ヒト腸内微生物叢の確立中のファージのダイナミクスと影響 (METAKIDS)

過去 10 年間、人間の腸に存在する微生物の役割が集中的に研究されてきました。 腸内マイクロバイオームには、細菌、ウイルス、真菌、古細菌が含まれます。 人間の健康に対するマイクロバイオームの重要性は、これらの微生物群集の異常な変化が、肥満、炎症性腸疾患、自己免疫疾患、胃腸がんなど、多くの人間の病気に関連しているという観察によって強調されています。 これらの微生物の一部が免疫系と相互作用し、その発達に寄与することも明確に確立されています. 腸内マイクロバイオームは生後すぐに確立され、その構成は次の数年間でステレオタイプの「大人のような」細菌群集構造に向けて変化します。 疫学的研究は、この期間が長期的な健康にとって重要であることを示しています。 このプロセスは、栄養、抗生物質の使用、その他の環境要因など、複数の相互作用する要因の影響を受ける可能性があることも示されています。 ヒトマイクロバイオームのウイルス部分については、ほとんど知られていません。 それらのほとんどはファージ (ファージオーム) であり、バクテリア間の捕食または遺伝情報の伝達を通じて微生物集団を調節することが知られており、腸内マイクロバイオームの確立、ひいては人間の生理学に重要な影響を与える可能性があります。 MetaKids プロジェクトの目的は、腸のファージオームが人間の初期にどのように発達し、それが細菌マイクロバイオームの組成にどのように影響するかを理解することです。 治験責任医師は、生後 3 ～ 9 か月から 24 ～ 30 か月までの 15 ～ 20 人の乳児の縦断研究を行います。 最新のメタゲノム手法を組み合わせることで、次のことが調査されます。 2) ファージとバクテリアの相互作用とその関係。 3）ファージ集団に対するワクチン接種や抗生物質治療などの環境要因の影響。 このプロジェクトは、研究室で開発された革新的な最近のメタゲノム技術の組み合わせに基づいています。 DNA は、細胞レベルおよび個体群レベルでの「区画化」のマーカーとして使用できるユビキタスで安定した分子であり、混合種のゲノム構造に関する重要な情報を提供します。 したがって、ウイルス粒子の精製や3C関連の方法などのアプローチを組み合わせることにより、研究者は乳児の腸内マイクロバイオームの確立を特徴付け、この期間中に存在するさまざまなゲノムエンティティ間の関係を解読することを提案しています. このプロジェクトは、人間の腸管の初期におけるファージの役割に関する重要なデータをもたらします。 腸の人口を変更/制御するための介入は動的な分野であり、MetaKids プロジェクトはこの研究分野に新しい視点をもたらします。