Электронная почта: ajgoel@coh.org

Места учебы

  • Соединенные Штаты
    • California
      • Durate, California, Соединенные Штаты, 91016
        • Рекрутинг
        • City of Hope Medical Center
        • Контакт:
          • Ajay Goel, MD
          • Номер телефона: 6262184673
          • Электронная почта: ajgoel@coh.org

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

  • Взрослый
  • Пожилой взрослый

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

The study population includes adult patients with appendiceal cancer whose archived tumor specimens and associated clinicopathologic data are available for retrospective molecular profiling. The same patient cohort is used for DNA methylation and m6A epitranscriptomic analyses where sufficient biospecimen material is available. Benign or normal appendix tissue specimens may be included as non-malignant reference controls.

Описание

Inclusion Criteria:

  • Patients with histologically confirmed appendiceal adenocarcinoma or appendiceal cancer.
  • Availability of archived tumor tissue suitable for molecular profiling.
  • Availability of tissue for DNA methylation profiling, m6A epitranscriptomic profiling, or both.
  • Availability of relevant clinicopathologic data.
  • Availability of survival or follow-up information when applicable.
  • Age 18 years or older at diagnosis or tissue collection.

Exclusion Criteria:

  • Insufficient tissue quantity or quality for molecular profiling.
  • Inadequate DNA or RNA quality for sequencing or molecular assay preparation.
  • Missing essential clinicopathologic information required for analysis.
  • Non-appendiceal primary tumor or metastatic tumor to the appendix from another primary site.
  • Patients who do not meet institutional review board or consent requirements, if applicable.

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
Appendiceal Cancer Cohort
Patients with histologically confirmed appendiceal cancer whose archived tumor tissue specimens and clinicopathologic data are available for integrated DNA methylation and m6A epitranscriptomic profiling.
Диагностический тест: DNA Methylation Profiling
Archived tissue specimens undergo DNA methylation profiling to characterize tumor-associated methylation alterations and identify methylation-based molecular features associated with clinicopathologic variables and survival outcomes. The profiling is performed for research purposes only and does not assign treatment.
Диагностический тест: m6A Epitranscriptomic Profiling
Archived tissue specimens undergo m6A methylated RNA immunoprecipitation sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment. The resulting molecular data are used for subtype discovery, m6A score construction, reduced-panel development, and association with clinicopathologic and survival outcomes.
Benign Appendix Reference Cohort
Individuals with benign or normal appendix tissue specimens used as non-malignant reference samples for comparison of tumor-associated DNA methylation and m6A epitranscriptomic features.
Диагностический тест: DNA Methylation Profiling
Archived tissue specimens undergo DNA methylation profiling to characterize tumor-associated methylation alterations and identify methylation-based molecular features associated with clinicopathologic variables and survival outcomes. The profiling is performed for research purposes only and does not assign treatment.
Диагностический тест: m6A Epitranscriptomic Profiling
Archived tissue specimens undergo m6A methylated RNA immunoprecipitation sequencing with matched input RNA sequencing to quantify transcriptome-wide m6A enrichment. The resulting molecular data are used for subtype discovery, m6A score construction, reduced-panel development, and association with clinicopathologic and survival outcomes.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Overall Survival
Временное ограничение: Through study completion, an average of 1 year
Overall survival will be evaluated in relation to molecular profiling results and available clinicopathologic characteristics. Survival analyses may include Kaplan-Meier analysis and Cox proportional hazards models
Through study completion, an average of 1 year
Progression-Free Survival
Временное ограничение: Through study completion, an average of 1 year
Progression-free survival will be evaluated in relation to molecular profiling results and available clinicopathologic characteristics. Time-to-event analyses may be performed using standard survival analysis methods.
Through study completion, an average of 1 year

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

City of Hope Medical Center

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

1 мая 2026 г.

Первичное завершение (Оцененный)

1 января 2027 г.

Завершение исследования (Оцененный)

1 января 2027 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

4 мая 2026 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

8 мая 2026 г.

Первый опубликованный (Действительный)

14 мая 2026 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

29 июня 2026 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

25 июня 2026 г.

Последняя проверка

1 июня 2026 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • 23228_CIPHER-AC

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

НЕТ

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться