Dinamiche e influenze dei fagi durante l'istituzione del microbioma intestinale umano (METAKIDS)
12 luglio 2019 aggiornato da: Institut Pasteur
Le comunità microbiche sono componenti chiave dell'ambiente umano.
Di conseguenza, il microbioma intestinale umano è stato ampiamente studiato fornendo una migliore comprensione delle relazioni tra le popolazioni batteriche e la fisiologia dell'ospite.
Tuttavia, un'analisi tipica tende a eludere la complessità delle miscele in termini di specie, ceppi, nonché molecole di DNA extracromosomiche come e fagi.
Il progetto MetaKids mira a portare, con una risoluzione senza precedenti, una nuova visione di quelle popolazioni e delle relazioni interne durante l'insediamento dell'intestino umano, un passaggio cruciale con impatti a lungo termine sulla salute dell'ospite.
Questo progetto si basa sulla capacità di Meta3C, una nuova tecnica sviluppata in laboratorio, di identificare i genomi dell'ospite batterico dei diversi fagi che i ricercatori rileveranno grazie alla collisione fisica che subiscono queste molecole.
Dato il ruolo che i fagi intestinali umani possono svolgere nel modellare lo sviluppo dei microbiomi ospiti, il loro potenziale di applicazione è di grande interesse.
Panoramica dello studio
Stato
Terminato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Nell'ultimo decennio, il ruolo dei microrganismi che risiedono nell'intestino umano è stato intensamente studiato.
Il microbioma intestinale comprende batteri, virus, funghi e archaea.
L'importanza del microbioma per la salute umana è evidenziata dall'osservazione che i cambiamenti disbiotici in queste comunità microbiche sono stati associati a numerose malattie umane, tra cui obesità, disturbi infiammatori intestinali, malattie autoimmuni o cancro gastrointestinale.
È inoltre chiaramente stabilito che alcuni di questi microrganismi interagiscono con il sistema immunitario e contribuiscono al suo sviluppo.
Il microbioma intestinale si stabilisce subito dopo la nascita e la sua composizione cambia nel corso degli anni successivi verso una struttura di comunità batterica stereotipata "simile all'adulto".
Studi epidemiologici hanno dimostrato l'importanza di questo periodo per una salute a lungo termine.
È stato anche dimostrato che questo processo può essere influenzato da molteplici fattori interagenti come l'alimentazione, l'uso di antibiotici e altri fattori ambientali.
Molto meno si sa sulla parte virale del microbioma umano.
La maggior parte di essi sono fagi (fageomi) che sono noti per modulare la popolazione microbica attraverso la predazione o il trasferimento di informazioni genetiche tra batteri e possono avere effetti importanti sull'insediamento del microbioma intestinale e, di conseguenza, sulla fisiologia umana.
Il progetto MetaKids mira a capire come si sviluppa il fageoma intestinale durante la prima infanzia e come influenza la composizione del microbioma batterico.
Gli investigatori condurranno uno studio longitudinale di 15-20 bambini da 3-9 mesi fino all'età di 24-30 mesi.
Combinando i più recenti metodi metagenomici, saranno studiati: 1) la composizione, l'evoluzione e la dinamica del fageoma e del microbioma batterico durante questo periodo critico; 2) le interazioni tra fagi e batteri e le loro relazioni; e 3) l'impatto di fattori ambientali, come vaccinazioni o trattamenti antibiotici sulle popolazioni di fagi.
Il progetto si basa sulla combinazione di innovative tecniche metagenomiche recenti sviluppate in laboratorio.
Il DNA è una molecola ubiquitaria e stabile che può essere utilizzata come marcatore di "compartimentalizzazione" a livello cellulare e di popolazione, fornendo importanti informazioni sulla struttura genomica di un mix di specie.
Pertanto, combinando approcci come la purificazione di particelle virali e metodi correlati a 3C, i ricercatori propongono di caratterizzare l'istituzione del microbioma intestinale infantile e decifrare le relazioni tra le diverse entità genomiche presenti durante questo periodo.
Questo progetto porterà dati cruciali sul ruolo dei fagi durante la prima infanzia del tratto intestinale umano.
L'intervento per modificare/controllare la popolazione intestinale è un campo dinamico e il progetto MetaKids porterà nuove prospettive per quest'area di ricerca.
Tipo di studio
Osservativo
Iscrizione (Effettivo)
19
Contatti e Sedi
Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.
