트리코모나스증: 아프리카계 미국인 여성의 유전자형과 표현형 상관관계

심각한 공중 보건 결과, 광범위한 유병률, 증가하는 약물 내성 및 치료 실패에도 불구하고 T. vaginalis 유전자형의 전파, 병독성, 혼합 감염 발생 및 약물 내성 확산에 대한 연구는 거의 수행되지 않았습니다. 신속한 변형 타이핑에 적합한 분석법이 부족합니다. Trichomonas에 대해 이전에 사용된 유전자형 분석 기술은 분석 속도, 민감도 및 다른 실험실 간의 재현성 문제로 인해 부적절합니다. MLST(Multilocus sequence typing)는 PCR(Polymerase Chain Reaction)에 의해 증폭되는 작은 DNA 조각(300-400 nt)에 존재하는 SNP(뉴클레오티드 서열 다형성)를 결정하여 속도, 민감도, 이식성, 정확성 및 신뢰성을 결합합니다( 보통 6-7) 중립적으로 선택된 하우스키핑 유전자. MLST는 유전자 단편에 존재하는 각각의 고유한 SNP 또는 SNP 조합에 대해 대립유전자 단편 번호(AFN)를 할당하고 이를 사용하여 분석된 모든 유전자 모음에서 AFN 조합을 기반으로 고유한 서열 유형(ST)을 식별합니다. MLST는 이배체 유기체에서 MLST 데이터를 해석하기 어렵기 때문에 진핵생물 중 곰팡이에 대해서만 병원성 박테리아의 역학, 인구 구조, 병독성 및 진화를 연구하는 데 광범위하게 사용되었습니다. 그러나, T. 바지날리스는 6개의 염색체의 안정한 반수체 세트를 소유하는 다른 진핵생물과 다르며, 연구자들은 T. 바지날리스 임상 분리주에 대한 MLST 유전형 분석 시스템을 개발했습니다. 우리가 개발한 MLST 체계에 의해 각 T. vaginalis 변종에 대해 생성된 데이터(AFN 및 ST)는 자유롭게 액세스할 수 있는 인터넷 데이터베이스에 보관됩니다. 그런 다음 이 MLST 계획을 사용하여 트리코모나스증의 변종 유전자형과 임상, 역학 및 생리학적 증상 사이의 관계를 조사합니다.

트리코모나스증은 광범위한 임상 양상과 질병 후유증을 특징으로 합니다. 이 임상적 다양성은 우리가 원래 시연하고 다른 사람들이 확인한 바와 같이 Trichomonas vaginalis 임상 분리주에서 높은 수준의 유전적 다양성을 동반합니다. 조사자들은 유전자형과 임상 양상 사이의 상관관계가 트리코모나스증에 대해 사실이며 T. vaginalis 분리균이 임상 질환, 중증도, 약물 내성 및 질병 후유증에 대한 능력이 다르다는 가설을 세웠습니다. 여러 연구(환자 10-40명)는 RAPD(random amplified polymorphic DNA) 기술을 사용하여 분리된 T. vaginalis의 유전적 관련성과 임상적 표현 사이에 통계적으로 유의미한 상관관계를 보여줍니다. 트리코모나스증의 질병 중증도와 세포부착, 세포독성 및 시스테인 프로테이나제 30킬로달톤(kDa) 단백질의 발현과 같은 시험관 내 표현형 특성 사이의 상관관계도 보고되었습니다. 세포 단층에 대한 세포부착, 차등 단백질 발현, 표적 세포의 식균작용, 배양된 세포에 세포독성 손상을 발휘하는 능력, 생쥐의 병원성 및 사망률의 중요한 차이가 T. 바지날리스 임상 분리주에서 입증되었으며, 이는 존재하는 독성 특성의 광범위한 변화를 나타냅니다. 트리코모나스 분리에서. 조사자들은 또한 배양된 T. 바지날리스 임상 분리주 사이의 분비된 시스테인 프로테아제 활성에서 최대 4배의 차이를 입증했습니다. 축적된 증거는 개별 T. 바지날리스 변종과 독성 능력 사이의 상관관계를 강력하게 뒷받침합니다.

이 특정 연구를 위해 초기 등록/진단 방문에서 조사관은 자세한 임상 평가, 역학 정보 및 약물 내성에 대한 시험관 내 테스트 결과와 함께 T. vaginalis 분리주를 수집합니다. 이 정보를 통해 조사관은 특정 변종 또는 변종 그룹(MLST 유전형 분석에 의해 결정됨)이 무증상 감염, 임상적 중증도, 환자 인종, 치료 실패, 약물 내성, 혼합 감염 또는 단변량 및 다변량 분석을 사용한 성적 병력과 관련이 있는지 확인할 수 있습니다. . 조사자들이 발견할 것으로 기대하는 바와 같이 특정 변종 또는 변종 그룹과 이러한 인자의 긍정적인 연관성은 확인된 변종을 참조하여 트리코모나스증을 관리하고 치료하는 방식의 변화를 필요로 하기 때문에 이는 중요합니다. 조사관은 또한 트리코모나스증의 임상 증상과 관련될 수 있는 변수 또는 변수 조합을 식별하기 위해 이러한 변수의 상호 연관성을 독립적으로 테스트할 것입니다.

조사관이 수집한 정보는 또한 많은 추가 방법으로 트리코모나스증에 대한 더 나은 이해를 허용할 것입니다. 조사관은 잠재적인 치료 실패 또는 약물 내성으로의 전환(원래 방문과 동일한 유전자형)을 다른 사람에 의한 재감염과 구별하기 위해 치료 시험(TOC) 후속 방문에서 유전자형에 대한 T. 바지날리스를 배양하고 이들의 약물 내성을 결정할 것입니다. 접촉 (다른 유전자형). Trichomonas vaginalis 감염은 치료하기가 더 어렵고 T. vaginalis가 지속되어 배양으로 감지할 수 없으며 최대 6개월 후에 다시 나타날 수 있기 때문에 HIV+ 여성에게 특히 중요합니다. 질편모충은 TOC 방문 시 HIV-여성(8%)보다 HIV+ 여성에서 훨씬 더 높은 비율(최대 36%)로 검출되며, 이러한 감염의 대부분은 치료 실패에 기인합니다. 최근 보고서에서는 초기 TOC 음성 결과 이후 3개월 및 6개월 동안 배양된 지속적이고 감지되지 않은 T. vaginalis 감염에 대해 설명합니다. 이는 변종 유전자형과 지속적인 감염의 상관관계가 여러 차례의 TOC 방문, 더 민감한 진단 테스트의 사용, 더 긴 치료 과정이 필요한 HIV+ 개인을 식별할 것이기 때문에 중요합니다.