Infections liées aux implants chez les patients atteints de sarcomes squelettiques (IRISSAR)

En oncologie orthopédique, le risque et les conséquences des infections liées aux dispositifs orthopédiques (ODRIs) sont accrus car les patients ont souvent des réponses immunitaires compromises en raison de la maladie sous-jacente, de la chimiothérapie ou de la radiothérapie. Les implants utilisés peuvent être porteurs de poids au point qu'il est impossible de les retirer ou de les échanger en cas d'infection, et ainsi, dans le pire des cas, entraîner une amputation ou la mort. Comparé à l'incidence de 1 à 2 % des infections de prothèse articulaire (PJI) dans une population non oncologique avec une prothèse totale de hanche ou de genou, les patients avec une méga-prothèse en raison d'un sarcome squelettique ont une incidence d'infection de 3 à 25 %. Les facteurs liés au patient, la chirurgie extensive et répétée et les grands implants reconstructeurs expliquent probablement l'incidence accrue.

À notre connaissance, aucune étude n'a évalué le rôle des facteurs microbiologiques tels que la production de biofilm et la sensibilité dans cette population. De plus, les facteurs immunologiques déficients chez ces patients, tels que la migration défectueuse des neutrophiles, l'expression des cytokines et l'explosion respiratoire des phagocytes, impliqués dans l'élimination des microbes, peuvent fournir un environnement favorisant des phénotypes plus virulents. Une connaissance fondamentale sur le rôle du biofilm dans cette population pourrait contribuer à l'amélioration de la planification du traitement et des résultats.

Distinguer les pathogènes responsables des contaminants peut être difficile, en particulier dans les infections polymicrobiennes. L'ajout de diagnostics métagénomiques, encore peu utilisés en pratique clinique, peut améliorer les sensibilités, mais la précision prédictive reste un problème. Comparer les résultats de la culture microbiologique conventionnelle avec le séquençage métagénomique serait intéressant pour déterminer la précision des méthodes diagnostiques actuelles.

La présente étude est un projet exploratoire abordant la nature multifactorielle des infections de prothèse articulaire (PJI) en se concentrant sur le phénotype microbien chez les patients atteints de sarcome squelettique. Le rôle des facteurs de l'hôte, du microbe et de l'implant sera étudié à l'aide d'un ensemble de méthodes différentes et comparé aux cas d'infections de prothèse articulaire (PJI) chez les patients avec une prothèse conventionnelle de hanche ou de genou.

Des échantillons sanguins préopératoires seront prélevés et des échantillons de tissus mous péri-prothétiques, d'os et de liquide articulaire seront collectés pendant l'intervention. Les patients seront échantillonnés pendant leur opération primaire avec une méga-prothèse en raison d'un sarcome squelettique et, en cas d'infection de prothèse articulaire (PJI) postopératoire, ils seront échantillonnés de la même manière pendant leur chirurgie de révision. Les patients subissant une réopération en raison d'une infection de prothèse articulaire (PJI) dans une prothèse totale conventionnelle de hanche ou de genou seront également échantillonnés avec du sang, de l'os, des tissus mous et du liquide articulaire pendant l'intervention.

Des comparaisons descriptives entre (i) les tissus péri-prothétiques et les tissus d'infection de prothèse articulaire (PJI) avant et après l'infection chez les patients en oncologie orthopédique, et (ii) les tissus d'infection de prothèse articulaire (PJI) chez les patients en oncologie orthopédique et les patients avec une infection de prothèse articulaire (PJI) conventionnelle, seront effectuées en ce qui concerne les paramètres suivants :

Rôle de l'hôte :

• Paramètres cliniques : score ASA, diabète, IMC, âge, sexe, utilisation d'antibiotiques 2 semaines avant la chirurgie, durée de la chimiothérapie, type de chimiothérapie, arrêt de la chimiothérapie, apparition des symptômes en cas d'infection, type d'implant, durée de la chirurgie, type d'ostéosarcome, grade et stade, localisation de la chirurgie, longueur de la résection.
• Biochimie sanguine (numération globulaire complète avec différentiel, densité des neutrophiles, CRP, procalcitonine, IL-6).
• Histologie et immunohistochimie (FISH pour l'identification des bactéries, infiltrats inflammatoires (présence de cellules géantes de corps étranger), angiogenèse, nécrose tissulaire).
• Expression génique (marqueurs liés à l'angiogenèse, l'inflammation, la reconnaissance microbienne et la nécrose tissulaire). Dans des échantillons sélectionnés en paraffine, l'analyse par transcriptomique spatiale sera explorée.

Rôle du pathogène :

• Cinq cultures tissulaires pour la culture de routine (pour déterminer l'agent causal) et une supplémentaire pour l'extraction d'ADN bactérien et le séquençage du gène de l'ARNr 16S.
• Les souches staphylococciques cliniques isolées des infections de prothèse articulaire (PJI) et de l'endoprothèse tumorale au moment de l'infection seront caractérisées et comparées en ce qui concerne leur production phénotypique de biofilm, leur sensibilité aux antimicrobiens et la présence de gènes de virulence en utilisant CV, MBEC et NGS.
• Différence d'expression génique des gènes liés au biofilm entre les souches staphylococciques d'infections de prothèse articulaire (PJI) (conventionnelles et oncologie orthopédique) lorsqu'elles sont cultivées sur titane avec un conditionnement préalable au sérum in vitro.