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인간 장내 마이크로바이옴 구축 중 파지 역학 및 영향 (METAKIDS)

2019년 7월 12일 업데이트: Institut Pasteur
미생물 군집은 인간 환경의 핵심 구성 요소입니다. 결과적으로, 인간 장내 미생물 군집은 박테리아 개체군과 숙주 생리학 사이의 관계에 대한 더 나은 이해를 제공하기 위해 광범위하게 연구되었습니다. 그러나 일반적인 분석은 종, 계통 및 파지와 같은 염색체 외 DNA 분자 측면에서 혼합의 복잡성을 피하는 경향이 있습니다. MetaKids 프로젝트는 숙주의 건강에 장기적인 영향을 미치는 중요한 단계인 인간의 장 형성 과정에서 이러한 개체군과 내부 관계에 대한 새로운 시각을 전례 없는 해상도로 제시하는 것을 목표로 합니다. 이 프로젝트는 연구실에서 개발된 새로운 기술인 Meta3C의 능력에 의존하여 연구자들이 이러한 분자가 경험하는 물리적 충돌 덕분에 탐지하게 될 다양한 파지의 박테리아 숙주 게놈을 식별합니다. 인간 소화관 파지가 숙주 마이크로바이옴의 발달을 형성하는 역할을 할 수 있다는 점을 감안할 때, 이들의 적용 가능성은 큰 관심거리입니다.

연구 개요

상세 설명

지난 10년 동안 인간의 장에 서식하는 미생물의 역할이 집중적으로 연구되었습니다. 장내 미생물에는 박테리아, 바이러스, 곰팡이 및 고세균이 포함됩니다. 인간 건강에 대한 마이크로바이옴의 중요성은 이러한 미생물 군집의 불균형 변화가 비만, 염증성 장 질환, 자가 면역 질환 또는 위장관 암을 포함한 수많은 인간 질병과 관련되어 있다는 관찰에 의해 강조됩니다. 또한 이러한 미생물 중 일부는 면역 체계와 상호 작용하여 면역 체계의 발달에 기여한다는 것이 명확하게 입증되었습니다. 장내 마이크로바이옴은 출생 직후에 형성되며 그 구성은 다음 몇 년 동안 전형적인 '성인과 같은' 박테리아 군집 구조로 변합니다. 역학 연구는 장기적인 건강을 위해 이 기간의 중요성을 입증했습니다. 또한 이 과정은 영양, 항생제 사용 및 기타 환경 요인과 같은 여러 상호 작용 요인에 의해 영향을 받을 수 있는 것으로 나타났습니다. 인간 마이크로바이옴의 바이러스 부분에 대해서는 알려진 바가 훨씬 적습니다. 이들 중 대부분은 포식 또는 박테리아 간의 유전 정보 전달을 통해 미생물 개체군을 조절하는 것으로 알려진 파지(phageome)이며, 장내 미생물군집 형성 및 결과적으로 인간 생리학에 중요한 영향을 미칠 가능성이 있습니다. MetaKids 프로젝트는 인간의 초기 생애 동안 장 파지옴이 어떻게 발달하고 그것이 박테리아 미생물군의 구성에 어떤 영향을 미치는지 이해하는 것을 목표로 합니다. 조사관은 3-9개월에서 24-30개월까지의 15-20명의 유아에 대한 종적 연구를 수행할 것입니다. 최신 metagenomic 방법을 결합하여 다음을 조사할 것입니다. 1) 이 중요한 기간 동안 파지옴과 박테리아 미생물의 구성, 진화 및 역학; 2) 파지와 박테리아 사이의 상호작용과 그들의 관계; 및 3) 파지 개체군에 대한 예방접종 또는 항생제 치료와 같은 환경적 요인의 영향. 이 프로젝트는 실험실에서 개발된 혁신적인 최신 metagenomic 기술의 조합을 기반으로 합니다. DNA는 세포 및 인구 수준에서 "구획화"의 마커로 사용할 수 있는 유비쿼터스 및 안정적인 분자로, 종 혼합의 게놈 구조에 관한 중요한 정보를 제공합니다. 따라서 바이러스 입자의 정제와 3C 관련 방법과 같은 접근 방식을 결합하여 연구자들은 영아 장내 미생물 군집 확립을 특성화하고 이 기간 동안 존재하는 다른 게놈 개체 간의 관계를 해독할 것을 제안합니다. 이 프로젝트는 인간 장의 초기 생애 동안 파지의 역할에 대한 중요한 데이터를 가져올 것입니다. 장내 인구를 수정/제어하기 위한 개입은 역동적인 분야이며 MetaKids 프로젝트는 이 연구 분야에 대한 새로운 시각을 가져올 것입니다.

연구 유형

관찰

등록 (실제)

19

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 장소

    • Essonne
      • Orsay, Essonne, 프랑스, 91400
        • Crèche du Parc
      • Orsay, Essonne, 프랑스, 91400
        • Crèche La Farandole

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

2개월 (어린이)

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

연구 대상 성별

모두

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

프랑스 오르세(Orsay) 마을의 탁아소에 다닐 수 있는 나이이고 생후 9개월 미만인 어린이.

설명

포함 기준:

  1. 일주일에 4일 이상 Orsay 마을에 있는 2개의 시립 보육원(탁아소) 중 하나에 다니는 아동(91, 프랑스);
  2. 탁아소 입소 시점(2017년 8월-10월)에 9개월 미만,
  3. 아동의 연구 참여에 반대하지 않는 부모/법정대리인

제외 기준:

  • 배변훈련;
  • 조산;
  • 약물 사용이 필요한 임상 연구 참여.

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

코호트 및 개입

그룹/코호트
개입 / 치료
어린이들

2017년 8월에서 11월 사이 보육원(크레슈)에 초기 입소 초기에 15~20명의 아동(< 9개월)을 등록합니다.

이 코호트는 최대 36개월 동안 추적됩니다. 대변이 신선한 기저귀는 어린이당 일주일에 한 번 수거한 후 냉동합니다.

부모가 간호사에게 자발적으로 개인 데이케어 정보를 제공하고 각 아동의 일일 일지에 기록하여 연구를 위해 수집합니다. 별도의 면접은 진행하지 않습니다.

신선한 변이 있는 기저귀 수집

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
영아 장 발달 동안 파지 및 박테리아 게놈의 특성화.
기간: 3 년
생후 3년 동안 인간 장에 존재하는 다양한 게놈(파지, 박테리아, 효모)의 게놈 재구성 및 특성화. 이 결과는 DNA 서열의 큰 카탈로그를 제공할 것입니다.
3 년
영아 장 발달 동안 파지 및 박테리아 풍부 및 변이의 특성화
기간: 3 년
생후 3년 동안 인간 장에 존재하는 다양한 종의 변이 특성화. 이 결과는 이 기간 동안 존재하는 다양한 종의 역학에 대한 접근을 제공하고 환경 변화(식이, 연령)와 상호 연관시킬 가능성을 제공합니다.
3 년
파지-박테리아 상호 작용의 특성
기간: 3 년
파지는 박테리아의 주요 포식자이지만 인간의 창자 형성 중 파지는 특성이 잘 규명되지 않은 상태로 남아 있습니다. 이 상호 작용 카탈로그를 통해 인간의 장 발달 과정에서 파지의 역할을 이해할 수 있습니다.
3 년

2차 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
유아 장 발달 중 환경 교란에 대한 파지 및 박테리아 변이의 특성 규명
기간: 2~3주
환경 교란에 대한 반응으로 생후 3년 동안 인간 장에 존재하는 다양한 종의 작은 변이의 특성. 이 결과는 이 기간 동안 존재하는 다양한 종의 역학에 대한 접근과 환경 동요(항생제, 백신, 질병)와 이들을 상호 연관시킬 가능성을 제공할 것입니다.
2~3주

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

스폰서

협력자

수사관

  • 연구 책임자: Martial Marbouty, Institut Pasteur / CNRS

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2017년 9월 5일

기본 완료 (실제)

2018년 12월 31일

연구 완료 (실제)

2018년 12월 31일

연구 등록 날짜

최초 제출

2017년 8월 1일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2017년 9월 27일

처음 게시됨 (실제)

2017년 9월 28일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2019년 7월 16일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2019년 7월 12일

마지막으로 확인됨

2019년 7월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

기타 연구 ID 번호

  • 2016-097
  • ID RCB number : 2017-A00750-53 (다른: French national registration number of the study)

개별 참가자 데이터(IPD) 계획

개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?

아니요

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

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