Luoghi di studio
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Essonne
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Orsay, Essonne, Francia, 91400
- Crèche du Parc
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Orsay, Essonne, Francia, 91400
- Crèche La Farandole
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Criteri di partecipazione
I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Da 2 mesi a 9 mesi (BAMBINO)
Accetta volontari sani
Sì
Sessi ammissibili allo studio
Tutto
Metodo di campionamento
Campione non probabilistico
Popolazione di studio
Bambini in età per frequentare una struttura di asilo nido del comune di Orsay (Francia) e di età inferiore a 9 mesi.
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Bambino che frequenta almeno 4 giorni alla settimana uno dei due asili nido comunali della città di Orsay (91, Francia);
- Età inferiore a 9 mesi al momento dell'ingresso al nido (agosto-ottobre 2017);
- Genitore/i/rappresentante legale non contrario alla partecipazione del minore alla ricerca;
Criteri di esclusione:
- Addestramento alla toilette;
- Prematurità;
- Partecipazione a ricerche cliniche che richiedono l'uso di un farmaco.
Piano di studio
Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
|---|---|
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bambini
Iscrizione di 15-20 bambini (<9 mesi) all'inizio anticipato del loro ingresso all'asilo nido (crèche) tra agosto e novembre 2017. Questa coorte sarà seguita per un periodo massimo di 36 mesi. I pannolini con feci fresche verranno raccolti una volta alla settimana per bambino e poi congelati. Per la ricerca saranno raccolte le informazioni personali spontanee fornite dai genitori agli infermieri e registrate nel diario giornaliero di ogni bambino. Non saranno effettuate interviste specifiche. |
raccolta di pannolini con feci fresche
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Caratterizzazione dei genomi di fagi e batteri durante lo sviluppo dell'intestino infantile.
Lasso di tempo: 3 anni
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Ricostruzione genomica e caratterizzazione dei diversi genomi (fagi, batteri, lieviti) presenti nell'intestino umano durante i primi tre anni di vita.
Questi risultati forniranno un ampio catalogo di sequenze di DNA.
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3 anni
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Caratterizzazione dell'abbondanza e delle variazioni di fagi e batteri durante lo sviluppo dell'intestino infantile
Lasso di tempo: 3 anni
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Caratterizzazione della variazione delle diverse specie presenti nell'intestino umano durante i primi 3 anni di vita.
Questi risultati forniranno l'accesso alle dinamiche delle diverse specie presenti durante questo periodo e la possibilità di correlarle con le variazioni ambientali (alimentazione, età)
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3 anni
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Caratterizzazione delle interazioni fagi-batteri
Lasso di tempo: 3 anni
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I fagi sono i principali predatori di batteri, ma il loro ruolo durante l'insediamento dell'intestino umano rimane scarsamente caratterizzato.
Questo catalogo di interazioni permetterà di comprendere il ruolo dei fagi durante lo sviluppo dell'intestino umano
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3 anni
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Caratterizzazione delle variazioni di fagi e batteri in risposta a perturbazioni ambientali durante lo sviluppo dell'intestino infantile
Lasso di tempo: 2 o 3 settimane
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Caratterizzazione delle piccole variazioni delle diverse specie presenti nell'intestino umano durante i primi 3 anni di vita in risposta a perturbazioni ambientali.
Questo risultato fornirà l'accesso alle dinamiche delle diverse specie presenti durante questo periodo e la possibilità di correlarle con perturbazioni ambientali (antibiotico, vaccino, malattia).
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2 o 3 settimane
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Collaboratori e investigatori
Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.
Sponsor
Collaboratori
Investigatori
- Direttore dello studio: Martial Marbouty, Institut Pasteur / CNRS
Studiare le date dei record
Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.
Studia le date principali
Inizio studio (EFFETTIVO)
5 settembre 2017
Completamento primario (EFFETTIVO)
31 dicembre 2018
Completamento dello studio (EFFETTIVO)
31 dicembre 2018
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
1 agosto 2017
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
27 settembre 2017
Primo Inserito (EFFETTIVO)
28 settembre 2017
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (EFFETTIVO)
16 luglio 2019
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
12 luglio 2019
Ultimo verificato
1 luglio 2019
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Altri numeri di identificazione dello studio
- 2016-097
- ID RCB number : 2017-A00750-53 (ALTRO: French national registration number of the study)
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?
NO
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
No
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
No
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