Anvendelse af Nanopore Adaptive Sequencing
6. august 2024 opdateret af: Shenzhen Third People's Hospital
Anvendelse af Oxford Nanopore Adaptive Sequencing Method ved infektion efter levertransplantation
Infektion efter levertransplantation er en vigtig faktor i dødsfald hos patienter.
Den traditionelle metode til diagnosticering af infektion efter levertransplantation er laboratorietests.
Men følsomheden og specificiteten af blodprøver er dårlig.
Næste generations sekventering (NGS) har større påvisningshastighed for mycobacterium tuberculosis, anaerobe og svampe og større følsomhed sammenlignet med blodprøver.
Brugen af NGS er dog begrænset på grund af den korte læselængde.
Oxford nanopore adaptive sekventeringsmetode (NAS) er den tredje revolution inden for sekvenseringsteknologi.
For hver 1 Gbp data detekterede NAS-sekventering 45 gange flere mikrobiomsekvenser end Nanopore-standardsekvensering og 2,5 gange mere end Illumina-sekventering.
Formålet med denne undersøgelse er at sammenligne NAS med NGS og laboratorietests for den diagnostiske infektionsrate efter levertransplantation.
Studieoversigt
Status
Ikke rekrutterer endnu
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Baseret på det tidligere arbejde fandt efterforskerne ud af, at: 1. NAS har en højere mikrobiel berigelseseffektivitet og kan detektere patogen information hurtigere sammenlignet med nanopores normal sekventering (NNS); 2. NAS kan detektere mere specifikke patogenfragmenter med korttidssekventering; 3. NAS kan dække flere patogene genomer end NNS på kort tid; 4. NAS kan detektere information om antibiotikaresistens for patogene bakterier i kliniske prøver.
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Anslået)
100
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiekontakt
- Navn: pusen Wang, Dr
- Telefonnummer: 18621006138
- E-mail: pusenwang@sjtu.edu.cn
Studiesteder
-
-
Guangdong
-
Shenzhen, Guangdong, Kina
- Shenzhen Third People's Hospital
-
Kontakt:
- Lin Zhong, Dr
- Telefonnummer: 13917603139
- E-mail: zhonglin1@medmail.com.cn
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Ingen
Prøveudtagningsmetode
Sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
Deltagerne vil blive rekrutteret tilfældigt, og hvis de overtræder protokollen eller opstår kliniske bivirkninger, vil efterforskerne bede dem om at trække sig fra denne undersøgelse.
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Accepter levertransplantation
- Underskriver frivilligt informeret samtykke
- Besidder evnen til at forstå væsentlig information
- Deltagelse frivilligt i denne undersøgelse
Ekskluderingskriterier:
- Deltog i en anden undersøgelse
- Tab af graft
- Har gennemgået en multiorgantransplantation eller har haft en tidligere organtransplantation
- Patienten døde
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
NAS gruppe
I denne gruppe vil efterforskerne påvise antallet af patogener i alveolær skyllevæske, blod og peritoneal drænage ved at bruge NAS.
|
Brug af tre forskellige detektionsmetoder og sammenligning af deres effektivitet
|
|
NGS gruppe
I denne gruppe vil efterforskerne påvise antallet af patogener i alveolær skyllevæske, blod og peritoneal drænage ved at bruge NGS.
|
Brug af tre forskellige detektionsmetoder og sammenligning af deres effektivitet
|
|
Laboratorietestgruppe
I denne gruppe vil efterforskerne påvise antallet af patogener i alveolær skyllevæske, blod og peritoneal drænage ved hjælp af laboratorietests.
|
Brug af tre forskellige detektionsmetoder og sammenligning af deres effektivitet
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Diagnosticeret infektion efter levertransplantation
Tidsramme: Efter levertransplantation før patienter udskrives fra hospitalet, i gennemsnit 1 måned.
|
Eventuelle patogener påvises i alveolær skyllevæske, peritoneal dræning eller blod før patienter udskrives fra hospitalet, i gennemsnit 1 måned
|
Efter levertransplantation før patienter udskrives fra hospitalet, i gennemsnit 1 måned.
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Sponsor
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Lin Zhong, Dr, Shenzhen Third People's Hospital
Publikationer og nyttige links
Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Anslået)
1. oktober 2024
Primær færdiggørelse (Anslået)
1. august 2026
Studieafslutning (Anslået)
30. oktober 2026
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
27. juni 2024
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
6. august 2024
Først opslået (Faktiske)
7. august 2024
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
7. august 2024
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
6. august 2024
Sidst verificeret
1. juni 2024
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- SZSY001
- 2022YFC2304700 (Andet bevillings-/finansieringsnummer: Ministry of Science and Technology)
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
INGEN
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .