Nanopore 적응형 시퀀싱의 응용
2024년 8월 6일 업데이트: Shenzhen Third People's Hospital
간 이식 후 감염에 Oxford Nanopore 적응형 시퀀싱 방법 적용
간이식 후 감염은 환자 사망의 중요한 요인이다.
간 이식 후 감염을 진단하는 전통적인 방법은 실험실 검사입니다.
그러나 혈액검사의 민감도와 특이도는 좋지 않습니다.
차세대 염기서열 분석(NGS)은 결핵균, 혐기성균, 진균에 대한 검출률이 혈액 검사에 비해 더 높고 민감도도 더 높습니다.
그러나 NGS의 사용은 짧은 읽기 길이로 인해 제한됩니다.
옥스퍼드 나노포어 적응형 시퀀싱(NAS) 방법은 시퀀싱 기술의 세 번째 혁명입니다.
NAS 시퀀싱은 각 1Gbp 데이터에 대해 Nanopore 표준 시퀀싱보다 45배, Illumina 시퀀싱보다 2.5배 더 많은 미생물군집 시퀀스를 감지했습니다.
본 연구의 목적은 NAS와 NGS를 비교하고 간 이식 후 감염 진단율에 대한 실험실 테스트를 수행하는 것입니다.
연구 개요
상세 설명
이전 연구를 바탕으로 연구자들은 다음과 같은 사실을 발견했습니다. 1. NAS는 미생물 농축 효율이 더 높고 NNS(나노포어 일반 시퀀싱)에 비해 병원성 정보를 더 빠르게 감지할 수 있습니다. 2. NAS는 짧은 시간의 서열 분석으로 보다 구체적인 병원체 단편을 검출할 수 있습니다. 3. NAS는 단시간에 NNS보다 더 많은 병원성 게놈을 포괄할 수 있습니다. 4. NAS는 임상검체에서 병원성 세균의 항생제 내성 정보를 검출할 수 있습니다.
연구 유형
관찰
등록 (추정된)
100
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 연락처
- 이름: pusen Wang, Dr
- 전화번호: 18621006138
- 이메일: pusenwang@sjtu.edu.cn
연구 장소
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-
Guangdong
-
Shenzhen, Guangdong, 중국
- Shenzhen Third People's Hospital
-
연락하다:
- Lin Zhong, Dr
- 전화번호: 13917603139
- 이메일: zhonglin1@medmail.com.cn
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 어린이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
아니
샘플링 방법
확률 샘플
연구 인구
참가자는 무작위로 모집되며 프로토콜을 위반하거나 임상적 부작용이 발생한 경우 연구자는 참가자에게 본 연구에서 탈퇴하도록 요청할 것입니다.
설명
포함 기준:
- 간 이식을 수락
- 사전 동의에 자발적으로 서명
- 중요한 정보를 이해하는 능력을 보유하신 분
- 본 연구에 자발적으로 참여
제외 기준:
- 다른 연구에 참여함
- 이식 손실
- 다장기 이식을 받았거나 이전에 장기 이식을 받은 적이 있는 경우
- 환자가 사망함
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
|---|---|
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NAS 그룹
이 그룹에서는 NAS를 이용해 폐포세척액, 혈액, 복막배액 등에서 병원체 수를 검출한다.
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세 가지 다른 탐지 방법을 사용하고 효율성 비교
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NGS 그룹
이 그룹에서는 NGS를 이용해 폐포세척액, 혈액, 복막배액 등에서 병원체 수를 검출한다.
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세 가지 다른 탐지 방법을 사용하고 효율성 비교
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실험실 테스트 그룹
이 그룹에서 연구자들은 실험실 테스트를 통해 폐포 세척액, 혈액 및 복막 배수에서 병원체 수를 검출합니다.
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세 가지 다른 탐지 방법을 사용하고 효율성 비교
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
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간 이식 후 감염 진단
기간: 간이식 후 환자가 병원에서 퇴원하기 전 평균 1개월.
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환자가 퇴원하기 전 평균 1개월 동안 폐포세척액, 복막배액 또는 혈액에서 병원균이 검출됨
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간이식 후 환자가 병원에서 퇴원하기 전 평균 1개월.
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
수사관
- 수석 연구원: Lin Zhong, Dr, Shenzhen Third People's Hospital
간행물 및 유용한 링크
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연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작 (추정된)
2024년 10월 1일
기본 완료 (추정된)
2026년 8월 1일
연구 완료 (추정된)
2026년 10월 30일
연구 등록 날짜
최초 제출
2024년 6월 27일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2024년 8월 6일
처음 게시됨 (실제)
2024년 8월 7일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
2024년 8월 7일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2024년 8월 6일
마지막으로 확인됨
2024년 6월 1일
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- SZSY001
- 2022YFC2304700 (기타 보조금/기금 번호: Ministry of Science and Technology)
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?
아니요
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
아니
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
아니
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