Динамика и влияние фагов на формирование микробиома кишечника человека (METAKIDS)
12 июля 2019 г. обновлено: Institut Pasteur
Микробные сообщества являются ключевыми компонентами окружающей человека среды.
Следовательно, микробиом кишечника человека был тщательно изучен, что позволило лучше понять взаимосвязь между бактериальными популяциями и физиологией хозяина.
Однако типичный анализ имеет тенденцию ускользать от сложности смесей с точки зрения видов, штаммов, а также внехромосомных молекул ДНК, таких как и фаги.
Проект MetaKids направлен на то, чтобы в беспрецедентном разрешении представить новый взгляд на эти популяции и внутренние отношения во время формирования кишечника человека, что является важным шагом с долгосрочными последствиями для здоровья хозяина.
Этот проект основан на способности Meta3C, новой технологии, разработанной в лаборатории, идентифицировать бактериальные геномы-хозяева различных фагов, которые исследователи обнаружат благодаря физическому столкновению этих молекул.
Учитывая роль, которую кишечные фаги человека могут играть в формировании микробиомов хозяина, их потенциал для применения представляет большой интерес.
Обзор исследования
Статус
Прекращено
Вмешательство/лечение
Подробное описание
В последнее десятилетие интенсивно изучается роль микроорганизмов, обитающих в кишечнике человека.
Кишечный микробиом включает бактерии, вирусы, грибы и археи.
Важность микробиома для здоровья человека подчеркивается наблюдением, что дисбиотические сдвиги в этих микробных сообществах связаны с многочисленными заболеваниями человека, включая ожирение, воспалительные заболевания кишечника, аутоиммунные заболевания или рак желудочно-кишечного тракта.
Также четко установлено, что некоторые из этих микроорганизмов взаимодействуют с иммунной системой и способствуют ее развитию.
Кишечный микробиом формируется вскоре после рождения, и его состав меняется в течение следующих нескольких лет в сторону стереотипной структуры «взрослого» бактериального сообщества.
Эпидемиологические исследования продемонстрировали важность этого периода для долгосрочного здоровья.
Также было показано, что на этот процесс могут влиять многочисленные взаимодействующие факторы, такие как питание, использование антибиотиков и другие факторы окружающей среды.
Гораздо меньше известно о вирусной части микробиома человека.
Большинство из них представляют собой фаги (фагомы), которые, как известно, модулируют микробную популяцию посредством хищничества или передачи генетической информации между бактериями и, вероятно, оказывают важное влияние на формирование кишечного микробиома и, следовательно, на физиологию человека.
Проект MetaKids направлен на понимание того, как развивается кишечный фагом в раннем возрасте человека и как он влияет на состав бактериального микробиома.
Исследователи проведут лонгитюдное исследование 15-20 младенцев в возрасте от 3-9 месяцев до возраста 24-30 месяцев.
Комбинируя новейшие метагеномные методы, будут исследованы: 1) состав, эволюция и динамика фагома и бактериального микробиома в этот критический период; 2) взаимодействия между фагами и бактериями и их взаимоотношения; и 3) влияние факторов окружающей среды, таких как вакцинация или лечение антибиотиками, на популяции фагов.
Проект основан на сочетании новейших инновационных метагеномных методов, разработанных в лаборатории.
ДНК - это вездесущая и стабильная молекула, которую можно использовать в качестве маркера «компартментализации» на клеточном и популяционном уровнях, предоставляя важную информацию о геномной структуре смеси видов.
Поэтому, комбинируя такие подходы, как очистка вирусных частиц и методы, связанные с 3C, исследователи предлагают охарактеризовать формирование микробиома кишечника младенцев и расшифровать отношения между различными геномными объектами, присутствующими в этот период.
Этот проект принесет важные данные о роли фагов в раннем периоде жизни желудочно-кишечного тракта человека.
