Anwendung der adaptiven Nanoporensequenzierung
6. August 2024 aktualisiert von: Shenzhen Third People's Hospital
Anwendung der adaptiven Sequenzierungsmethode von Oxford Nanopore bei Infektionen nach Lebertransplantation
Eine Infektion nach einer Lebertransplantation ist ein wichtiger Faktor für den Tod von Patienten.
Die traditionelle Methode zur Diagnose einer Infektion nach einer Lebertransplantation sind Labortests.
Die Sensitivität und Spezifität der Blutuntersuchungen ist jedoch gering.
Die Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) bietet im Vergleich zu Bluttests eine höhere Erkennungsrate für Mycobacterium tuberculosis, Anaerobier und Pilze sowie eine höhere Empfindlichkeit.
Aufgrund der kurzen Leselänge ist die Verwendung von NGS jedoch begrenzt.
Die Oxford Nanopore Adaptive Sequencing (NAS)-Methode ist die dritte Revolution in der Sequenzierungstechnologie.
Pro 1 Gbit/s an Daten wurden bei der NAS-Sequenzierung 45-mal mehr Mikrobiomsequenzen erkannt als bei der Nanopore-Standardsequenzierung und 2,5-mal mehr als bei der Illumina-Sequenzierung.
Der Zweck dieser Studie besteht darin, NAS mit NGS und Labortests zur diagnostischen Infektionsrate nach Lebertransplantation zu vergleichen.
Studienübersicht
Status
Noch keine Rekrutierung
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Basierend auf der vorherigen Arbeit stellten die Forscher fest, dass: 1. NAS eine höhere mikrobielle Anreicherungseffizienz aufweist und pathogene Informationen schneller erkennen kann als die normale Sequenzierung von Nanoporen (NNS); 2. NAS kann durch Kurzzeitsequenzierung spezifischere Pathogenfragmente erkennen; 3. NAS kann in kurzer Zeit mehr pathogene Genome abdecken als NNS; 4. NAS kann Informationen zur Antibiotikaresistenz pathogener Bakterien in klinischen Proben erkennen.
Studientyp
Beobachtungs
Einschreibung (Geschätzt)
100
Kontakte und Standorte
Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.
Studienkontakt
- Name: pusen Wang, Dr
- Telefonnummer: 18621006138
- E-Mail: pusenwang@sjtu.edu.cn
Studienorte
-
-
Guangdong
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Shenzhen, Guangdong, China
- Shenzhen Third People's Hospital
-
Kontakt:
- Lin Zhong, Dr
- Telefonnummer: 13917603139
- E-Mail: zhonglin1@medmail.com.cn
-
-
Teilnahmekriterien
Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Kind
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Nein
Probenahmeverfahren
Wahrscheinlichkeitsstichprobe
Studienpopulation
Die Teilnehmer werden nach dem Zufallsprinzip rekrutiert. Wenn sie gegen das Protokoll verstoßen oder klinische unerwünschte Ereignisse auftreten, werden die Prüfer sie auffordern, sich von dieser Studie zurückzuziehen.
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Akzeptieren Sie eine Lebertransplantation
- Unterzeichnung einer freiwilligen Einverständniserklärung
- Die Fähigkeit besitzen, wesentliche Informationen zu verstehen
- Die Teilnahme an dieser Studie ist freiwillig
Ausschlusskriterien:
- Habe an einer anderen Studie teilgenommen
- Transplantatverlust
- Sie haben sich einer Transplantation mehrerer Organe unterzogen oder hatten bereits eine Organtransplantation
- Der Patient ist gestorben
Studienplan
Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
|---|---|
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NAS-Gruppe
In dieser Gruppe ermitteln die Forscher mithilfe von NAS die Anzahl der Krankheitserreger in der Alveolarspülflüssigkeit, im Blut und in der Peritonealdrainage.
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Verwendung von drei verschiedenen Erkennungsmethoden und Vergleich ihrer Effizienz
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NGS-Gruppe
In dieser Gruppe ermitteln die Forscher mithilfe von NGS die Anzahl der Krankheitserreger in der Alveolarspülflüssigkeit, im Blut und in der Peritonealdrainage.
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Verwendung von drei verschiedenen Erkennungsmethoden und Vergleich ihrer Effizienz
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Gruppe „Labortests“.
In dieser Gruppe ermitteln die Forscher die Anzahl der Krankheitserreger in der Alveolarspülflüssigkeit, im Blut und in der Peritonealdrainage mithilfe von Labortests.
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Verwendung von drei verschiedenen Erkennungsmethoden und Vergleich ihrer Effizienz
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Diagnostizierte Infektion nach Lebertransplantation
Zeitfenster: Nach der Lebertransplantation vor der Entlassung des Patienten aus dem Krankenhaus, durchschnittlich 1 Monat.
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Etwaige Krankheitserreger werden in der Alveolarspülflüssigkeit, der Peritonealdrainage oder im Blut nachgewiesen, bevor die Patienten das Krankenhaus verlassen, durchschnittlich einen Monat lang
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Nach der Lebertransplantation vor der Entlassung des Patienten aus dem Krankenhaus, durchschnittlich 1 Monat.
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Mitarbeiter und Ermittler
Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.
Sponsor
Ermittler
- Hauptermittler: Lin Zhong, Dr, Shenzhen Third People's Hospital
Publikationen und hilfreiche Links
Die Bereitstellung dieser Publikationen erfolgt freiwillig durch die für die Eingabe von Informationen über die Studie verantwortliche Person. Diese können sich auf alles beziehen, was mit dem Studium zu tun hat.
Studienaufzeichnungsdaten
Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Geschätzt)
1. Oktober 2024
Primärer Abschluss (Geschätzt)
1. August 2026
Studienabschluss (Geschätzt)
30. Oktober 2026
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
27. Juni 2024
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
6. August 2024
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
7. August 2024
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
7. August 2024
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
6. August 2024
Zuletzt verifiziert
1. Juni 2024
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- SZSY001
- 2022YFC2304700 (Andere Zuschuss-/Finanzierungsnummer: Ministry of Science and Technology)
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?
NEIN
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Nein
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Nein
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