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Whole Genome-Based Surveillance of Nasopharyngeal Pneumococcal Carriage in Vietnamese Children

25 avril 2026 mis à jour par: Phuc Huu Phan

Whole Genome-Based Surveillance of Nasopharyngeal Pneumococcal Carriage and Serotype Distribution Among Vietnamese Children Hospitalized With Acute Respiratory Symptoms

This hospital-based cross-sectional study aims to determine the prevalence and serotype distribution of nasopharyngeal Streptococcus pneumoniae carriage among children aged 2-59 months hospitalized with acute respiratory symptoms at Vietnam National Children's Hospital (VNCH). Whole genome sequencing (WGS) will be used for serotype identification, antimicrobial resistance gene detection, and characterization of co-colonization patterns. The study will compare carriage prevalence and serotype distribution between previously healthy children and children with underlying comorbidities. Findings will inform pneumococcal vaccine policy and antimicrobial resistance surveillance in Vietnam.

Aperçu de l'étude

Description détaillée

Nasopharyngeal colonization with Streptococcus pneumoniae is a prerequisite for invasive pneumococcal disease. In Vietnam, PCV10 and PCV13 have been introduced in the private sector; however, updated surveillance data reflecting post-vaccine serotype dynamics are limited.

This study will enroll 530 children aged 2 months to 59 months hospitalized with acute respiratory symptoms. Participants will be categorized into:

  • Group 1: Previously healthy children
  • Group 2: Children with chronic underlying conditions Nasopharyngeal swabs will be collected at enrollment. Streptococcus pneumoniae isolates will undergo culture, identification using MALDI-TOF MS, and whole genome sequencing using the Illumina NextSeq platform. Bioinformatic analysis will include in silico serotyping, MLST typing, resistance gene detection, and co-colonization assessment.

The study will evaluate associations between pneumococcal carriage and demographic, clinical, vaccination, and environmental factors.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

530

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

      • Hanoi, Viêt Nam, 00000
        • Vietnam National Children's Hospital

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Enfant

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Children aged 2 months to 59 months hospitalized at Vietnam National Children's Hospital with acute respiratory symptoms

La description

Inclusion Criteria:

  • Age 2 months to 59 months
  • Hospitalized with acute respiratory symptoms (≤14 days duration)
  • Parent or legal guardian provides written informed consent

Acute respiratory symptoms defined as one or more of:

  • Cough
  • Rhinorrhea
  • Nasal obstruction
  • Sore throat
  • Tachypnea
  • Wheeze
  • Retraction

Exclusion Criteria:

  • Confirmed pneumococcal infection within the past 30 days

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Prevalence of Pneumococcal Carriage
Délai: At enrollment
Proportion of participants with S. pneumoniae detected from nasopharyngeal swab Analysis: Prevalence with 95% confidence intervals
At enrollment
Pneumococcal Serotype Distribution
Délai: At enrollment
Frequency distribution of pneumococcal serotypes identified via Whole Genome Sequencing
At enrollment

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Antimicrobial Resistance Genes
Délai: at enrollment
Presence of resistance genes (e.g., ermB, mefA, pbp variants)
at enrollment
Vaccine Serotype Coverage
Délai: At enrollment
Proportion of identified serotypes covered by PCV10, PCV13, PCV15, PCV20
At enrollment

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

1 avril 2026

Achèvement primaire (Estimé)

30 juin 2027

Achèvement de l'étude (Estimé)

30 septembre 2027

Dates d'inscription aux études

Première soumission

25 avril 2026

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

25 avril 2026

Première publication (Réel)

1 mai 2026

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

1 mai 2026

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

25 avril 2026

Dernière vérification

1 avril 2026

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

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INDÉCIS

Description du régime IPD

IPD might be shared with relevant request and upon approval by local regulatory body

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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