Вмешательство для изменения/контроля кишечной популяции является динамичной областью, и проект MetaKids откроет новые перспективы для этой области исследований.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Действительный)
19
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
Essonne
-
Orsay, Essonne, Франция, 91400
- Crèche du Parc
-
Orsay, Essonne, Франция, 91400
- Crèche La Farandole
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
От 2 месяца до 9 месяцев (РЕБЕНОК)
Принимает здоровых добровольцев
Да
Полы, имеющие право на обучение
Все
Метод выборки
Невероятностная выборка
Исследуемая популяция
Дети, достигшие возраста посещения яслей в структуре дневного пребывания города Орсе (Франция) и в возрасте до 9 месяцев.
Описание
Критерии включения:
- Ребенок посещает не менее 4 дней в неделю один из двух муниципальных детских садов (яслей) в городе Орсе (91 год, Франция);
- Возраст менее 9 месяцев на момент поступления в ясли (август-октябрь 2017 г.);
- Родитель(и)/законный представитель не возражают против участия ребенка в исследовании;
Критерий исключения:
- Приучение к туалету;
- недоношенность;
- Участие в клинических исследованиях, требующих применения лекарственного средства.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
дети
Зачисление от 15 до 20 детей (младше 9 месяцев) в начале их поступления в ясли (ясли) в период с августа по ноябрь 2017 г. За этой когортой будет наблюдаться в течение максимального периода 36 месяцев. Подгузники со свежим стулом будут собираться один раз в неделю для каждого ребенка, а затем замораживаться. Для исследования будет собрана спонтанная информация о дневном уходе, предоставленная родителями медсестрам и записанная в ежедневнике каждого ребенка. Никаких конкретных интервью не будет. |
сбор подгузников со свежим стулом
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Характеристика геномов фагов и бактерий во время развития кишечника младенцев.
Временное ограничение: 3 года
|
Геномная реконструкция и характеристика различных геномов (фагов, бактерий, дрожжей), присутствующих в кишечнике человека в течение трех первых лет жизни.
Эти результаты обеспечат большой каталог последовательностей ДНК.
|
3 года
|
|
Характеристика обилия и вариаций фагов и бактерий в процессе развития кишечника младенцев
Временное ограничение: 3 года
|
Характеристика изменчивости различных видов, присутствующих в кишечнике человека в течение первых 3 лет жизни.
Эти результаты обеспечат доступ к динамике различных видов, присутствующих в этот период, и возможность сопоставить их с изменениями окружающей среды (диета, возраст).
|
3 года
|
|
Характеристика взаимодействия фагов и бактерий
Временное ограничение: 3 года
|
Фаги являются основными хищниками бактерий, но их роль в формировании кишечника человека остается плохо изученной.
Этот каталог взаимодействий позволит понять роль фагов в развитии кишечника человека.
|
3 года
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Характеристика вариаций фагов и бактерий в ответ на возмущения окружающей среды во время развития кишечника младенцев
Временное ограничение: От 2 до 3 недель
|
Характеристика небольших вариаций различных видов, присутствующих в кишечнике человека в течение первых 3 лет жизни в ответ на возмущения окружающей среды.
Этот результат обеспечит доступ к динамике различных видов, присутствующих в этот период, и возможность сопоставить их с возмущениями окружающей среды (антибиотик, вакцина, болезнь).
|
От 2 до 3 недель
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Соавторы
Следователи
- Директор по исследованиям: Martial Marbouty, Institut Pasteur / CNRS
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
5 сентября 2017 г.
Первичное завершение (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
31 декабря 2018 г.
Завершение исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
31 декабря 2018 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
1 августа 2017 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
27 сентября 2017 г.
Первый опубликованный (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
28 сентября 2017 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
16 июля 2019 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
12 июля 2019 г.
Последняя проверка
1 июля 2019 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Другие идентификационные номера исследования
- 2016-097
- ID RCB number : 2017-A00750-53 (ДРУГОЙ: French national registration number of the study)
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕТ
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .